Caracterización del tallo aceptor del trna mediante descriptores locales basados en cargas parciales

En este trabajo se caracteriza la distribución de carga del tallo aceptor del tRNA, considerando todas las posibles combinaciones de pares Watson-Crick. El estudio se realizó con 256 fragmentos moleculares de 10 nucleótidos que modelan los tres primeros pares del tallo aceptor, la base diferenciadora y el extremo CCA. Para caracterizar los nucleótidos se proponen dos descriptores locales basados en la distribución de carga de las base nitrogenada de cada nucleótido, los cuales se calculan a partir de las cargas parciales de Mulliken obtenidas de cálculos HF/6-31G. La caracterización y clasificación de los tallos según estos descriptores mostró como la base diferenciadora tiene un comportamiento particular respecto a los demás nucleótidos del tallo y una fuerte influencia sobre el extremo CCA. La clasificación de nueve variaciones del tallo aceptor del tRNAAla mostró una buena relación estructura-actividad que pone en evidencia la bondad de los descriptores propuestos para caracterizar de manera local la distribución de carga de estas biomoléculas.

• Autores: Marín, Ray; Daza, Edgar E.
• Tipo de recurso: Article of journal
• Fecha de publicación: 2008
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/23958
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/23958; http://bdigital.unal.edu.co/14995/
• Palabra clave: Tallo aceptor del tRNA; base diferenciadora; aminoacilación; elementos de identidad; distribución de carga; cargas parciales; descriptores locales de carga.
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional