Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca
Las raíces almacenadoras de yuca representan una fuente importante de almidón. La ruta metabólica del almidón ha sido reconstruida recientemente en yuca gracias a la liberación de la secuencia completa de su genoma. En este estudio se evaluó la expresión de los genes que codifican para las enzimas p...
- Autores:
-
Cortés Sierra, Simón Pedro
Chavarriaga, Paul
Ceballos, Hernán
López Carrascal, Camilo Ernesto
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2015
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/61265
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/61265
http://bdigital.unal.edu.co/60073/
- Palabra clave:
- 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Expresión diferencial
Metabolismo
qRT-PCR
Differential expression
Metabolism
qRT-PCR.
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id |
UNACIONAL2_6efe1e517d3242c802292b2d32fb6e36 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/61265 |
network_acronym_str |
UNACIONAL2 |
network_name_str |
Universidad Nacional de Colombia |
repository_id_str |
|
dc.title.spa.fl_str_mv |
Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca |
title |
Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca |
spellingShingle |
Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology Expresión diferencial Metabolismo qRT-PCR Differential expression Metabolism qRT-PCR. |
title_short |
Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca |
title_full |
Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca |
title_fullStr |
Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca |
title_full_unstemmed |
Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca |
title_sort |
Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca |
dc.creator.fl_str_mv |
Cortés Sierra, Simón Pedro Chavarriaga, Paul Ceballos, Hernán López Carrascal, Camilo Ernesto |
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Cortés Sierra, Simón Pedro Chavarriaga, Paul Ceballos, Hernán López Carrascal, Camilo Ernesto |
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv |
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology |
topic |
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology Expresión diferencial Metabolismo qRT-PCR Differential expression Metabolism qRT-PCR. |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Expresión diferencial Metabolismo qRT-PCR Differential expression Metabolism qRT-PCR. |
description |
Las raíces almacenadoras de yuca representan una fuente importante de almidón. La ruta metabólica del almidón ha sido reconstruida recientemente en yuca gracias a la liberación de la secuencia completa de su genoma. En este estudio se evaluó la expresión de los genes que codifican para las enzimas pululanasa, isoamilasa, α-amilasa, enzima desproporcionante, ADP-glucosa pirofoforilasa, almidón sintasa unida al gránulo, enzima ramificante del almidón y sintasa soluble del almidón, en las raíces almacenadoras de plantas de cinco y 11 meses de edad, en un grupo de cinco variedades de yuca. Se evidenciaron diferencias importantes en la expresión de estos genes entre las variedades evaluadas y entre los dos tiempos. Las variedades CM523-7 y SM1219-2 presentaron uno de los niveles más altos de expresión para los genes ADP-glucosa pirofoforilasa y almidón sintasa unida al gránulo mientras que el gen para α-amilasa fue el más bajo en estas dos variedades. Aunque la variedad TMS60444 presentó niveles de expresión similares en genes implicados en la síntesis de almidón, fue la que presentó el mayor nivel de expresión de la α-amilasa. Estos datos se pueden correlacionar con el relativo bajo contenido de materia seca en esta variedad. Los datos de expresión génica presentados en este trabajo permitirán complementar información sobre actividad enzimática con miras a identificar los elementos más importantes en la acumulación diferencial de almidón entre variedades de yuca |
publishDate |
2015 |
dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2015-05-01 |
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2019-07-02T20:41:23Z |
dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2019-07-02T20:41:23Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Artículo de revista |
dc.type.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1 |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/ART |
format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.issn.spa.fl_str_mv |
ISSN: 1900-1649 |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/61265 |
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv |
http://bdigital.unal.edu.co/60073/ |
identifier_str_mv |
ISSN: 1900-1649 |
url |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/61265 http://bdigital.unal.edu.co/60073/ |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.spa.fl_str_mv |
https://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/42875 |
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Acta Biológica Colombiana Acta Biológica Colombiana |
dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
Cortés Sierra, Simón Pedro and Chavarriaga, Paul and Ceballos, Hernán and López Carrascal, Camilo Ernesto (2015) Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca. Acta Biológica Colombiana, 20 (2). pp. 37-46. ISSN 1900-1649 |
dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia |
dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.license.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.publisher.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Faculdad de Ciencias - Departamento de Biología |
institution |
Universidad Nacional de Colombia |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/61265/1/42875-242453-1-PB.pdf https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/61265/2/42875-242453-1-PB.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
df03b698b53ebb18b4eee4dc6d8bd6dd f6b7bdbc4d5c298581c12542eea1eec4 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio_nal@unal.edu.co |
_version_ |
1814089280578912256 |
spelling |
Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Cortés Sierra, Simón Pedro26d912c8-3701-48a2-92b5-4b3c47048c1c300Chavarriaga, Paulf7b209d6-f43a-456f-8816-2f977668e79c300Ceballos, Hernándfce48c2-6aa6-400b-9b23-e4e3e0a1d8d1300López Carrascal, Camilo Ernestoc1f555c1-29e2-49fb-9923-641e2519545c3002019-07-02T20:41:23Z2019-07-02T20:41:23Z2015-05-01ISSN: 1900-1649https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/61265http://bdigital.unal.edu.co/60073/Las raíces almacenadoras de yuca representan una fuente importante de almidón. La ruta metabólica del almidón ha sido reconstruida recientemente en yuca gracias a la liberación de la secuencia completa de su genoma. En este estudio se evaluó la expresión de los genes que codifican para las enzimas pululanasa, isoamilasa, α-amilasa, enzima desproporcionante, ADP-glucosa pirofoforilasa, almidón sintasa unida al gránulo, enzima ramificante del almidón y sintasa soluble del almidón, en las raíces almacenadoras de plantas de cinco y 11 meses de edad, en un grupo de cinco variedades de yuca. Se evidenciaron diferencias importantes en la expresión de estos genes entre las variedades evaluadas y entre los dos tiempos. Las variedades CM523-7 y SM1219-2 presentaron uno de los niveles más altos de expresión para los genes ADP-glucosa pirofoforilasa y almidón sintasa unida al gránulo mientras que el gen para α-amilasa fue el más bajo en estas dos variedades. Aunque la variedad TMS60444 presentó niveles de expresión similares en genes implicados en la síntesis de almidón, fue la que presentó el mayor nivel de expresión de la α-amilasa. Estos datos se pueden correlacionar con el relativo bajo contenido de materia seca en esta variedad. Los datos de expresión génica presentados en este trabajo permitirán complementar información sobre actividad enzimática con miras a identificar los elementos más importantes en la acumulación diferencial de almidón entre variedades de yucaCassava storage roots represent an important starch source. Recently, the starch metabolic pathway in cassava has been reconstructed thanks to the full release of its genome. In this study gene expression was evaluated for genes coding pullulanase, isoamylase, α-amylase, deproportionating enzyme, ADP-glucose pyrophosphorylase, granule bound starch synthase, starch branching enzyme and soluble starch synthase, in cassava storage roots five and 11 months old, in five cassava varieties. Important gene expression differences were detected both at the variety and time level. CM523-7 and SM1219-2 showed one of the highest expression levels for AGPase and GBSS genes, while α-amylase showed the lowest level in these two varieties. TMS60444 variety showed similar expression levels in starch biosynthesis-related genes, but conversely also showed the highest α-amylase expression. This correlates with the relative low dry-matter content in TMS60444. Gene expression data reported here will allow complementing actual information on enzymatic activity, in order to identify the most relevant factors in differential starch accumulation between cassava varieties.application/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Faculdad de Ciencias - Departamento de Biologíahttps://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/42875Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Acta Biológica ColombianaActa Biológica ColombianaCortés Sierra, Simón Pedro and Chavarriaga, Paul and Ceballos, Hernán and López Carrascal, Camilo Ernesto (2015) Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yuca. Acta Biológica Colombiana, 20 (2). pp. 37-46. ISSN 1900-164957 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biologyExpresión diferencialMetabolismoqRT-PCRDifferential expressionMetabolismqRT-PCR.Evaluación de la expresión de genes implicados en la biosíntesis de almidón en diferentes variedades de yucaArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTORIGINAL42875-242453-1-PB.pdfapplication/pdf449729https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/61265/1/42875-242453-1-PB.pdfdf03b698b53ebb18b4eee4dc6d8bd6ddMD51THUMBNAIL42875-242453-1-PB.pdf.jpg42875-242453-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9432https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/61265/2/42875-242453-1-PB.pdf.jpgf6b7bdbc4d5c298581c12542eea1eec4MD52unal/61265oai:repositorio.unal.edu.co:unal/612652024-04-17 23:50:28.151Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |