Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de clostridium sp. ibun22a
Este trabajo tuvo como propósito identificar secuencias de genes en clones obtenidos en una librería genómica de la cepa colombiana de Clostridium sp. IBUN 22A. Los insertos de nueve clones con tamaæos superiores a 500 pb fueron secuenciados y analizados por medio de bÅ“squedas de los insertos comp...
- Autores:
-
Montoya Solano, José David
Suárez Moreno, Zulma Rocío
Montoya Castaño, Dolly
Aristizábal Gutiérrez, Fabio Ancízar
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2006
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/22112
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/22112
http://bdigital.unal.edu.co/13146/
- Palabra clave:
- análisis de secuencias
librería genómica
Clostridium
glicerol deshidratasa
1
3-propanodiol
glycerol dehydratase
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3-propanediol
genomic library
Clostridium
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- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
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Este trabajo tuvo como propósito identificar secuencias de genes en clones obtenidos en una librería genómica de la cepa colombiana de Clostridium sp. IBUN 22A. Los insertos de nueve clones con tamaæos superiores a 500 pb fueron secuenciados y analizados por medio de bÅ“squedas de los insertos completos o de sus marcos abiertos de lectura (ORFs) traducidos en GenBank 141.0 y Uniprot 6.6 con BLAST 2.2.8. Se identificaron seis genes con alta similaridad a genes de metabolismo bÆsico (housekeeping) en diferentes especies de Clostridium. En el clon pBsIBUN22A-1 se localizó una secuencia de 851 pb con una identidad del 99.74% respecto al gen codificante de la enzima glicerol deshidratasa (DhaBl) de Clostridium butyricum (AY968605) involucrada en la producción de 1,3 Propanodiol (1,3-PD). La identificación de genes presentes en la cepa nativa Clostridium IBUN 22A abre la puerta a la investigación básica y a la ingeniería metabólica para hacer más rentable el proceso de producción de 1,3-PD junto al conocimiento de los genes presentes en la cepa nativa. Palabras clave: análisis de secuencias, librería genómica, Clostridium, glicerol deshidratasa, 1,3-propanodiol. |
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Montoya Solano, José David and Suárez Moreno, Zulma Rocío and Montoya Castaño, Dolly and Aristizábal Gutiérrez, Fabio Ancízar (2006) Análisis bioinformático y predicción de genes en secuencias genómicas de clostridium sp. ibun22a. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 8, núm. 1 (2006); 57-64 1909-8758 0123-3475 . |
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