Caracterización genómica parcial y biológica de reovirus que infecta yuca Manihot esculenta Crantz

La yuca es afectada por diversos patógenos que reducen su productividad. En América la principal enfermedad es el Cuero de Sapo de la Yuca (CFSD), relacionada con un reovirus y un fitoplasma. Los estudios de caracterización del reovirus han permitido identificar entre nueve y diez segmentos genómicos, viriones de forma cuasi-isométrica, similaridad con género Oryzavirus y la presencia de variantes. El presente estudio permitió confirmar la diversidad del Cassava frogskin associated virus a partir de la comparación de más de 80 secuencias del segmento 4 que contiene el gen de la Polimerasa; esta misma diversidad fue encontrada al comparar secuencias del segmento 3 y se plantea la hipótesis de la presencia de reorganización y se propone el nombre de las razas Amazonas, Quilcasé y América. El análisis de los fragmentos de restricción utilizando la enzima Eco RV permitió identificar la presencia aislamientos con los patrones NERV y ERV, siendo el primero restringido al Amazonas y al Cauca mientras que el segundo se distribuye en toda Colombia y en las muestras procedentes de Paraguay, Brasil, Ecuador Venezuela, Panamá y Costa Rica. La variante EV en la variedad resistente COL1468 (CMC40) no fue transmitida por semilla sexual (botánica). La expresión de síntomas en Secundina a partir de plantas con CFSD positivas o negativas al reovirus permitió discriminar un serie de síntomas como amarillamiento de nervaduras, manchas anulares, moteado, mosaico, deformación foliar y enchinamiento relacionados con la enfermedad pero no con el reovirus. Las observaciones de ultraestructura celular de Secundina evidenciaron la presencia de partículas similares al reovirus en células de haces vasculares, así como la presencia de otras partículas isométricas, inclusiones laminares y viroplasmas. A partir del secuenciamiento a gran escala se caracterizó parcialmente el genoma de la raza Quilcasé a partir del asilamiento FSD29. Se obtuvieron secuencias nuevas de los segmentos 1, 7 y 9, y se incrementaron las de los segmentos 3, 4, 5 y 10. El análisis filogenético de la familia Reoviridae al comparar secuencias de aminoácidos de la polimerasa permitió confirmar la mayor cercanía con el género Oryzavirus formando un clado con el RRSV, el RpLV y SFRV, aunque podría ser una género nuevo por su baja similaridad y el hospedero.

• Autores: Olaya Arias, Cristian Andrés
• Fecha de publicación: 2013
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/21791
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/21791; http://bdigital.unal.edu.co/12778/
• Palabra clave: 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture; Reoviridae; Síntoma; Cuero de sapo; Secuenciamiento a gran escala; Microscopia electrónica; Diversidad, transmisión; Transmisión; Reoviridae; Symptoms; Frog skin disease; Deep sequencing; Transmission electron microscopy; Virus diversity; Transmission.
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional