Conservation genetics of the largest captive population of the critically endangered Orinoco crocodile (Crocodylus intermedius): a contribution for its survival

ilustraciones, fotografías, gráficas, tablas

Autores:
Saldarriaga Gómez, Ana María
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2021
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
eng
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/80488
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/80488
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Palabra clave:
570 - Biología::576 - Genética y evolución
Potencial evolutivo
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Variabilidad genética
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openAccess
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Ardila-Robayo M.C., Martínez-Barreto W., Suárez-Daza R.M., & Moreno-Torres C.A. 2010. La Estación Roberto Franco (EBTRF) y el Cocodrilo Del Orinoco en Colombia: contribución a su biología y conservación. Revista Latinoamericana de Conservación 1(2): 120- 130.
Bertorelle G., Bruford M., Hauffe H., Rizzoli A., & Vernesi C. 2009. Population Genetics for Animal Conservation (Conservation Biology). Cambridge: Cambridge University Press.
Caldwell J. 2017. World trade in crocodilian skins 2013-2015. In Prepared as part of the International alligator and crocodile trade study (p. 32). Cambridge, UK: UNEP-WCMC.
Castro-Casal A., Merchán Fornelino M., Garcés Restrepo M. F., Cárdenas Torres M. A., Gómez Velasco F. 2013. Uso histórico y actual del caimán llanero (Crocodylus intermedius) en la Orinoquia (Colombia-Venezuela). Biota Colombiana 14(1), 65-82.
Castro A., Merchán M., Garcés M., Cárdenas M., Gómez F. 2012. New data on the conservation status of the Orinoco crocodile (Crocodylus intermedius) in Colombia. Pp.: 65-73. In: Crocodiles. Proceedings of the 21st Working Meeting of the IUCN-SSC Crocodile Specialist Group. IUCN: Gland, Switzerland. 256 pp.
Cuervo-Alarcón L.C. 2010. Caracterización genética de la población ex-situ de Crocodylus intermedius presente en Colombia (Tesis de Maestría). Departamento de Biología, Universidad Nacional de Colombia, Sede Bogotá
Cuervo-Alarcón L.C., Burbano-Montenegro C. 2012. Caracterización genética de la población ex-situ de Crocodylus intermedius presente en Colombia. Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales 36:373–383.
Frankham R. 2008. Genetic adaptation to captivity in species conservation programs. Molecular Ecology 17:325–333.
Frankham R., Ballou J. D., Briscoe D. A. 2007. Introduction to conservation genetics. 2d ed. Cambridge University Press, Cambridge, United Kingdom.
Gautschi B., Jacob G., Negro J.J., Godoy J.A., Muller J.P., Schmid B. 2003. Analysis of relatedness and determination of the source of founders in the captive bearded vulture, Gypaetus barbatus population. Conservation Genetics 4:479–490.
Gonçalves da Silva A., Lalonde D. R., Quse V., Shoemaker A., Russello M.A. 2010. Genetic Approaches Refine Ex-situ Lowland Tapir (Tapirus terrestris) Conservation, Journal of Heredity 101(5), 581–590.
IUCN 2020. The IUCN Red List of Threatened Species. Version 2020-3.
Karsten M., van Vuuren B. J., Goodman P., Barnaud A. 2011. The history and management of black rhino in KwaZulu-Natal: a population genetic approach to assess the past and guide the future. Animal Conservation, 14(4), 363–370.
Lafferriere R., Antelo R., Alda F., Mårtensson D., Hailer F., Castroviejo-Fisher S., Amato, G. 2016. Multiple Paternity in a Reintroduced Population of the Orinoco Crocodile (Crocodylus intermedius) at the El Frío Biological Station, Venezuela. PLOS ONE, 11(3).
Lapbenjakul S., Thapana W., Twilprawat P., Muangmai N., Kanchanaketu T., Temsiripong Y., Srikulnath K. 2017. High genetic diversity and demographic history of captive Siamese and Saltwater crocodiles suggest the first step toward the establishment of a breeding and reintroduction program in Thailand. PLOS ONE, 12(9).
