Detección y cuantificación del Potato yellow vein virus (PYVV) en aislamientos de diferentes órganos de Solanum tuberosum Grupo Phureja

Potato vein yellow virus (PYVV) es un virus reemergente que infecta a la especie Solanum tuberosum en algunos países andinos causando pérdidas importantes en la producción. El virus ha sido detectado por RT-PCR convencional y en sólo dos ocasiones se ha reportado el uso de PCR en tiempo real para el diagnóstico del virus. No existen estudios sobre la distribución y acumulación de PYVV en diferentes órganos de una planta infectada, por lo tanto no se sabe si la distribución del virus en plantas infectadas es homogénea ó heterogénea. Teniendo en cuenta lo anterior el objetivo del presente trabajo fue evaluar la distribución y acumulación viral del PYVV en muestras de tubérculos y otros órganos de plantas de Solanum tuberosum Grupo Phureja variedad Criolla Colombia infectadas con el virus. Se hizo cuantificación absoluta utilizando la técnica de RT-PCR en tiempo real (qRT-PCR) con Sondas TaqMan® la cual requiere tener un RNA de buena calidad y cantidad, por lo tanto inicialmente se hizo una evaluación de tres métodos de extracción para el aislamiento de RNA a partir de diferentes órganos de plantas de S. tuberosum Grupo Phureja Variedad Criolla Colombia infectadas con el virus (foliolo, peciolo, tallo, pedúnculo floral, antera, pétalo, raíz y brote de tubérculo). La evaluación se hizo en términos del rendimiento, radio de las absorbancias 260/280nm, radio de la intensidad de las bandas de las subunidades ribosomales 28S/18S, y la amplificación del gen de la proteína mayor de la cápside (CP) de PYVV; los métodos evaluados fueron: Trizol® (Invitrogen), fenol:cloroformo seguido de purificación con Sephadex y un método basado en CTAB. Aunque con los tres métodos se logró la detección del virus en los diferentes órganos evaluados, los resultados sugirieron que Trizol® (Invitrogen) era el mejor método para la extracción de RNA a partir de diferentes órganos, debido a que este presentó la mayor probabilidad de obtener un mayor rendimiento y relación 260/280nm, y se logró la detección del virus por RT-PCR en un mayor número de muestras que con los otros dos métodos de extracción Posteriormente se analizó la acumulación del virus en diferentes órganos de plantas de S. tuberosum Grupo Phureja variedad Criolla Colombia infectadas por transmisión con el vector natural, en donde PYVV presentó una distribución homogénea en plantas que no expresaban síntomas de amarillamiento, mientras que las plantas que expresaron síntomas de amarillamiento presentaron una distribución diferencial (heterogénea) entre la zona aérea y la zona radical (con mayor acumulación en la zona aérea). En tubérculos el virus también se distribuye heterogéneamente cuando las muestras provienen de plantas que no expresan síntomas. Es la primera vez que se detecta PYVV en muestras de diferentes órganos de plantas infectadas. La información presentada en este trabajo puede resultar interesante para el conocimiento del virus (distribución del virus en el hospedero) y puede ser importante en programas de fitomejoramiento, indexado de plantas contra PYVV, programas de cuarentena y certificación de semillas libres de virus.

• Autores: Hernández Guzmán, Anngie Katherine
• Fecha de publicación: 2012
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/20156
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/20156; http://bdigital.unal.edu.co/10593/
• Palabra clave: 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology; 61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health; 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture; 66 Ingeniería química y Tecnologías relacionadas/ Chemical engineering; PYVD; Distribución; RT-PCR en tiempo real; RT-PCR; Sondas TaqMan; Cuantificación absoluta; Diferentes órganos; Distribution; Real time RT-PCR, RT-PCR; TaqMan® proof; Absolute quantification; Different organs
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional