Characterization of Architectural Distortion in Mammograms

En Mamografía suele evaluarse la presencia o posibilidad de cáncer de seno mediante signos como calcificaciones, masas, asimetría bilateral y distorsión arquitectural, este último de difícil identicación debido a la compleja distribución de los tejidos en la mama, siendo frecuentemente pasado por al...

Full description

Autores:
Alvarez Triana, Jorge Andres
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2016
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/56430
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/56430
http://bdigital.unal.edu.co/52189/
Palabra clave:
61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health
62 Ingeniería y operaciones afines / Engineering
Mamografía
mammography
Distorsión arquitectural
Cáncer de seno
Centralidad de autovector
Arqchitectural distortion
Breast cancer
Carcinoma
Eigenvector centrality
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openAccess
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Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
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description En Mamografía suele evaluarse la presencia o posibilidad de cáncer de seno mediante signos como calcificaciones, masas, asimetría bilateral y distorsión arquitectural, este último de difícil identicación debido a la compleja distribución de los tejidos en la mama, siendo frecuentemente pasado por alto. La distorsión arquitectural se caracteriza por un patrón espiculado que define la malignidad de la lesión. Muchos de los trabajos realizados para caracterizar la distorsión arquitectural llevan la imagen entera a otro espacio en donde los patrones pueden ser discriminados. En esta tesis se presenta un método novedoso que utiliza información en el espacio de la imagen, en la cual primero se seleccionan manualmente las regiones de interes que son pre procesadas para mejorar sus detalles visuales. Después, la caracterización de la AD se realiza mediante la representación lineal de la saliencia en las regiones de interes (ROI) como un gráfo cuyos nodos corresponden a los píxeles a lo largo del borde de la ROI y cuyos arcos corresponden a las integrales de intensidad a lo largo de la ruta de conexión de cualquier par de nodos. Un conjunto de vectores propios obtenido de la matriz de adyacencia se utiliza para extraer coeficientes discriminantes que representen aquellos nodos con las íneas mas sobresalientes. Una reducción de dimensionalidad se logra adicionalmente mediante la selección del par de nodos con mayor contribución para cada uno de los vectores propios calculados. El conjunto de las líneas principales sobresalientes se ensambla como un vector de características que se introduce a una Maquína de soporte vectorial (SVM). Los resultados experimentales se realizan con dos bases de datos de referencia, el cojunto de datos MIAS y la base de datos DDSM, demostrando que el método propuesto tiene un buen desempeño en términos de precisión y sensibilidad. El enfoque se evaluó con un conjunto de 246 ROI extraidas de la base DDSM (123 normales y 123 controles) y un conjunto de 38 ROI de la base de datos MINIMIAS (19 normales y 19 controles), respectivamente. Los resultados de la clasificación mostraron respectivamente, tanto para ambas bases de datos una precisión del 89,02% y el 86,89 %, una sensibilidad del 85,37% y el 84,21 %, y una tasa de especificidad del 92,68% y 89,47 % respectivamente.
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Muchos de los trabajos realizados para caracterizar la distorsión arquitectural llevan la imagen entera a otro espacio en donde los patrones pueden ser discriminados. En esta tesis se presenta un método novedoso que utiliza información en el espacio de la imagen, en la cual primero se seleccionan manualmente las regiones de interes que son pre procesadas para mejorar sus detalles visuales. Después, la caracterización de la AD se realiza mediante la representación lineal de la saliencia en las regiones de interes (ROI) como un gráfo cuyos nodos corresponden a los píxeles a lo largo del borde de la ROI y cuyos arcos corresponden a las integrales de intensidad a lo largo de la ruta de conexión de cualquier par de nodos. Un conjunto de vectores propios obtenido de la matriz de adyacencia se utiliza para extraer coeficientes discriminantes que representen aquellos nodos con las íneas mas sobresalientes. Una reducción de dimensionalidad se logra adicionalmente mediante la selección del par de nodos con mayor contribución para cada uno de los vectores propios calculados. El conjunto de las líneas principales sobresalientes se ensambla como un vector de características que se introduce a una Maquína de soporte vectorial (SVM). Los resultados experimentales se realizan con dos bases de datos de referencia, el cojunto de datos MIAS y la base de datos DDSM, demostrando que el método propuesto tiene un buen desempeño en términos de precisión y sensibilidad. El enfoque se evaluó con un conjunto de 246 ROI extraidas de la base DDSM (123 normales y 123 controles) y un conjunto de 38 ROI de la base de datos MINIMIAS (19 normales y 19 controles), respectivamente. Los resultados de la clasificación mostraron respectivamente, tanto para ambas bases de datos una precisión del 89,02% y el 86,89 %, una sensibilidad del 85,37% y el 84,21 %, y una tasa de especificidad del 92,68% y 89,47 % respectivamente.Abstract. In mammography is usually evaluated the presence or possibility of breast cancer by using signs such as calcifications, masses, bilateral asymmetry and architectural distortion, being commonly overlooked. The architectural distortion is characterized by spiculated patterns that define the disease malignancy level, making it difficult to identify by such complex distribution of breast tissues. Most of existing methods characterize the architectural distortion by transforming the entire image to an alternative space, in which such complex patterns may be discriminated. In this thesis, we present a novel method that uses information in the image space, in which a region of interest is firstly selected to be preprocessed to enhance visual details. Afterward AD characterization is done by representing the linear saliency in mammography Regions of Interest (ROI) as a graph whose nodes correspond to those pixels along the ROI boundary and whose edges stand for the line intensity integrals along the path connecting any pair of nodes. A set of eigen-vectors from the adjacency matrix is then used to extract discriminant coefficients that represents those nodes with higher salient lines. A dimensionality reduction is further accomplished by selecting the pair of nodes with major contribution for each of the computed eigen-vectors. The set of main salient lines is then assembled as a feature vector that inputs a conventional Supported Vector Machine (SVM). Experimental results with two benchmark databases, the MIAS and DDSM database, demonstrate the proposed method performs well in terms of accuracy. The approach was evaluated with a set of 246 ROI extracted from the DDSM (123 normal and 123 AD) and a set of 38 ROI from the MINIMIAS collections (19 normal and 19 AD) respectively. The classification results showed respectively for both databases an accuracy rate of 89,02% and 86,89 %, a sensitivity rate of 85.37% and 84,21 %, and a specificity rate of 92.68% and 89,47 %.Maestríaapplication/pdfspahttp://www.journals.elsevier.com/computerized-medical-imaging-and-graphicsUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Medicina Instituto de Investigaciones BiomédicasInstituto de Investigaciones BiomédicasAlvarez Triana, Jorge Andres (2016) Characterization of Architectural Distortion in Mammograms. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health62 Ingeniería y operaciones afines / EngineeringMamografíamammographyDistorsión arquitecturalCáncer de senoCentralidad de autovectorArqchitectural distortionBreast cancerCarcinomaEigenvector centralityCharacterization of Architectural Distortion in MammogramsTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINALjorgeandresalvareztriana.2015.pdfapplication/pdf18469326https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/56430/1/jorgeandresalvareztriana.2015.pdf6cc19949196a39efc44bf720bd6a5d2fMD51THUMBNAILjorgeandresalvareztriana.2015.pdf.jpgjorgeandresalvareztriana.2015.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3966https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/56430/2/jorgeandresalvareztriana.2015.pdf.jpg5774722f38a24fd5a9c50e05e0c7999dMD52unal/56430oai:repositorio.unal.edu.co:unal/564302024-03-22 23:09:00.058Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co