Predicción de péptidos de unión a células eritrocíticas usando herramientas computacionales

En la Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC) existe una estrategia para el diseño de vacunas sintéticas. Ésta se basa en la identificación de fragmentos peptídicos de más o menos 20 aminoácidos provenientes de las proteínas involucradas en la invasión de diferentes patógenos a sus re...

Full description

Autores:: Martínez Rey, Cristian Johanny

Tipo de recurso:

Fecha de publicación:: 2012

Institución:: Universidad Nacional de Colombia

Repositorio:: Universidad Nacional de Colombia

Idioma:: spa

Description
Summary:	En la Fundación Instituto de Inmunología de Colombia (FIDIC) existe una estrategia para el diseño de vacunas sintéticas. Ésta se basa en la identificación de fragmentos peptídicos de más o menos 20 aminoácidos provenientes de las proteínas involucradas en la invasión de diferentes patógenos a sus respectivas células objetivo (hospederas). Se quiere, para una proteína dada, identificar los fragmentos que tengan una alta capacidad de unión específica (del inglés High Activity Binding Peptides, HABP) a células eritrocíticas, sin tener que examinarlos experimentalmente, exclusivamente en cortes de 20 aminoácidos, para de esta manera poder recorrer cada elemento de la cadena como punto de partida para su predicción. Se emplean diferentes herramientas computacionales para intentar predecir los HABP y se utiliza una peptidoteca revisada del resultado experimental de 63 proteínas y un pseudogén, la cual contiene 2483 péptidos debidamente clasificados como HABP o no HABP. Los resultados no permiten aún predecir con precisión un HABP, pero sirven de acercamiento para seguir explorando alternativas computacionales que permitan reducir los tiempos y los costos de las fases experimentales en la elaboración de vacunas sintéticas.

Predicción de péptidos de unión a células eritrocíticas usando herramientas computacionales

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