Estimación de niveles de resistencia al virus de la hoja amarilla (SCYLV) mediante la técnica de PCR en tiempo real (RT-qPCR) en variedades de caña de azúcar

La enfermedad de la hoja amarilla en caña de azúcar (SCYLV), es causada por el Sugarcane Yellow Leaf Virus (SCYLV) el cual pertenece al género Polerovirus de la familia Luteoviridae y es una enfermedad limitante en países productores de este cultivo debido a la disminución de parámetros de desarrollo y por ende en la productividad (biomasa y sacarosa). La detección de esta enfermedad a edad temprana en semilleros, es necesaria para la toma decisiones al momento del establecimiento de los cultivos comerciales; sin embargo, al contar con variedades asintomáticas al virus, se necesita el uso de herramientas de diagnóstico rápidas, confiables, de alta sensibilidad y cuantitativas. Este trabajo, a través de la técnica molecular RT PCR en tiempo real vía cuantificación absoluta, desarrolló un modelo para la cuantificación del número de copias de la carga viral a partir de un fragmento del virus. Con este modelo, se logró establecer las curvas de progreso de la enfermedad a través del tiempo de cultivo en cuatro variedades comerciales de alta importancia en Colombia: CC 01-1940, CC 84-75, CC 85- 92 y V 71-51 y se determinó su relación con variables de desarrollo y productividad. Adicional a esto, se compararon las metodologías actualmente empleadas en el país para el diagnóstico del SCYLV, demostrando el gran potencial de tiempo real. Finalmente, utilizando metodologías de secuenciación masiva, se determinaron los genomas del SCYLV presentes en estas variedades y se realizó el ensamblaje y comparación filogenética con la diversidad existente en otras regiones del mundo.

• Autores: Cardozo Burgos, Carolina
• Tipo de recurso: Doctoral thesis
• Fecha de publicación: 2017
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/59467
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/59467; http://bdigital.unal.edu.co/56974/
• Palabra clave: 5 Ciencias naturales y matemáticas / Science; 58 Plantas / Plants; 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture; SCYLV; Curvas de Progreso; Tasa de acumulación; Biomasa; Sacarosa; Análisis filogénetico; Sugarcane; SCYLV; Disease progress; Virus accumulation; Biomass; Sugars; Genomes; Phylogeny
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional