Detección y caracterización molecular de virus de influenza A en cerdos al sacrificio en Colombia

La influenza porcina es una enfermedad altamente contagiosa cuyo agente causal es un virus del género Influenzavirus A, que a su vez pertenece a la familia Orthomyxoviridae y que se caracteriza por presentar una alta variabilidad. Existen dos mecanismos principales de variación que permiten la adquisición de cambios moleculares en los virus de influenza, el drift o deriva antigénica y el shift antigénico (re-arreglos) que se manifiestan de forma cooperativa para la generación de cepas con nuevas características. Un ejemplo de lo anterior puede verse reflejado en la conformación y características del virus de influenza que llevaron a la presentación de la primera pandemia del siglo XXI, en el 2009. Tomando como punto de referencia la aparición y diseminación del virus de influenza A del tipo H1N1 pandémico de 2009 (H1N1pdm09) en la población de cerdos del mundo y los eventos ocurridos posteriormente, se han observado cambios moleculares importantes en los linajes del virus de influenza porcina, relacionados a un incremento en la tasa de re-arreglos con esta cepa. De acuerdo a esto y considerando los resultados de estudios previos en nuestro grupo de investigación que demuestran la introducción de este virus en el país, se plantea la necesidad de obtener nueva información acerca de los virus de influenza que circulan actualmente en cerdos en Colombia. Con este fin se llevó a cabo un estudio en el que se analizaron 788 muestras de tejido pulmonar recolectadas durante 2015-2017 a partir de cerdos en plantas de beneficio, los cuales procedían de 11 regiones geográficas de nuestro país. Una vez procesadas las muestras fueron analizadas empleando una técnica de qRT-PCR, la cual inicialmente tuvo como blanco el gen de la matriz de virus de influenza A. De acuerdo con el resultado obtenido, se realizaron análisis de sub-tipificación a las muestras positivas, empleando protocolos de amplificación para el gen de la Nucleoproteína (NP) de virus de influenza porcina, el gen de la HA del virus H1N1pdm09 y los genes HA y NA del subtipo H3N2 porcino. Adicionalmente se seleccionaron muestras para ser inoculadas en huevos de embrión de pollo libres de patógenos específicos (SPF) de 9-10 días y se confirmó el aislamiento de virus de influenza mediante las pruebas de hemaglutinación y RT-PCR. Posteriormente, se realizó amplificación completa de los genes HA, NA, M y NS de los aislamientos obtenidos para llevar a cabo análisis de secuencias de nucleótidos y de filogenia. Como resultado de este estudio, fue posible la detección del virus de influenza A en 116 del total muestras, provenientes de cinco regiones geográficas distintas y el aislamiento y evaluación de 5 cepas de campo de virus de influenza A provenientes de las regiones de Antioquia y Cundinamarca, las cuales mostraron relación filogenética con virus de influenza del tipo H1N1pdm09. Los resultados obtenidos confirman la circulación permanente del virus de influenza A en las regiones de mayor producción en Colombia, así como la presencia del subtipo H1N1pdm09 en la población de cerdos del país. Tales hallazgos ponen en perspectiva la necesidad de extender los estudios de vigilancia en otras regiones y en diversas especies para establecer aspectos ecológicos asociados a los flujos de transmisión y factores de riesgo. La integración de estos hallazgos y el registro de nueva información ayudará a detectar cambios moleculares que contribuyan a establecer estrategias de prevención y control orientadas a la situación de la infección por virus de influenza A en cerdos, de manera que permitan anticipar el surgimiento de eventos de pandemia y/o epidemia.

• Autores: Flórez Ramos, Juan Miguel
• Fecha de publicación: 2017
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/60293
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/60293; http://bdigital.unal.edu.co/58579/
• Palabra clave: 5 Ciencias naturales y matemáticas / Science; 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology; 58 Plantas / Plants; 59 Animales / Animals; 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture; 66 Ingeniería química y Tecnologías relacionadas/ Chemical engineering; Influenza A en cerdos; Plantas de beneficio; tejido pulmonar; Virus H1N1 pandémico de 2009; qRT-PCR; Aislamiento viral; Colombia; Swine influenza; Slaughterhouses; Llung tissue; 2009 pandemic H1N1 influenza virus; qRT-PCR; Virus isolation
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