Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (iManihot esculenta/i Crantz)
Posterior al reconocimiento de agentes patógenos las plantas activan una serie de cascadas de señalización que culminan con la activación de factores de transcripción. Esto genera una concomitante reprogramación de la expresión génica que incluye la activación de la transcripción de los genes PR (re...
- Autores:
-
Herrera, Mariana
Portillo, David
Pulido, Marlon Adrian
Diaz Tatis, Paula Alejandra
López Carrascal, Camilo Ernesto
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/68146
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/68146
http://bdigital.unal.edu.co/69179/
- Palabra clave:
- 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
cassava bacterial blight
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pathogenesis-related genes
iXanthomonas axonopodis/i pv. imanihotis/i
bacteriosis vascular
expresión génica
genes relacionados con patogenicidad
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- openAccess
- License
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Posterior al reconocimiento de agentes patógenos las plantas activan una serie de cascadas de señalización que culminan con la activación de factores de transcripción. Esto genera una concomitante reprogramación de la expresión génica que incluye la activación de la transcripción de los genes PR (relacionados con patogenicidad). Las proteínas PR son conocidas por poseer actividad antimicrobiana y evitan la posterior colonización del patógeno. En este estudio se empleó una aproximación bioinformática para identificar el repertorio de posibles proteínas PR en el genoma de yuca. Adicionalmente, se evaluó la expresión de nueve genes PR a lo largo del tiempo en variedades de yuca resistentes y susceptibles en respuesta a la inoculación con la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) mediante RT-PCR. Se encontró que varios genes PR fueron inducidos producto de la herida que se realiza durante el proceso de inoculación. Con el fin de evaluar cuantitativamente la contribución real de la infección bacteriana en la expresión de estos genes, se llevó a cabo una RT-PCR en tiempo real (QRT, Quantitative Real-Time PCR). Se encontró que en la variedad resistente el gen que codifica para MePR1 (Manes06G026900.1) presentó una inducción en su expresión a diferentes tiempos post-inoculación, lo cual no se observó en la variedad susceptible. De esta manera, este gen se constituye en un excelente marcador para evaluar la respuesta molecular de resistencia en plantas de yuca. |
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Herrera, Mariana and Portillo, David and Pulido, Marlon Adrian and Diaz Tatis, Paula Alejandra and López Carrascal, Camilo Ernesto (2018) Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (iManihot esculenta/i Crantz). Acta Biológica Colombiana, 23 (3). pp. 242-252. ISSN 1900-1649 |
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Las proteínas PR son conocidas por poseer actividad antimicrobiana y evitan la posterior colonización del patógeno. En este estudio se empleó una aproximación bioinformática para identificar el repertorio de posibles proteínas PR en el genoma de yuca. Adicionalmente, se evaluó la expresión de nueve genes PR a lo largo del tiempo en variedades de yuca resistentes y susceptibles en respuesta a la inoculación con la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) mediante RT-PCR. Se encontró que varios genes PR fueron inducidos producto de la herida que se realiza durante el proceso de inoculación. Con el fin de evaluar cuantitativamente la contribución real de la infección bacteriana en la expresión de estos genes, se llevó a cabo una RT-PCR en tiempo real (QRT, Quantitative Real-Time PCR). Se encontró que en la variedad resistente el gen que codifica para MePR1 (Manes06G026900.1) presentó una inducción en su expresión a diferentes tiempos post-inoculación, lo cual no se observó en la variedad susceptible. De esta manera, este gen se constituye en un excelente marcador para evaluar la respuesta molecular de resistencia en plantas de yuca.Once pathogens are perceived by plants a signal transduction pathway is activated leading to the induction of transcription factors, which in turn reprogram the host gene expression including the transcription of PR (Pathogenesis-Related) genes. The PR proteins are well known for their antimicrobial activity and for contributing to arrest the invasion of pathogens. In this work, a bioinformatics approach was used to identify the repertoire of possible PR proteins in the cassava genome. Additionally, the expression of nine PR genes was evaluated over the time course in resistant and susceptible cassava varieties in response to inoculation with the bacterium Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam) by semiquantitative RT-PCR. It was found that several PR genes were induced as a result of the wound that is made during the inoculation process. In order to evaluate quantitatively the real contribution of the bacterial infection in the expression of the genes, a Real Time RT-PCR (qRT, quantitative Real-Time PCR) was carried out. In the resistant variety the gene coding for MePR1 (Manes06G026900) showed an induction in their expression at different post-inoculation times, which was not observed in the susceptible variety. Therefore, this gene constitutes an excellent marker to evaluate the molecular resistance response in cassava plants.application/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Faculdad de Ciencias - Departamento de Biologíahttps://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/70868Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Acta Biológica ColombianaActa Biológica ColombianaHerrera, Mariana and Portillo, David and Pulido, Marlon Adrian and Diaz Tatis, Paula Alejandra and López Carrascal, Camilo Ernesto (2018) Estudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (iManihot esculenta/i Crantz). Acta Biológica Colombiana, 23 (3). pp. 242-252. ISSN 1900-164957 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biologycassava bacterial blightgene expressionpathogenesis-related genesiXanthomonas axonopodis/i pv. imanihotis/ibacteriosis vascularexpresión génicagenes relacionados con patogenicidadiXanthomonas axonopodis/i pv. imanihotis/iEstudio de la expresión de genes que codifican para putativas proteínas PR en yuca (iManihot esculenta/i Crantz)Artículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTORIGINAL70868-395431-4-PB.pdfapplication/pdf394259https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/68146/1/70868-395431-4-PB.pdf04565e7c8166b7c68c663ee9ff3d2e5dMD51THUMBNAIL70868-395431-4-PB.pdf.jpg70868-395431-4-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9966https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/68146/2/70868-395431-4-PB.pdf.jpgb719c3383490e617845bfde5157da00fMD52unal/68146oai:repositorio.unal.edu.co:unal/681462024-05-25 23:09:16.982Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |