Comparación de genes que codifican resistencia antibiótica en Mycobacterium avium Complex y Mycobacterium tuberculosis Complex

En la actualidad, los complejos M. avium (MAC) y M. tuberculosis (MTBC) son considerados como agentes etiológicos en enfermedades como la tuberculosis humana, una de las 10 principales causas de mortalidad en el mundo. En 2016 10,4 millones de personas han enfermado de tuberculosis y 1,7 millones mu...

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Autores:: Rojas Ospina, Daniel Andrés

Tipo de recurso:

Fecha de publicación:: 2018

Institución:: Universidad Nacional de Colombia

Repositorio:: Universidad Nacional de Colombia

Idioma:: spa

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Summary:	En la actualidad, los complejos M. avium (MAC) y M. tuberculosis (MTBC) son considerados como agentes etiológicos en enfermedades como la tuberculosis humana, una de las 10 principales causas de mortalidad en el mundo. En 2016 10,4 millones de personas han enfermado de tuberculosis y 1,7 millones murieron por esta enfermedad, donde se asocia 0,4 millones de personas con VIH. La resistencia antibiótica en MTBC se ha constituido en una crisis de salud pública y una amenaza para la seguridad sanitaria, según la OMS, hubo 600.000 nuevos casos de resistencia a rifampicina (fármaco de primera línea más eficaz). Por tal razón, la implementación de nuevas estrategias para el tratamiento de este tipo de enfermedades ha permitido el uso de tecnologías que permiten acelerar pruebas de susceptibilidad a medicamentos. En este trabajo se presenta un flujo (pipeline) para el análisis y comparación de los complejos Mycobacterium avium y Mycobacterium tuberculosis, con el fin de identificar relaciones basadas en la resistencia a medicamentos que poseen estos dos complejos bacterianos, además de un flujo de ensamblaje y anotación de genomas por medio las herramientas ABySS, SOAPdenovo, SPADES y Velvet. Para el análisis y comparación de genes de resistencia se utilizó un conjunto de cepas (genomas completos) del ENA asociados a Mycobacterium tuberculosis complex, además de un grupo de genomas de M. avium complex, estos genomas fueron analizados por la herramienta KvarQ, lo cual permitió el análisis y comparación de genes resistentes a antibióticos de primera línea, las mutaciones asociadas y sus regiones.

Comparación de genes que codifican resistencia antibiótica en Mycobacterium avium Complex y Mycobacterium tuberculosis Complex

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