Lugo L.M. 1995. Cría del caimán del Orinoco (Crocodylus intermedius) en la estación de biología tropical “Roberto Franco”, Villavicencio, Meta. Revista de la Academia Colombiana de Ciencias XIX 74: 601–606
Maldonado A. A., & Ardila-Robayo M. C. 2004. Evaluación del manejo de la población ex-situ del Caimán llanero o Cocodrilo del Orinoco, Crocodylus intermedius (Graves 1819) en Colombia. Acta Biológica Colombiana, 9(2), 81
Medem F. 1981. Los Crocodylia de Sur América. Los Crocodylia de Colombia. Vol. I. Ministerio de Educación Nacional. Colciencias. Bogotá, 354 pp.
Medem F. 1983. Los Crocodylia de Sur América.Vol. II. Universidad Nacional de Colombia. Colciencias. Bogotá, 270 pp.
MINISTERIO DE MEDIO AMBIENTE. 2002. Programa Nacional para la Conservación del Caimán Llanero. Ministerio del Ambiente Dirección general de ecosistemas subdirección de fauna. Santafé de Bogotá, Colombia.
Morales-Betancourt M. A., Lasso C. A., De La Ossa J. V. Fajardo-Patiño A (editores). 2013. VIII. Biología y conservación de los Crocodylia de Colombia. Serie Editorial Recursos Hidrobiológicos y Pesqueros Continentales de Colombia. Instituto de Investigación de los Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH). 336 pp.
Posso-Peláez C., Ibáñez C., and Bloor P. 2018. Low Mitochondrial DNA Variability in the Captive Breeding Population of the Critically Endangered Orinoco Crocodile (Crocodylus intermedius) from Colombia. Herpetological Conservation and Biology, 13 (2): 347–354.
Primack R. B. 2002. Essentials of Conservation Biology, 3rd ed. Sunderland: Sinauer Associates.
Recino-Reyes E. B., Lesher-Gordillo J. M., Machkour-M’Rabet S., Gallardo-Alvarez M. I., Zenteno-Ruiz C. E., Olivera-Gómez L. D., Valdés-Marín A., Gómez-Carrasco G., Ríos-Rodas L., Barragán-Vázquez M. del R., & Martínez R. H. 2020. Conservation and Management of Trachemys venusta venusta in Southern Mexico: A Genetic Approach. Tropical Conservation Science.
Rodriguez D., Forstner M.R., Moler P.E., Wasilewski J.A., Cherkiss M.S., Densmore L.D. 2011. Effect of human-mediated migration and hybridization on the recovery of the American crocodile in Florida (USA). Conservation Genetics 12:449–459.
Roques S., Chancere, E., Boury C., Pierre M., Acolas M‐L. 2019. From microsatellites to single nucleotide polymorphisms for the genetic monitoring of a critically endangered sturgeon. Ecological Evolution 9: 7017– 7029.
Russello A. & Amato G. 2004. Ex-situ population management in the absence of pedigree information. Molecular Ecology 13:2829–2840.
Somaweera R., Brien M. L., Platt S. G., Manolis C., Webber B. L. 2018. Direct and indirect interactions with vegetation shape crocodylian ecology at multiple scales. Freshwater Biology 64(2):257-268.
Spitzweg C., Praschag P., DiRuzzo S., & Fritz U. 2018. Conservation genetics of the northern river terrapin (Batagur baska) breeding project using a microsatellite marker system. Salamandra 54(1): 63–70
Thorbjarnarson J. B. 1987. Status, ecology and conservation of the Orinoco crocodile. Preliminary Report. FUDENA-WWF. Caracas, 74 pp.
United Nations. 1992. Environment and Development (Terminology bulletin: 344). United Nations, New York, USA.
Weaver J. P., Rodriguez D., Venegas-Anaya M., Cedeño-Vázquez J. R., Forstner M. R. J., Densmore L. D. 2008. Genetic characterization of captive Cuban crocodiles (Crocodylus rhombifer) and evidence of hybridization with the American crocodile (Crocodylus acutus). Journal of Experimental Zoology Part A: Ecological Genetics and Physiology, 309 A (10), 649–660.
