Caracterización del virus Cassava torrado-like virus en yuca (Manihot esculenta Crantz) e identificación de proteínas virales involucradas en la supresión del silenciamiento de ARN

La yuca (Manihot esculenta Crantz, Euphorbiaceae) es un cultivo importante para África, Asia y América Latina. En África, los virus de las familias Geminiviridae y Potyviridae, son considerados como los más devastadores en infecciones simples o formando complejos virales. En América Latina encontram...

Full description

Autores:
Jiménez Polo, Jenyfer
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2017
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/63749
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/63749
http://bdigital.unal.edu.co/64258/
Palabra clave:
58 Plantas / Plants
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Yuca
Secuenciación de nueva generación
Silenciamiento génico
Torradovirus
Agroinfiltración
Cassava
NGS
RNA silencing suppressor
Torradovirus
Agroinfiltration
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Description
Summary:La yuca (Manihot esculenta Crantz, Euphorbiaceae) es un cultivo importante para África, Asia y América Latina. En África, los virus de las familias Geminiviridae y Potyviridae, son considerados como los más devastadores en infecciones simples o formando complejos virales. En América Latina encontramos otros agentes virales pertenecientes a las familias Alphaflexiviridae, Caulimoviridae, Luteoviridae, y Reoviridae asociados a distintas enfermedades. En Colombia, se ha detectado el Cassava torrado-like virus (CsTLV, Familia Secoviridae) en infecciones mixtas con los virus anteriormente mencionados asociados a síntomas severos en raíces, incluyendo los reportados para la enfermedad de cuero de sapo de yuca. Con el objetivo de contribuir a la caracterización molecular y biológica de CsTLV, se utilizaron metodologías de secuenciación de nueva generación (NGS), RT-PCRs, ELISAs, análisis filogenéticos, rango de hospedantes, agro-infiltraciones, ensayos y muestreos en el campo. Se obtuvo el genoma completo de CsTLV, encontrándose la presencia de un dominio Maf / HAM1 presente en otros dos virus de la familia Potyviridae que infectan plantas de la familia Euphorbiaceae. El rol de diferentes genes virales se estudió mediante agro-infiltración, determinándose que el ORF1 del ARN2 tiene un efecto en el establecimiento de la infección del virus X de la yuca (CsVX) y aunque no se ha identificado una proteína viral que suprima el silenciamiento por ARN en este virus, se pudo observar que la infección por CsTLV si tiene un efecto supresión de silenciamiento en raíces de yuca. Se encontró alta prevalencia de CsTLV en diferentes regiones productoras de yuca del país, mostrando gran diversidad y sugiriendo la presencia de dos especies diferentes de torradovirus. Los bioensayos mostraron que CsTLV causa síntomas foliares y reduce significativamente el rendimiento.