Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia

Colletotrichum lindemuthianum, agente causal de la antracnosis del frijol, es uno de los patógenos más limitantes en la producción de este cultivo. La detección y correcta identificación de este hongo resulta fundamental para el manejo de la enfermedad, siendo las pruebas moleculares alternativas rá...

Full description

Autores:
Martínez Pacheco, Leonardo
Vanegas Berrouet, Katherin Maritza
Salazar Yepes, Mauricio Alberto
Gutiérrez Sánchez, Pablo Andrés
Marín Montoya, Mauricio Alejandro
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2014
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/48991
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/48991
http://bdigital.unal.edu.co/42448/
Palabra clave:
6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Agronomía
Protección de cultivos
fitopatologia
sanidad vegetal
ADN ribosomal
Antracnosis
Permeasa de hierro
Phaseolus vulgaris
RFLPs
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_ce43bdca9413cf712af909e4fc55bdab
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/48991
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia
title Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia
spellingShingle Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia
6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Agronomía
Protección de cultivos
fitopatologia
sanidad vegetal
ADN ribosomal
Antracnosis
Permeasa de hierro
Phaseolus vulgaris
RFLPs
title_short Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia
title_full Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia
title_fullStr Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia
title_full_unstemmed Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia
title_sort Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia
dc.creator.fl_str_mv Martínez Pacheco, Leonardo
Vanegas Berrouet, Katherin Maritza
Salazar Yepes, Mauricio Alberto
Gutiérrez Sánchez, Pablo Andrés
Marín Montoya, Mauricio Alejandro
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Martínez Pacheco, Leonardo
Vanegas Berrouet, Katherin Maritza
Salazar Yepes, Mauricio Alberto
Gutiérrez Sánchez, Pablo Andrés
Marín Montoya, Mauricio Alejandro
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv 6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
topic 6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Agronomía
Protección de cultivos
fitopatologia
sanidad vegetal
ADN ribosomal
Antracnosis
Permeasa de hierro
Phaseolus vulgaris
RFLPs
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Agronomía
Protección de cultivos
fitopatologia
sanidad vegetal
ADN ribosomal
Antracnosis
Permeasa de hierro
Phaseolus vulgaris
RFLPs
description Colletotrichum lindemuthianum, agente causal de la antracnosis del frijol, es uno de los patógenos más limitantes en la producción de este cultivo. La detección y correcta identificación de este hongo resulta fundamental para el manejo de la enfermedad, siendo las pruebas moleculares alternativas rápidas y sen-sibles para este fin. Mediante la técnica de PCR se evaluaron cuatro juegos de cebadores (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 y ClF432/ClR533) para la detección de C. lindemuthianum a partir de tejidos folia-res, de vainas y de semillas procedentes de cultivos de frijol de Antioquia, Colombia. Los resultados indi-caron que el par CD1/CD2, dirigido al pseudogen de permeasa de hierro Ftr1, fue el más efectivo para detectar el hongo en tejidos y semillas de frijol, así como para identificar aislamientos en cultivos micro-biológicos. Para los cebadores CY1/CY2, dirigidos a los ITS del rDNA, se recomienda un esquema de PCR-RFLPs con MseI (=Tru1I) para la diferenciación con las especies C. orbiculare y C. trifolii. Estos cebadores generaron resultados consistentes cuando se utilizaron en combinación con ITS1 (ITS1/CY2) e ITS4 (CY1/ITS4). Finalmente, los cebadores ClF4/ITS4 resultaron en amplificaciones inespecíficas y ClF432/ClR533 en fragmentos de difícil resolución en electroforesis de agarosa. Este estudio servirá de apoyo para los programas de certificación de semilla y mejoramiento genético de frijol.
publishDate 2014
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2014-10-01
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2019-06-29T08:17:47Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2019-06-29T08:17:47Z
dc.type.spa.fl_str_mv Artículo de revista
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/ART
format http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
status_str publishedVersion
dc.identifier.issn.spa.fl_str_mv ISSN: 2323-0118
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/48991
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/42448/
identifier_str_mv ISSN: 2323-0118
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/48991
http://bdigital.unal.edu.co/42448/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.spa.fl_str_mv http://revistas.unal.edu.co/index.php/acta_agronomica/article/view/42035