Witzenberger K.A., & Hochkirch A. 2011. Ex-situ conservation genetics: a review of molecular studies on the genetic consequences of captive breeding programs for endangered animal species. Biodiversity and Conservation, 20, 1843-1861.
Witzenberger K.A., & Hochkirch A. 2013. Evaluating ex-situ conservation projects: Genetic structure of the captive population of the Arabian sand cat. Mammalian Biology 78 (5), 379–382.
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If management is based only on recorded pedigrees, information may be incomplete or inaccurate and may lead to an underestimation of relatedness. Incorrect management actions can alter the viability of reintroductions due to the loss of genetic diversity and genetic depression of the source population. In this Master thesis, we used a 17 microsatellite loci system to characterize the extent of the genetic variation of the biggest ex-situ population of the critically endangered Crocodylus intermedius in Colombia in charge of the Roberto Franco Tropical Biology Station (EBTRF) aiming at proposing management guidelines and at assessing past and future reintroductions. In Chapter 1 we compared genetic indexes of the Founder and Alive populations and we found that the living crocodiles maintain much of the founder diversity, high levels of heterozygosity, and a low overall inbreeding. In Chapter 2 we developed a powerful tool that combined information of relatedness, individual diversity, age, sex, size, and location of the living crocodiles that allowed us to build combinations of individuals to plan future breeding groups that maximize the population´s genetic diversity. We propose different reproductive nuclei, and we demonstrate that molecular data can be used to improve the management of the program, well beyond of what can be achieved with pedigree information alone. To provide insights on the genetic component of the released individuals and to suggest the improvement of crocodile’s reintroductions, in Chapter 3 we evaluated the genetic composition of four groups of crocodiles already reintroduced and of juveniles to be released. We propose that in the short term, reintroductions should only be carried out in places where it is certain that the populations have become completely extinct. In case the species is present before implementing reintroduction measures it is necessary to accurately assess its genetic profile and situation as well as to estimate population size.En el último siglo ha habido un aumento en el número de especies amenazadas y la conservación a través de programas de cría en cautiverio se ha vuelto crucial para su supervivencia. Una de las principales consideraciones para el diseño de programas de reproducción es la preservación de la variabilidad genética que proporciona la materia prima para la adaptación. Si el manejo se basa solo en los pedigrí registrados, la información puede estar incompleta o inexacta y puede llevar a una subestimación de las relaciones de parentesco. Las acciones de manejo incorrectas pueden alterar la viabilidad de las reintroducciones debido a la pérdida de diversidad y depresión genética de la población de origen. En esta tesis de Maestría, utilizamos un sistema de 17 loci de microsatélites para caracterizar la variación genética de la mayor población ex-situ del críticamente amenazado Crocodylus intermedius en Colombia a cargo de la Estación de Biología Tropical Roberto Franco (EBTRF) con el objetivo de proponer pautas de manejo y evaluar reintroducciones pasadas y futuras. En el Capítulo 1 comparamos los índices genéticos de las poblaciones Fundadora y Viva y encontramos que los cocodrilos vivos mantienen gran parte de la diversidad fundadora, altos niveles de heterocigosidad y una baja consanguinidad. En el Capítulo 2 desarrollamos una poderosa herramienta que combina información de parentesco, diversidad individual, edad, sexo, tamaño y ubicación de los cocodrilos vivos por medio de la cual construimos combinaciones de individuos para planificar futuros grupos reproductores que maximicen la diversidad genética de la población. Proponemos diferentes núcleos reproductivos y demostramos que los datos moleculares pueden ser utilizados para mejorar la gestión del programa mucho más allá de lo que se puede lograr solo con la información del pedigrí. Para proporcionar información sobre el componente genético de los individuos liberados y sugerir mejoras en las reintroducciones, en el Capítulo 3 evaluamos la composición genética de cuatro grupos de cocodrilos reintroducidos y de los juveniles que serán liberados. Proponemos que, a corto plazo, las reintroducciones solo se realicen en lugares donde se tenga la certeza de que las poblaciones se han extinguido por completo. En caso de que la especie esté presente, antes de implementar medidas de reintroducción, es necesario evaluar con precisión su perfil genético y su situación, así como estimar el tamaño de la población. (Texto tomado de la fuente)MaestríaMagíster en Ciencias - BiologíaGenética de la conservación98 páginasapplication/pdfengUniversidad Nacional de ColombiaBogotá - Ciencias - Maestría en Ciencias - BiologíaDepartamento de BiologíaFacultad de CienciasBogotá, ColombiaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá570 - Biología::576 - Genética y evoluciónPotencial evolutivoCría en cautividadDiversidad individualReintroducciónMicrosatélitesVariabilidad genéticaMicrosatellitesGenetic variabilityEvolutionary potentialCaptive breedingIndividual diversityReintroductionAnimales en vías de extinciónEndangered speciesGenética animalAnimal geneticsConservation genetics of the largest captive population of the critically endangered Orinoco crocodile (Crocodylus intermedius): a contribution for its survivalGenética de la conservación de la mayor población cautiva del críticamente amenazado caimán del Orinoco (Crocodylus intermedius): una contribución para su supervivenciaTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMColombiaOrinocoAntelo R. 2008. Biología del caimán llanero o cocodrilo del Orinoco (Crocodylus intermedius) en la Estación Biológica El Frío, Estado Apure, Venezuela (Tesis Doctoral). Departamento de Ecología. Universidad Autónoma de Madrid, Madrid, 286 ppArdila-Robayo M.C., Martínez-Barreto W., Suárez-Daza R.M., & Moreno-Torres C.A. 2010. La Estación Roberto Franco (EBTRF) y el Cocodrilo Del Orinoco en Colombia: contribución a su biología y conservación. Revista Latinoamericana de Conservación 1(2): 120- 130.Bertorelle G., Bruford M., Hauffe H., Rizzoli A., & Vernesi C. 2009. Population Genetics for Animal Conservation (Conservation Biology). Cambridge: Cambridge University Press.Caldwell J. 2017. World trade in crocodilian skins 2013-2015. In Prepared as part of the International alligator and crocodile trade study (p. 32). Cambridge, UK: UNEP-WCMC.Castro-Casal A., Merchán Fornelino M., Garcés Restrepo M. F., Cárdenas Torres M. A., Gómez Velasco F. 2013. Uso histórico y actual del caimán llanero (Crocodylus intermedius) en la Orinoquia (Colombia-Venezuela). Biota Colombiana 14(1), 65-82.Castro A., Merchán M., Garcés M., Cárdenas M., Gómez F. 2012. New data on the conservation status of the Orinoco crocodile (Crocodylus intermedius) in Colombia. Pp.: 65-73. In: Crocodiles. Proceedings of the 21st Working Meeting of the IUCN-SSC Crocodile Specialist Group. IUCN: Gland, Switzerland. 256 pp.Cuervo-Alarcón L.C. 2010. Caracterización genética de la población ex-situ de Crocodylus intermedius presente en Colombia (Tesis de Maestría). Departamento de Biología, Universidad Nacional de Colombia, Sede BogotáCuervo-Alarcón L.C., Burbano-Montenegro C. 2012. Caracterización genética de la población ex-situ de Crocodylus intermedius presente en Colombia. Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales 36:373–383.Frankham R. 2008. Genetic adaptation to captivity in species conservation programs. Molecular Ecology 17:325–333.Frankham R., Ballou J. D., Briscoe D. A. 2007. Introduction to conservation genetics. 2d ed. Cambridge University Press, Cambridge, United Kingdom.Gautschi B., Jacob G., Negro J.J., Godoy J.A., Muller J.P., Schmid B. 2003. Analysis of relatedness and determination of the source of founders in the captive bearded vulture, Gypaetus barbatus population. Conservation Genetics 4:479–490.Gonçalves da Silva A., Lalonde D. R., Quse V., Shoemaker A., Russello M.A. 2010. Genetic Approaches Refine Ex-situ Lowland Tapir (Tapirus terrestris) Conservation, Journal of Heredity 101(5), 581–590.IUCN 2020. The IUCN Red List of Threatened Species. Version 2020-3.Karsten M., van Vuuren B. J., Goodman P., Barnaud A. 2011. The history and management of black rhino in KwaZulu-Natal: a population genetic approach to assess the past and guide the future. Animal Conservation, 14(4), 363–370.Lafferriere R., Antelo R., Alda F., Mårtensson D., Hailer F., Castroviejo-Fisher S., Amato, G. 2016. Multiple Paternity in a Reintroduced Population of the Orinoco Crocodile (Crocodylus intermedius) at the El Frío Biological Station, Venezuela. PLOS ONE, 11(3).Lapbenjakul S., Thapana W., Twilprawat P., Muangmai N., Kanchanaketu T., Temsiripong Y., Srikulnath K. 2017. High genetic diversity and demographic history of captive Siamese and Saltwater crocodiles suggest the first step toward the establishment of a breeding and reintroduction program in Thailand. PLOS ONE, 12(9).Lugo L.M. 1995. Cría del caimán del Orinoco (Crocodylus intermedius) en la estación de biología tropical “Roberto Franco”, Villavicencio, Meta. Revista de la Academia Colombiana de Ciencias XIX 74: 601–606Maldonado A. A., & Ardila-Robayo M. C. 2004. Evaluación del manejo de la población ex-situ del Caimán llanero o Cocodrilo del Orinoco, Crocodylus intermedius (Graves 1819) en Colombia. Acta Biológica Colombiana, 9(2), 81Medem F. 1981. Los Crocodylia de Sur América. Los Crocodylia de Colombia. Vol. I. Ministerio de Educación Nacional. Colciencias. Bogotá, 354 pp.Medem F. 1983. Los Crocodylia de Sur América.Vol. II. Universidad Nacional de Colombia. Colciencias. Bogotá, 270 pp.MINISTERIO DE MEDIO AMBIENTE. 2002. Programa Nacional para la Conservación del Caimán Llanero. Ministerio del Ambiente Dirección general de ecosistemas subdirección de fauna. Santafé de Bogotá, Colombia.Morales-Betancourt M. A., Lasso C. A., De La Ossa J. V. Fajardo-Patiño A (editores). 2013. VIII. Biología y conservación de los Crocodylia de Colombia. Serie Editorial Recursos Hidrobiológicos y Pesqueros Continentales de Colombia. Instituto de Investigación de los Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH). 336 pp.Posso-Peláez C., Ibáñez C., and Bloor P. 2018. Low Mitochondrial DNA Variability in the Captive Breeding Population of the Critically Endangered Orinoco Crocodile (Crocodylus intermedius) from Colombia. Herpetological Conservation and Biology, 13 (2): 347–354.Primack R. B. 2002. Essentials of Conservation Biology, 3rd ed. Sunderland: Sinauer Associates.Recino-Reyes E. B., Lesher-Gordillo J. M., Machkour-M’Rabet S., Gallardo-Alvarez M. I., Zenteno-Ruiz C. E., Olivera-Gómez L. D., Valdés-Marín A., Gómez-Carrasco G., Ríos-Rodas L., Barragán-Vázquez M. del R., & Martínez R. H. 2020. Conservation and Management of Trachemys venusta venusta in Southern Mexico: A Genetic Approach. Tropical Conservation Science.Rodriguez D., Forstner M.R., Moler P.E., Wasilewski J.A., Cherkiss M.S., Densmore L.D. 2011. Effect of human-mediated migration and hybridization on the recovery of the American crocodile in Florida (USA). Conservation Genetics 12:449–459.Roques S., Chancere, E., Boury C., Pierre M., Acolas M‐L. 2019. From microsatellites to single nucleotide polymorphisms for the genetic monitoring of a critically endangered sturgeon. Ecological Evolution 9: 7017– 7029.Russello A. & Amato G. 2004. Ex-situ population management in the absence