Caracterización fenotípica y molecular de microorganismos aislados de animales en una granja porcícola

La resistencia antibiótica es un problema de magnitud mundial. Si bien la OMS alerta sobre éste, en Colombia hay poca información del impacto del uso de antibióticos en la industría agropecuaria y la generación de ésta. Por esta razón este proyecto buscó caracterizar microorganismos aislados de una...

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Autores:: Rubio, Vivian Vanesa

Tipo de recurso:

Fecha de publicación:: 2016

Institución:: Universidad Nacional de Colombia

Repositorio:: Universidad Nacional de Colombia

Idioma:: spa

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Summary:	La resistencia antibiótica es un problema de magnitud mundial. Si bien la OMS alerta sobre éste, en Colombia hay poca información del impacto del uso de antibióticos en la industría agropecuaria y la generación de ésta. Por esta razón este proyecto buscó caracterizar microorganismos aislados de una granja porcícola en la cual se utilizan antibióticos para producción animal. Se llevó a cabo un estudio de corte transversal en una granja porcícola ubicada en Choachi, Cundinamarca. Se tomaron muestras de hisopado rectal y nasofaíngeo de porcinos, para identificar Escherichia coli y Staphylococcus aureus respectivamente. Se aislaron las cepas de interés en medios selectivos, se identificó, y evaluó su perfil de susceptibilidad a antibióticos por equipos automatizados Vitek y Phoenix. En los aislamientos con susceptibilidad disminuida a -lactámicos se identificó la presencia de -lactamasas y con susceptibilidad disminuida a quinolonas se valoró la presencia de genes plasmídicos, mediante pruebas fenotípicas (método de difusión en agar) y genotípicas (PCR). Se identificaron relaciones genéticas por medio de la técnica rep-PCR y análisis por Diversilab. Se determinaron los tipos de plásmidos circulantes en aislamientos de E. coli mediante PCR. Se seleccionó 1 cepa para secuenciación con el fin de buscar genes de virulencia, resistencia e identificar tipo de cepa circulante. Se recuperaron 64/64 asilamientos de E. coli pero sólo 5/241 de S. aureus. Se identificó sensibilidad disminuida al menos a un antibiótico en 62/64 de E.coli y 5/5 de S. aureus. Los porcentajes más altos de resistencia en E.coli fueron a ampicilina 28,3% (17/60), cefalotina 58,3% (35/60), colistina 82,8% (49/64), trimetropim sulfametoxazol 35% (21/60) y ampicilina/sulbactam 23% (3/13). También se evidenció resistencia a cefalosporinas de tercera generación como ceftazidima 4,7%, ceftriaxona 6,25% y a las quinolonas ciprofloxacina 12,5% y levofloxacino 5%. Se identificaron los genes blaTEM, en 11/36, qnrB en 7/9, MCR1 en 45/48, int123 en 11/64, sul1 en 5/64, sul2 en 13/64 y qacΔ en 5/64 de las muestras analizadas. Se identificaron los grupos de incompatibilidad IncHI1 en 1/9, Inc I1 en 5/9, IncN en 4/9, IncFIB en 4/9, IncFIA en 1/9, IncP en 1/9, IncY en 1/9, IncA/C en 2/9, IncF en 4/9. Este estudio muestra la presencia de resistencia antibiótica en la granja porcícola estudiada y su asociación al uso de antibióticos.

Caracterización fenotípica y molecular de microorganismos aislados de animales en una granja porcícola

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