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Acta Agronómica
Acta Agronómica
dc.relation.references.spa.fl_str_mv Martínez Pacheco, Leonardo and Vanegas Berrouet, Katherin Maritza and Salazar Yepes, Mauricio Alberto and Gutiérrez Sánchez, Pablo Andrés and Marín Montoya, Mauricio Alejandro (2014) Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia. Acta Agronómica, 63 (4). pp. 377-387. ISSN 2323-0118
dc.rights.spa.fl_str_mv Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/1/42035-210117-1-PB.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/2/42035-193472-1-SP.tif
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/3/42035-193471-1-SP.tif
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/4/42035-193470-1-SP.tif
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/5/42035-210117-1-PB.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 094df921879fb0eb118a65dc43c6120d
0b6c256692a80c3de76d39c9b205c926
4d81c6455093fe80c4179e884642aaa3
75d288b2f80928fc9a37d7c89ff24c6d
d0a3271334316e38ec52cf92aba2b893
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1814089744518217728
spelling Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Martínez Pacheco, Leonardo55260e3a-b338-4785-9589-f9add94af6fe300Vanegas Berrouet, Katherin Maritza4c2c6957-ad0d-40ce-90ef-8d1e009abf89300Salazar Yepes, Mauricio Alberto2deb7f60-17b2-46b0-9c9a-ebcca2cc859b300Gutiérrez Sánchez, Pablo Andrés8324cb8e-9fd5-44ea-a44f-8e8184a2ffd8300Marín Montoya, Mauricio Alejandro936d15fc-c0c5-45c6-b61c-b1c548ee7e803002019-06-29T08:17:47Z2019-06-29T08:17:47Z2014-10-01ISSN: 2323-0118https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/48991http://bdigital.unal.edu.co/42448/Colletotrichum lindemuthianum, agente causal de la antracnosis del frijol, es uno de los patógenos más limitantes en la producción de este cultivo. La detección y correcta identificación de este hongo resulta fundamental para el manejo de la enfermedad, siendo las pruebas moleculares alternativas rápidas y sen-sibles para este fin. Mediante la técnica de PCR se evaluaron cuatro juegos de cebadores (CY1/CY2, CD1/CD2, ClF4/ITS4 y ClF432/ClR533) para la detección de C. lindemuthianum a partir de tejidos folia-res, de vainas y de semillas procedentes de cultivos de frijol de Antioquia, Colombia. Los resultados indi-caron que el par CD1/CD2, dirigido al pseudogen de permeasa de hierro Ftr1, fue el más efectivo para detectar el hongo en tejidos y semillas de frijol, así como para identificar aislamientos en cultivos micro-biológicos. Para los cebadores CY1/CY2, dirigidos a los ITS del rDNA, se recomienda un esquema de PCR-RFLPs con MseI (=Tru1I) para la diferenciación con las especies C. orbiculare y C. trifolii. Estos cebadores generaron resultados consistentes cuando se utilizaron en combinación con ITS1 (ITS1/CY2) e ITS4 (CY1/ITS4). Finalmente, los cebadores ClF4/ITS4 resultaron en amplificaciones inespecíficas y ClF432/ClR533 en fragmentos de difícil resolución en electroforesis de agarosa. Este estudio servirá de apoyo para los programas de certificación de semilla y mejoramiento genético de frijol.application/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Palmirahttp://revistas.unal.edu.co/index.php/acta_agronomica/article/view/42035Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Acta AgronómicaActa AgronómicaMartínez Pacheco, Leonardo and Vanegas Berrouet, Katherin Maritza and Salazar Yepes, Mauricio Alberto and Gutiérrez Sánchez, Pablo Andrés and Marín Montoya, Mauricio Alejandro (2014) Detección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombia. Acta Agronómica, 63 (4). pp. 377-387. ISSN 2323-01186 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology63 Agricultura y tecnologías relacionadas / AgricultureAgronomíaProtección de cultivosfitopatologiasanidad vegetalADN ribosomalAntracnosisPermeasa de hierroPhaseolus vulgarisRFLPsDetección por pcr de colletotrichum lindemuthianum en cultivos y semillas de frijol en antioquia, colombiaArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTORIGINAL42035-210117-1-PB.pdfapplication/pdf529103https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/1/42035-210117-1-PB.pdf094df921879fb0eb118a65dc43c6120dMD5142035-193472-1-SP.tifimage/tiff2064972https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/2/42035-193472-1-SP.tif0b6c256692a80c3de76d39c9b205c926MD5242035-193471-1-SP.tifimage/tiff2330230https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/3/42035-193471-1-SP.tif4d81c6455093fe80c4179e884642aaa3MD5342035-193470-1-SP.tifimage/tiff2889832https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/4/42035-193470-1-SP.tif75d288b2f80928fc9a37d7c89ff24c6dMD54THUMBNAIL42035-210117-1-PB.pdf.jpg42035-210117-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg8733https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/48991/5/42035-210117-1-PB.pdf.jpgd0a3271334316e38ec52cf92aba2b893MD55unal/48991oai:repositorio.unal.edu.co:unal/489912023-11-06 23:16:01.722Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co