Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU

Resumen: La presente tesis de Maestría en Ingeniería de Sistemas se centra en el seguimiento 4D de microorganismos a velocidad de video. Por medio de la microscopía holográfica digital sin lentes se adquiere la información del sistema microscópico y con técnicas de reconocimiento de patrones en el p...

Full description

Autores:
Trujillo Anaya, Carlos Alejandro
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2013
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/11767
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/11767
http://bdigital.unal.edu.co/9302/
Palabra clave:
0 Generalidades / Computer science, information and general works
Microscopía Holográfica Digital
Procesamiento de Imágenes
Computación Paralela
Digital Holographic Microscopy
Image processing
Parallel computing
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_67d7d6ccd127047361f50f17f5c9a909
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/11767
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
spelling Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2García-Sucerquia, Jorge Iván (Thesis advisor)534ee2fb-e153-43e9-96f0-c5c267d1968c-1Trujillo Anaya, Carlos Alejandrobf84e4d1-3f9b-4cc5-abf9-6ea538e3ecb63002019-06-25T00:31:00Z2019-06-25T00:31:00Z2013https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/11767http://bdigital.unal.edu.co/9302/Resumen: La presente tesis de Maestría en Ingeniería de Sistemas se centra en el seguimiento 4D de microorganismos a velocidad de video. Por medio de la microscopía holográfica digital sin lentes se adquiere la información del sistema microscópico y con técnicas de reconocimiento de patrones en el procesamiento digital de imágenes se lleva a cabo su seguimiento 4D (espacio 3D y tiempo). Ambas técnicas son implementadas con soporte en la arquitectura GPGPU para su operación a velocidad de video. La validez científica y tecnológica de la tesis subyace en el hecho que el seguimiento de microorganismos a ratas de video potencializará distintas aplicaciones en áreas como la salud, el monitoreo del medio ambiente y el combate del terrorismo biológico, entre otros. La metodología desarrollada en esta tesis permite seguir en 4D microorganismos de dimensiones en el orden de los 100 μm en volúmenes de muestra de 1mm3, a una velocidad máxima de 8 cuadros por segundo.Abstract: This Master’s thesis in Systems Engineering focuses on the monitoring of microorganisms in 4D at video rate. By using digital lensless holographic microscopy the microscopic information of the system is acquired and with pattern recognition techniques in digital image processing it is carried out the tracking in 4D (3D in space and time). Both techniques are implemented in the GPGPU architecture for operation at video rate. The technological and scientific validity of the thesis lies on the fact that the monitoring of microorganisms at video rate will potentiate different applications in areas such as health, environmental monitoring and combating bioterrorism, among others. The methodology developed in this thesis can track in 4D microorganisms of dimensions in the order of 100 μm, in 1 mm3 sample volumes, at a maximum rate of 8 frames per second.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Medellín Facultad de Minas Escuela de Sistemas Ingeniería de Sistemas e InformáticaIngeniería de Sistemas e InformáticaTrujillo Anaya, Carlos Alejandro (2013) Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia, Medellín.0 Generalidades / Computer science, information and general worksMicroscopía Holográfica DigitalProcesamiento de ImágenesComputación ParalelaDigital Holographic MicroscopyImage processingParallel computingSeguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPUTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINAL1128277068.2013.pdfTesis de Maestría en Ingeniería de sistemasapplication/pdf2795603https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/11767/1/1128277068.2013.pdfdab29f5e2500e820ee7be6b0d0d81e64MD51THUMBNAIL1128277068.2013.pdf.jpg1128277068.2013.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4648https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/11767/2/1128277068.2013.pdf.jpg9c3589c1b7f8764ca58c77c9d0160c15MD52unal/11767oai:repositorio.unal.edu.co:unal/117672023-09-28 10:54:03.365Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co
dc.title.spa.fl_str_mv Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU
title Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU
spellingShingle Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU
0 Generalidades / Computer science, information and general works
Microscopía Holográfica Digital
Procesamiento de Imágenes
Computación Paralela
Digital Holographic Microscopy
Image processing
Parallel computing
title_short Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU
title_full Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU
title_fullStr Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU
title_full_unstemmed Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU
title_sort Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU
dc.creator.fl_str_mv Trujillo Anaya, Carlos Alejandro
dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv García-Sucerquia, Jorge Iván (Thesis advisor)
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Trujillo Anaya, Carlos Alejandro
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv 0 Generalidades / Computer science, information and general works
topic 0 Generalidades / Computer science, information and general works
Microscopía Holográfica Digital
Procesamiento de Imágenes
Computación Paralela
Digital Holographic Microscopy
Image processing
Parallel computing
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Microscopía Holográfica Digital
Procesamiento de Imágenes
Computación Paralela
Digital Holographic Microscopy
Image processing
Parallel computing
description Resumen: La presente tesis de Maestría en Ingeniería de Sistemas se centra en el seguimiento 4D de microorganismos a velocidad de video. Por medio de la microscopía holográfica digital sin lentes se adquiere la información del sistema microscópico y con técnicas de reconocimiento de patrones en el procesamiento digital de imágenes se lleva a cabo su seguimiento 4D (espacio 3D y tiempo). Ambas técnicas son implementadas con soporte en la arquitectura GPGPU para su operación a velocidad de video. La validez científica y tecnológica de la tesis subyace en el hecho que el seguimiento de microorganismos a ratas de video potencializará distintas aplicaciones en áreas como la salud, el monitoreo del medio ambiente y el combate del terrorismo biológico, entre otros. La metodología desarrollada en esta tesis permite seguir en 4D microorganismos de dimensiones en el orden de los 100 μm en volúmenes de muestra de 1mm3, a una velocidad máxima de 8 cuadros por segundo.
publishDate 2013
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2013
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2019-06-25T00:31:00Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2019-06-25T00:31:00Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Maestría
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TM
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/11767
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/9302/
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/11767
http://bdigital.unal.edu.co/9302/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Sede Medellín Facultad de Minas Escuela de Sistemas Ingeniería de Sistemas e Informática
Ingeniería de Sistemas e Informática
dc.relation.references.spa.fl_str_mv Trujillo Anaya, Carlos Alejandro (2013) Seguimiento 4D de microorganismos con microscopía holográfica digital sin lentes a velocidad de video por medio de GPGPU. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia, Medellín.
dc.rights.spa.fl_str_mv Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/11767/1/1128277068.2013.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/11767/2/1128277068.2013.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv dab29f5e2500e820ee7be6b0d0d81e64
9c3589c1b7f8764ca58c77c9d0160c15
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1814089471840223232