Caracterización morfológica y molecular de Colletotrichum gloeosporioides aislado de ñame (Dioscorea spp.) y establecimiento de una escala de virulencia para su caracterización patogénica

El ñame (Dioscorea sp.) es un cultivo representativo y promisorio para los países productores, en sectores como la alimentación, los cosméticos y la industria farmacéutica. Una de las principales limitantes de su producción es la antracnosis, enfermedad causada por el hongo Colletotrichum gloeosporioides. En Colombia esta patología registra su mayor impacto en la Costa Caribe colombiana, por ser esta la región donde se concentra la producción del país. El principal método empleado para el control de la enfermedad es el manejo con agroquímicos que implica riesgos para la salud humana y el medio ambiental, aumento en los costos de producción e inducción de resistencia por parte del patógeno. El diseño de nuevas alternativas de control requiere que se genere conocimiento del patosistema. Con este propósito, se conformó una colección de 40 aislamientos de C. gloeosporioides, de muestras de Dioscorea alata y Dioscorea rotundata con síntomas asociadas a la enfermedad, procedentes de cinco cultivos ubicados en los departamentos de Córdoba, Sucre y Bolívar. La colección previa identificación por comparación de secuencias ITS contra bases de datos, fue caracterizada morfológica y molecularmente. Las variables morfológicas evaluadas fueron analizadas con el método de Gower, las huellas genéticas generadas con las metodologías ap-PCR y DAF fueron analizadas con el método de DICE y las secuencias ITS tratadas por parsimonia. La diversidad de la colección fue calculada mediante la fórmula de diversidad genética promedio (He) a partir de los datos de huellas genómicas. Las relaciones existentes entre niveles de caracterización y su dependencia con los datos de procedencia de los aislados, se establecieron por Análisis de Correspondencia Múltiple (ACM). Finalmente, pruebas de virulencia fueron realizadas bajo condiciones de invernadero con plántulas de la especie D. rotundata y el aislamiento DC 37B, escogido al azar de la colección caracterizada, transcurridos dos meses fueron calculados los datos de área foliar afectada por el patógeno con el programa ImageJ y empleados estos para establecer una escala de virulencia. Los resultados y análisis de los datos de caracterización evidenciaron alta variabilidad dentro de la colección. El ACM permitió relacionar los grupos obtenidos en cada nivel de caracterización y mostró una dependencia entre los mismos. Como complemento, se encontró que la agrupación de los aislamientos no fue afectada por la ubicación geográfica del cultivo y la especie de ñame de la que se aisló el patógeno. Por último, se establecieron pruebas de patogenicidad y se propuso una escala de virulencia, para la evaluación ex vitro de la severidad de la infección causada por el hongo. Este trabajo contribuye al conocimiento de la biología y variabilidad de C. gloeosporioides y es un aporte a futuros estudios de la epidemiología de la antracnosis en cultivos de ñame del Caribe colombiano. Lo resultados además sugirieron la presencia de un complejo C. gloeosporioides sensu lato, posiblemente acompañado de otras especies del género Colletotrichum, en el desarrollo de la enfermedad.

• Autores: Pinzón Gutiérrez, Yeimy Alexandra
• Fecha de publicación: 2014
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/75192
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/75192; http://bdigital.unal.edu.co/39705/
• Palabra clave: 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology; 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture; Colletotrichum gloeosporioides; Dioscorea sp.; Caracterización morfológica; Caracterización molecular; Análisis de Correspondencia Múltiple; Escala de virulencia; Morfological characterization; Molecular characterization; Multiple Correspondence Analysis; Severity scores
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional