Clonación y expresión en Escherichia coli del gen ctpE Rv0908) de Mycobacterium tuberculosis: determinación preliminar de su posible actividad Na+ATPasa

La tuberculosis es uno de los desafíos más importantes para la salud pública en el mundo. Actualmente hay una prevalencia de 2 billones de personas infectadas con Mycobacterium tuberculosis, lo que representa el 30% de la población mundial. En la actualidad, entre los blancos terapéuticos de mayor i...

Full description

Autores:
Cuesta Bernal, Jenifer
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2012
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/20238
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/20238
http://bdigital.unal.edu.co/10722/
Palabra clave:
54 Química y ciencias afines / Chemistry
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health
Mycobacterium tuberculosis
ATPasas tipo P
type P ATPases
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description La tuberculosis es uno de los desafíos más importantes para la salud pública en el mundo. Actualmente hay una prevalencia de 2 billones de personas infectadas con Mycobacterium tuberculosis, lo que representa el 30% de la población mundial. En la actualidad, entre los blancos terapéuticos de mayor interés para el control de patógenos intracelulares se encuentran las proteínas de membrana plasmática encargadas del transporte iónico: ATPasas, transportadores ABC y sistemas antiporter ion/H+ (Novoa et. al. 2012). De hecho, la regulación de la concentración de iones metálicos es central en la fisiología de la interacción hospedero- patógeno y ambos han desarrollado mecanismos sofisticados para el transporte de iones hacia el interior o el exterior celular dependiendo de sus necesidades (Soldati y Neyrolles, 2012). Estudios genómicos de M. tuberculosis evidenciaron que existen 28 secuencias que codifican para transportadores putativos de iones metálicos, entre ellos 12 ATPasas tipo P (Novoa et. al., 2012; Agranoff y Krishna, 2004, 1998). Este gran número de ATPasas (el mayor número reportado para una bacteria), puede dar la versatilidad requerida al bacilo para adaptarse a las condiciones intra- y extracelulares durante las diferentes etapas de la infección, las cuales difieren marcadamente en osmolaridad, concentraciones de iones metálicos, pH y disponibilidad de nutrientes. Estudios bioinformáticos, permitieron clasificar a las ATPasas tipo P de M. tuberculosis CtpA, CtpB, CtpC, CtpD, CtpG, CtpJ y CtpV como transportadores de metales pesados (Cu2+, Cu+, Cu+/ Cu2+, Zn2+ y Co2+/Ni2+); a CtpE, CtpF, CtpH y CtpI como transportadores de iones de metales alcalinos y alcalinotérreos (Na+, K+, Ca2+, H+ y Mg2+); y a KdpB, como una proteína que tiene alta identidad con la subunidad ß de una ATPasa multimérica transportadora de K+ de E. coli (Novoa et. al. 2012). Sin embargo, la especificidad de sustrato para estas ATPasas solo ha sido establecida experimentalmente para tres de ellas. A partir de la creación de mutantes se ha logrado establecer que CtpD es una Co2+/Ni2+ - ATPasa (Raimunda et. al. 2012) y que CtpV y CtpC son ATPasas transportadoras de Cu2+ y Zn2+, respectivamente. (Ward S. et.al. 2010 y Botella H. et.al. 2011). En nuestro grupo de investigación con anterioridad estableció la actividad ATPasa dependiente de Na+ en la membrana plasmática de M. tuberculosis. Dicha actividad se asoció a la presencia de una Na+ ATPasa tipo P, pues es inhibida por vanadato, un reconocido inhibidor de este tipo de bombas (Cuesta, 2010). Los estudios bioinformáticos también identificaron en el genoma del bacilo, al gen ctpE (Rv0908) de M. tuberculosis como posible codificante de una Na+ ATPasa tipo P. El presente trabajo busca establecer la especificidad iónica de la proteína codificada por el gen ctpE de M. tuberculosis. Específicamente, se logró la clonación del gen en el vector de expresión pBADA2 y la expresión heteróloga en células de E. coli del producto génico CtpE. También, los resultados de algunos ensayos bioquímicos y medidas electrofisiológicas, realizados en vesículas de membrana de E. coli, sugieren que la proteína CtpE corresponde a un transportador de Na+ y/o K+.
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En la actualidad, entre los blancos terapéuticos de mayor interés para el control de patógenos intracelulares se encuentran las proteínas de membrana plasmática encargadas del transporte iónico: ATPasas, transportadores ABC y sistemas antiporter ion/H+ (Novoa et. al. 2012). De hecho, la regulación de la concentración de iones metálicos es central en la fisiología de la interacción hospedero- patógeno y ambos han desarrollado mecanismos sofisticados para el transporte de iones hacia el interior o el exterior celular dependiendo de sus necesidades (Soldati y Neyrolles, 2012). Estudios genómicos de M. tuberculosis evidenciaron que existen 28 secuencias que codifican para transportadores putativos de iones metálicos, entre ellos 12 ATPasas tipo P (Novoa et. al., 2012; Agranoff y Krishna, 2004, 1998). Este gran número de ATPasas (el mayor número reportado para una bacteria), puede dar la versatilidad requerida al bacilo para adaptarse a las condiciones intra- y extracelulares durante las diferentes etapas de la infección, las cuales difieren marcadamente en osmolaridad, concentraciones de iones metálicos, pH y disponibilidad de nutrientes. Estudios bioinformáticos, permitieron clasificar a las ATPasas tipo P de M. tuberculosis CtpA, CtpB, CtpC, CtpD, CtpG, CtpJ y CtpV como transportadores de metales pesados (Cu2+, Cu+, Cu+/ Cu2+, Zn2+ y Co2+/Ni2+); a