Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma
Las infecciones micóticas son propias del paciente inmunocomprometido o severamente invadido. Se ha reconocido el riesgo mayor de invasión por Candida en pacientes neutropénicos, pero actualmente hay otras poblaciones de pacientes críticos no-neutropénicos en alto riesgo de infección. La candidiasis...
- Autores:
-
Ospina Barragán, William Pascual
- Tipo de recurso:
- Work document
- Fecha de publicación:
- 2009
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/11571
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/11571
http://bdigital.unal.edu.co/9009/
- Palabra clave:
- 61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health
Candidiasis invasiva
Diagnóstico molecular
PCR semi-nidada / Invasive candidiasis
Molecular diagnostics, PCR semi-nest.
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id |
UNACIONAL2_892df07a3dfebc7bf2d95f22ba1990bf |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/11571 |
network_acronym_str |
UNACIONAL2 |
network_name_str |
Universidad Nacional de Colombia |
repository_id_str |
|
dc.title.spa.fl_str_mv |
Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma |
dc.title.translated.Spa.fl_str_mv |
Protocol for diagnosis of invasive candidiasis by amplified ribosomal DNA by semi-nest PCR in plasma samples |
title |
Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma |
spellingShingle |
Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma 61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health Candidiasis invasiva Diagnóstico molecular PCR semi-nidada / Invasive candidiasis Molecular diagnostics, PCR semi-nest. |
title_short |
Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma |
title_full |
Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma |
title_fullStr |
Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma |
title_full_unstemmed |
Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma |
title_sort |
Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma |
dc.creator.fl_str_mv |
Ospina Barragán, William Pascual |
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Ospina Barragán, William Pascual |
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv |
61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health |
topic |
61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health Candidiasis invasiva Diagnóstico molecular PCR semi-nidada / Invasive candidiasis Molecular diagnostics, PCR semi-nest. |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Candidiasis invasiva Diagnóstico molecular PCR semi-nidada / Invasive candidiasis Molecular diagnostics, PCR semi-nest. |
description |
Las infecciones micóticas son propias del paciente inmunocomprometido o severamente invadido. Se ha reconocido el riesgo mayor de invasión por Candida en pacientes neutropénicos, pero actualmente hay otras poblaciones de pacientes críticos no-neutropénicos en alto riesgo de infección. La candidiasis invasiva es la cuarta causa de infección del torrente circulatorio en el ambiente hospitalario, con una mortalidad atribuible de hasta el 50%. El método estándar de diagnóstico se basa en hemocultivos, los cuales tienen un rendimiento del 50% según se ha documentado por estudios post mortem. Los análisis preliminares han demostrado alta precisión para pruebas de diagnóstico molecular por PCR en infecciones micóticas amplificando DNA ribosomal; sin embargo, dichos estudios no se han validado con el uso de muestras clínicas. Nuestra intención es estandarizar el método para la amplificación de DNA ribosomal con Cebadores pre-elaborados que amplifican la región ITS 2 completa de Candida spp. y mediante protocolo de PCR nidada, amplificar segmentos específicos de 9 especies clínicamente relevantes de Candida, esta vez a partir de muestras clínicas de sangre. Se protocolizará dicha técnica en muestras de sangre para así ponerla en práctica posteriormente en un ensayo comparativo de efectividad diagnóstica de las diversas técnicas de diagnóstico actualmente disponibles para candidiasis invasiva. / Abstract: Fungal infections are characteristic of severely immunocompromised patient or invaded. It has recognized the increased risk of invasion by Candida in neutropenic patients, but today there are other populations of non-neutropenic critically ill patients at high risk of infection. Invasive candidiasis is the fourth leading cause of bloodstream infection in the hospital environment, with an attributable mortality of up to 50%. The standard method of diagnosis is based on blood cultures, which have an efficiency of 50% as documented by postmortem studies. Preliminary tests have shown high accuracy for molecular diagnostic tests for fungal infections PCR amplified ribosomal DNA, but such studies have not been validated using clinical samples. Our intention is to standardize the method for ribosomal DNA amplification with primers that amplify pre-processed the complete ITS 2 region of Candida spp. and by nest-PCR protocol, amplify specific segments of 9 clinically relevant Candida species, this time from clinical samples of blood. It formalizes the technique on blood samples and subsequently implement it in a comparative test of diagnostic effectiveness of various diagnostic techniques currently available for invasive candidiasis |
publishDate |
2009 |
dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2009 |
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2019-06-25T00:28:13Z |
dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2019-06-25T00:28:13Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Documento de trabajo |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/workingPaper |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/draft |
dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_8042 |