of pedigree information. Molecular Ecology 13:2829–2840.Somaweera R., Brien M. L., Platt S. G., Manolis C., Webber B. L. 2018. Direct and indirect interactions with vegetation shape crocodylian ecology at multiple scales. Freshwater Biology 64(2):257-268.Spitzweg C., Praschag P., DiRuzzo S., & Fritz U. 2018. Conservation genetics of the northern river terrapin (Batagur baska) breeding project using a microsatellite marker system. Salamandra 54(1): 63–70Thorbjarnarson J. B. 1987. Status, ecology and conservation of the Orinoco crocodile. Preliminary Report. FUDENA-WWF. Caracas, 74 pp.United Nations. 1992. Environment and Development (Terminology bulletin: 344). United Nations, New York, USA.Weaver J. P., Rodriguez D., Venegas-Anaya M., Cedeño-Vázquez J. R., Forstner M. R. J., Densmore L. D. 2008. Genetic characterization of captive Cuban crocodiles (Crocodylus rhombifer) and evidence of hybridization with the American crocodile (Crocodylus acutus). Journal of Experimental Zoology Part A: Ecological Genetics and Physiology, 309 A (10), 649–660.Witzenberger K.A., & Hochkirch A. 2011. Ex-situ conservation genetics: a review of molecular studies on the genetic consequences of captive breeding programs for endangered animal species. Biodiversity and Conservation, 20, 1843-1861.Witzenberger K.A., & Hochkirch A. 2013. Evaluating ex-situ conservation projects: Genetic structure of the captive population of the Arabian sand cat. Mammalian Biology 78 (5), 379–382.CormacarenaVicerrectoría de Investigación UNEstudiantesInvestigadoresPúblico generalORIGINAL1018486389.2021.pdf1018486389.2021.pdfTesis de Maestría en Ciencias - Biologíaapplication/pdf1866654https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/80488/8/1018486389.2021.pdf95e12e925f9837df79262ab08b7b5840MD58Chapter 2. Table S1. Priority crocodiles.xlsxChapter 2. Table S1. Priority crocodiles.xlsxAnexo 1application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet15452https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/80488/3/Chapter%202.%20Table%20S1.%20Priority%20crocodiles.xlsx0fbb0de17dbb9a7d8d4a7f2baacd632fMD53Chapter 2. Table S2. Dynamic table.xlsxChapter 2. Table S2. Dynamic table.xlsxAnexo 2application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet24629707https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/80488/4/Chapter%202.%20Table%20S2.%20Dynamic%20table.xlsx81482ec6c825c26f867f9b039df18d6dMD54Chapter 3. Table S1 Relatedness coefficient within the crocodile’s potential to release.xlsxChapter 3. Table S1 Relatedness coefficient within the crocodile’s potential to release.xlsxAnexo 3application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet22107https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/80488/5/Chapter%203.%20Table%20S1%20Relatedness%20coefficient%20within%20the%20crocodile%e2%80%99s%20potential%20to%20release.xlsxf0af35cf0aa2772c6a7fc7d880ce767bMD55Chapter 3. Table S2 Genotypes for the 59 potential juvenile crocodiles for release.xlsxChapter 3. Table S2 Genotypes for the 59 potential juvenile crocodiles for release.xlsxAnexo 4application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet23808https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/80488/6/Chapter%203.%20Table%20S2%20Genotypes%20for%20the%2059%20potential%20juvenile%20crocodiles%20for%20release.xlsx17fbb83281aa5098c6ae580c102c8d39MD56LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-83964https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/80488/7/license.txtcccfe52f796b7c63423298c2d3365fc6MD57THUMBNAIL1018486389.2021.pdf.jpg1018486389.2021.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4333https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/80488/9/1018486389.2021.pdf.jpg6242c2d1bdce302d339b2320a1ded539MD59unal/80488oai:repositorio.unal.edu.co:unal/804882024-07-31 23:13:08.742Repositorio Institucional Universidad Nacional de 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