CtpE, CtpF, CtpH y CtpI como transportadores de iones de metales alcalinos y alcalinotérreos (Na+, K+, Ca2+, H+ y Mg2+); y a KdpB, como una proteína que tiene alta identidad con la subunidad ß de una ATPasa multimérica transportadora de K+ de E. coli (Novoa et. al. 2012). Sin embargo, la especificidad de sustrato para estas ATPasas solo ha sido establecida experimentalmente para tres de ellas. A partir de la creación de mutantes se ha logrado establecer que CtpD es una Co2+/Ni2+ - ATPasa (Raimunda et. al. 2012) y que CtpV y CtpC son ATPasas transportadoras de Cu2+ y Zn2+, respectivamente. (Ward S. et.al. 2010 y Botella H. et.al. 2011). En nuestro grupo de investigación con anterioridad estableció la actividad ATPasa dependiente de Na+ en la membrana plasmática de M. tuberculosis. Dicha actividad se asoció a la presencia de una Na+ ATPasa tipo P, pues es inhibida por vanadato, un reconocido inhibidor de este tipo de bombas (Cuesta, 2010). Los estudios bioinformáticos también identificaron en el genoma del bacilo, al gen ctpE (Rv0908) de M. tuberculosis como posible codificante de una Na+ ATPasa tipo P. El presente trabajo busca establecer la especificidad iónica de la proteína codificada por el gen ctpE de M. tuberculosis. Específicamente, se logró la clonación del gen en el vector de expresión pBADA2 y la expresión heteróloga en células de E. coli del producto génico CtpE. También, los resultados de algunos ensayos bioquímicos y medidas electrofisiológicas, realizados en vesículas de membrana de E. coli, sugieren que la proteína CtpE corresponde a un transportador de Na+ y/o K+.Abstract. Tuberculosis is one of the most important challenges for global public health. Currently, there is a prevalence of 2 billion people infected with Mycobacterium tuberculosis, which represents 30% of world´s population. Among the new therapeutic targets of highest interest to control intracellular pathogens, there are plasma membrane proteins involved in ionic transport: ATPases, ABC transporters and antiporter systems ion/H+ (Novoa et. al. 2012). In fact, the regulation of metallic ions concentration plays an important role in the physiology of host- pathogen interaction and both have developed sophisticated mechanisms for ion transport to the intra- or extracellular space according to their needs. (Soldati and Neyrolles, 2012). Different studies have shown that M. tuberculosis genome possess 28 sequences that codify putative trasnsporters of metallic ions, including 12 P type ATPases (Novoa et. al., 2012; Agranoff and Krishna, 2004, 1998). This is the highest number reported for any bacteria, and might give the bacillum versatility to survive to different confitions during the infection, which differ in osmolarity, metallic ion concentration, pH and nutrient availability. Bioinformatic studies allowed to classify P type ATPases of M. tuberculosis CtpA, CtpB, CtpC, CtpD, CtpG, CtpJ and CtpV as heavy metal transporters (Cu2+, Cu+, Cu+/ Cu2+, Zn2+ and Co2+/Ni2+); CtpE, CtpF, CtpH and CtpI as alkaline and alkaline earth metal transporters (Na+, K+, Ca2+, H+ and Mg2+); and KdpB, as a protein with high identity with ß subunit of a multimeric ATPase transporter of K+ in E. coli (Novoa et. al. 2012). However, ion specificity has only been achieved for three of them. From mutagenesis studies it has been possible to establish that CtpD is a Co2+/Ni2+ - ATPase (Raimunda et. al. 2012) while CtpV and CtpC are transporters of Cu2+ and Zn2+, respectively. (Ward S. et.al. 2010 and Botella H. et.al. 2011). Within our research group it has been stablished the ATPase activity stimulated by Na+ in the plasma membrane of M. tuberculosis. This activity was associated to the presence of a Na+ type P ATPase, due to it is inhibited by vanadate, a recognized inhibitor of this kind of pumps (Cuesta, 2010). Bioinformatic studies also identified the gene ctpE (Rv0908) in M. tuberculosis genome as the codifying gene of a Na+ type P ATPase. The objective of this work is to stablish the ion specificity of the protein codified by the gene ctpE of M. tuberculosis. Specifically, cloning the gene in the expression vector pBADA2 and heterologous expression of CtpE in E. coli was achieved. The obtained results from biochemical assays and electrophysiological measurements made on membrane vesicles of E. coli, suggest that the protein CtpE corresponds to a Na+ and/or K+ transporter.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de QuímicaDepartamento de QuímicaCuesta Bernal, Jenifer (2012) Clonación y expresión en Escherichia coli del gen ctpE Rv0908) de Mycobacterium tuberculosis: determinación preliminar de su posible actividad Na+ATPasa. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.54 Química y ciencias afines / Chemistry57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and healthMycobacterium tuberculosisATPasas tipo Ptype P ATPasesClonación y expresión en Escherichia coli del gen ctpE Rv0908) de Mycobacterium tuberculosis: determinación preliminar de su posible actividad Na+ATPasaTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINAL188147.2012.pdfapplication/pdf3170424https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/20238/1/188147.2012.pdfca1ea2c49e5a54a1c2ac123433405d1cMD51THUMBNAIL188147.2012.pdf.jpg188147.2012.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4962https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/20238/2/188147.2012.pdf.jpgd7730a82612f5f16c8afa6303b841896MD52unal/20238oai:repositorio.unal.edu.co:unal/202382023-09-25 23:05:43.81Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co