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/WP |
format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_8042 |
status_str |
draft |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/11571 |
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv |
http://bdigital.unal.edu.co/9009/ |
url |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/11571 http://bdigital.unal.edu.co/9009/ |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Medicina Facultad de Medicina |
dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
Ospina Barragán, William Pascual (2009) Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma / Protocol for diagnosis of invasive candidiasis by amplified ribosomal DNA by semi-nest PCR in plasma samples. Documento de trabajo. Sin Definir, Bogotá. (No publicado) |
dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia |
dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.license.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
institution |
Universidad Nacional de Colombia |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/11571/1/597761.2010.pdf https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/11571/2/597761.2010.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
08161974922edea9966dbe61c4a93b80 07988749a87f2fbe15f393783c14c6c9 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio_nal@unal.edu.co |
_version_ |
1814089772744835072 |
spelling |
Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Ospina Barragán, William Pascualf73a6311-193f-4d45-9970-e0f052c5d5493002019-06-25T00:28:13Z2019-06-25T00:28:13Z2009https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/11571http://bdigital.unal.edu.co/9009/Las infecciones micóticas son propias del paciente inmunocomprometido o severamente invadido. Se ha reconocido el riesgo mayor de invasión por Candida en pacientes neutropénicos, pero actualmente hay otras poblaciones de pacientes críticos no-neutropénicos en alto riesgo de infección. La candidiasis invasiva es la cuarta causa de infección del torrente circulatorio en el ambiente hospitalario, con una mortalidad atribuible de hasta el 50%. El método estándar de diagnóstico se basa en hemocultivos, los cuales tienen un rendimiento del 50% según se ha documentado por estudios post mortem. Los análisis preliminares han demostrado alta precisión para pruebas de diagnóstico molecular por PCR en infecciones micóticas amplificando DNA ribosomal; sin embargo, dichos estudios no se han validado con el uso de muestras clínicas. Nuestra intención es estandarizar el método para la amplificación de DNA ribosomal con Cebadores pre-elaborados que amplifican la región ITS 2 completa de Candida spp. y mediante protocolo de PCR nidada, amplificar segmentos específicos de 9 especies clínicamente relevantes de Candida, esta vez a partir de muestras clínicas de sangre. Se protocolizará dicha técnica en muestras de sangre para así ponerla en práctica posteriormente en un ensayo comparativo de efectividad diagnóstica de las diversas técnicas de diagnóstico actualmente disponibles para candidiasis invasiva. / Abstract: Fungal infections are characteristic of severely immunocompromised patient or invaded. It has recognized the increased risk of invasion by Candida in neutropenic patients, but today there are other populations of non-neutropenic critically ill patients at high risk of infection. Invasive candidiasis is the fourth leading cause of bloodstream infection in the hospital environment, with an attributable mortality of up to 50%. The standard method of diagnosis is based on blood cultures, which have an efficiency of 50% as documented by postmortem studies. Preliminary tests have shown high accuracy for molecular diagnostic tests for fungal infections PCR amplified ribosomal DNA, but such studies have not been validated using clinical samples. Our intention is to standardize the method for ribosomal DNA amplification with primers that amplify pre-processed the complete ITS 2 region of Candida spp. and by nest-PCR protocol, amplify specific segments of 9 clinically relevant Candida species, this time from clinical samples of blood. It formalizes the technique on blood samples and subsequently implement it in a comparative test of diagnostic effectiveness of various diagnostic techniques currently available for invasive candidiasisapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de MedicinaFacultad de MedicinaOspina Barragán, William Pascual (2009) Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasma / Protocol for diagnosis of invasive candidiasis by amplified ribosomal DNA by semi-nest PCR in plasma samples. Documento de trabajo. Sin Definir, Bogotá. (No publicado)61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and healthCandidiasis invasivaDiagnóstico molecularPCR semi-nidada / Invasive candidiasisMolecular diagnostics, PCR semi-nest.Protocolo para el diagnóstico de Candidiasis Invasiva mediante amplificación de DNA ribosomal por PCR semi-nidada en muestras de plasmaProtocol for diagnosis of invasive candidiasis by amplified ribosomal DNA by semi-nest PCR in plasma samplesDocumento de trabajoinfo:eu-repo/semantics/workingPaperinfo:eu-repo/semantics/drafthttp://purl.org/coar/resource_type/c_8042http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/WPORIGINAL597761.2010.pdfapplication/pdf134361https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/11571/1/597761.2010.pdf08161974922edea9966dbe61c4a93b80MD51THUMBNAIL597761.2010.pdf.jpg597761.2010.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg7492https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/11571/2/597761.2010.pdf.jpg07988749a87f2fbe15f393783c14c6c9MD52unal/11571oai:repositorio.unal.edu.co:unal/115712022-11-24 01:16:25.789Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |