Una descripción matemática del recambio evolutivo de los ARNt en el género Drosophila
En este trabajo se consideran los genomas secuenciados de 12 especies del género Drosophila. A cada genoma le es asociado un vector de 22 componentes; 21 de éstas corresponden al número de genes ARNt funcionales, clasificados según el aminoácido que su molécula transcrita es capaz de transportar, la...
- Autores:
-
Romero Marroquín, Liliana Constanza
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/73129
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/73129
http://bdigital.unal.edu.co/37604/
- Palabra clave:
- 12 Epistemología, causalidad, género humano / Epistemology
51 Matemáticas / Mathematics
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Organización genómica
ARN de transferencia
Conservación sinténica
Tasas de ganancia y degradación de genes
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Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Bermúdez Santana, Clara IsabelDíaz Morales, Hernando (Thesis advisor)5b213a04-f41e-47c7-b7a2-0c2b3d13ab1b-1Romero Marroquín, Liliana Constanzaecec6cfc-8b90-4829-8ce4-cff042cff9813002019-07-03T15:55:21Z2019-07-03T15:55:21Z2014https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/73129http://bdigital.unal.edu.co/37604/En este trabajo se consideran los genomas secuenciados de 12 especies del género Drosophila. A cada genoma le es asociado un vector de 22 componentes; 21 de éstas corresponden al número de genes ARNt funcionales, clasificados según el aminoácido que su molécula transcrita es capaz de transportar, la componente restante corresponde al número de pseudogenes ARNt. Considerando los criterios de conservación en sintenia y similitud entre cadenas, la cual es estudiada usando la distancia de Hamming, se establece que cada pareja de vectores está relacionada mediante una transformación afín. Las entradas de las matrices de dichas transformaciones afines representan las tasas de ganancia de genes o pseudogenes ARNt entre los genomas. Adicionalmente, se estudia la correlación entre la distancia de mutación genómica de dos especies y las tasas encontradas.Abstract. In this document, we consider the sequenced genomes of 12 species in the genus Drosophila. Each genome is associated with a vector. These vectors have 22 components; 21 of them correspond to the number of functional tRNA genes classified according to the unique type of amino acid that is carried by their transcribed molecules, the remaining component correspond to the number of tRNA pseudogenes. Taking into account the syntenic conservation criteria and the similarity between strings, that has been studied using the Hamming distance, we stablish that each pair of vectors is related by an affine transformation. The matrices entries of those affine transformations represent rates of tRNA gene or pseudogene gain between a pair of genomes. Furthermore, we study the correlation between the genome mutation distances and the obtained rates.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de MatemáticasDepartamento de MatemáticasRomero Marroquín, Liliana Constanza (2014) Una descripción matemática del recambio evolutivo de los ARNt en el género Drosophila. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.12 Epistemología, causalidad, género humano / Epistemology51 Matemáticas / Mathematics57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and healthOrganización genómicaARN de transferenciaConservación sinténicaTasas de ganancia y degradación de genesDistancia de HammingTransfer RNASyntenic conservationAffine transformationsHamming distanceUna descripción matemática del recambio evolutivo de los ARNt en el género DrosophilaTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINALlilianaconstanzaromerom.2014.pdfapplication/pdf9900592https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/73129/1/lilianaconstanzaromerom.2014.pdfeacbab4d5e72b019d8f7d0028d64e207MD51THUMBNAILlilianaconstanzaromerom.2014.pdf.jpglilianaconstanzaromerom.2014.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4254https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/73129/2/lilianaconstanzaromerom.2014.pdf.jpgdf0179f0a9f00651a7499a28aee8e507MD52unal/73129oai:repositorio.unal.edu.co:unal/731292023-06-27 23:06:21.064Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |
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