Evaluación ecofisiológica, morfoagronómica y diversidad genética de Passiflora edulis sims f. edulis (Gulupa) para la conformación de grupos heteróticos
La importancia económica que tiene actualmente el cultivo de Passiflora edulis f. edulis (gulupa) la convierte en una especie promisoria para Colombia. Por esta razón se realizó la caracterización morfoagronómica, ecofisiológica y molecular de materiales procedentes de tres fuentes diferentes: Banco...
- Autores:
-
Rodriguez Castillo, Nohra
- Tipo de recurso:
- Doctoral thesis
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/76560
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76560
http://bdigital.unal.edu.co/73066/
- Palabra clave:
- Gulupa
GBS sequencing
Ecofisiología
Morfoagronomía
SNPs
Ecophysiology
Morphoagronomy
DNA sequencing
- Rights
- openAccess
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- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
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La importancia económica que tiene actualmente el cultivo de Passiflora edulis f. edulis (gulupa) la convierte en una especie promisoria para Colombia. Por esta razón se realizó la caracterización morfoagronómica, ecofisiológica y molecular de materiales procedentes de tres fuentes diferentes: Banco de germoplasma de Agrosavia (14 accesiones), material cultivado comercialmente (8 accesiones) y poblaciones nativas colectadas en diferentes localidades de la región andina de Colombia (34 accesiones). Se evaluaron en dos localidades: Pasca (Cundinamarca. 1800 msnm) y Susacón (Boyacá. 2500 msnm), siendo esta última un nuevo lugar agroecológico para su cultivo. Se evaluaron 73 descriptores morfoagronómicos cuantitativos, 29 cualitativos y 17 variables ecofisiológicas, los cuales permitieron organizar las accesiones en 5 diferentes clúster, concluyendo que presumiblemente las accesiones nativas colectadas contienen mayor diversidad genética, por lo cual, introducirlas en programas de mejoramiento permitiría lograr un incremento en la diversidad de la especie en uso. Adicionalmente, se determinó por primera vez la diversidad genética con 97 accesiones de gulupa mediante SNPs, siendo identificados como informativos 966 que fueron obtenidos por GBS. Los resultados resaltan que dentro de las accesiones nativas existe un mayor porcentaje de heterocigosidad, contenido de información polimórfico y diversidad genética, en comparación con las accesiones cultivadas y custodiadas. Como resultado de los estudios de estructura poblacional se identifican tres grupos o clúster mediante la metodología WardMLM, los cuales pueden ser considerados como grupos heteróticos debido a la alta frecuencia de homocigosidad para la mayoría de los loci intraclúster, pero variable entre diferentes clúster para el mismo loci. |
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Rodriguez Castillo, Nohra (2019) Evaluación ecofisiológica, morfoagronómica y diversidad genética de Passiflora edulis sims f. edulis (Gulupa) para la conformación de grupos heteróticos. Doctorado thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá. |
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Por esta razón se realizó la caracterización morfoagronómica, ecofisiológica y molecular de materiales procedentes de tres fuentes diferentes: Banco de germoplasma de Agrosavia (14 accesiones), material cultivado comercialmente (8 accesiones) y poblaciones nativas colectadas en diferentes localidades de la región andina de Colombia (34 accesiones). Se evaluaron en dos localidades: Pasca (Cundinamarca. 1800 msnm) y Susacón (Boyacá. 2500 msnm), siendo esta última un nuevo lugar agroecológico para su cultivo. Se evaluaron 73 descriptores morfoagronómicos cuantitativos, 29 cualitativos y 17 variables ecofisiológicas, los cuales permitieron organizar las accesiones en 5 diferentes clúster, concluyendo que presumiblemente las accesiones nativas colectadas contienen mayor diversidad genética, por lo cual, introducirlas en programas de mejoramiento permitiría lograr un incremento en la diversidad de la especie en uso. Adicionalmente, se determinó por primera vez la diversidad genética con 97 accesiones de gulupa mediante SNPs, siendo identificados como informativos 966 que fueron obtenidos por GBS. Los resultados resaltan que dentro de las accesiones nativas existe un mayor porcentaje de heterocigosidad, contenido de información polimórfico y diversidad genética, en comparación con las accesiones cultivadas y custodiadas. Como resultado de los estudios de estructura poblacional se identifican tres grupos o clúster mediante la metodología WardMLM, los cuales pueden ser considerados como grupos heteróticos debido a la alta frecuencia de homocigosidad para la mayoría de los loci intraclúster, pero variable entre diferentes clúster para el mismo loci.Abstract: The economic importance of the cultivation of Passiflora edulis f. edulis (gulupa) the conversion into a promising species for Colombia. For this reason, morphoagronomic, ecophysiological and molecular characterization of processed materials from three different sources was carried out: Agrosavia germplasm bank (14 accessions), commercially cultivated material (8 accessions) and native populations collected in different locations in the Andean region of Colombia (34 accessions). They were evaluated in two locations: Pasca (Cundinamarca. 1800 meters above sea level) and Susacón (Boyacá. 2500 meters above sea level), the latter being a new agroecological place for cultivation. 73 quantitative morphoagronomic descriptors, 29 qualitative and 17 ecophysiological variables were evaluated, which allowed to organize the accessions in 5 different clusters, concluding that presumably the collected native accessions contain greater genetic diversity, therefore, introducing them into breeding programs would allow an increase in The diversity of the species in use. In addition, genetic diversity was determined for the first time with 97 gulupa accesses using SNPs, with 966 being identified as informative by GBS. The results highlight that within the native accessions there is a greater percentage of heterozygosity, content of polymorphic information and genetic diversity, compared to the cultivated and guarded accessions. As a result of the population structure studies, three groups or clusters are identified using the WardMLM methodology, which can be determined as heterotic groups due to the high frequency of homozygosity for most intra-cluster loci, but variable between different clusters for the same loci.Doctoradoapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de BiologíaDepartamento de Biología58 Plantas / Plants63 Agricultura y tecnologías relacionadas / AgricultureRodriguez Castillo, Nohra (2019) Evaluación ecofisiológica, morfoagronómica y diversidad genética de Passiflora edulis sims f. edulis (Gulupa) para la conformación de grupos heteróticos. Doctorado thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.Evaluación ecofisiológica, morfoagronómica y diversidad genética de Passiflora edulis sims f. edulis (Gulupa) para la conformación de grupos heteróticosTrabajo de grado - Doctoradoinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TDGulupaGBS sequencingEcofisiologíaMorfoagronomíaSNPsEcophysiologyMorphoagronomyDNA sequencingORIGINALNohraRodriguezCastillo.2019.pdfapplication/pdf4663002https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76560/1/NohraRodriguezCastillo.2019.pdfcde70fd10f834166903c2bff39fccf84MD51THUMBNAILNohraRodriguezCastillo.2019.pdf.jpgNohraRodriguezCastillo.2019.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3969https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76560/2/NohraRodriguezCastillo.2019.pdf.jpge5e20ddf7b33594f811463a076ebfd57MD52unal/76560oai:repositorio.unal.edu.co:unal/765602023-07-14 23:03:51.676Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |