Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp
El NADP (H) es una molécula de gran importancia en el metabolismo de todos los seres vivos, caracterizada por la capacidad de donar y aceptar iones hidruro. Dada esta característica, el NADP(H) es usado como cofactor enzimático en múltiples reacciones de oxidoreducción del metabolismo anabólico. Adi...
- Autores:
-
Garzón Fajardo, Gustavo Adolfo
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2019
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/76501
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76501
http://bdigital.unal.edu.co/72954/
- Palabra clave:
- NAD quinasa
Leishmania
NAD kinase
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id |
UNACIONAL2_65cacc83fe2a83ae73037f5cca3e07ea |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/76501 |
network_acronym_str |
UNACIONAL2 |
network_name_str |
Universidad Nacional de Colombia |
repository_id_str |
|
dc.title.spa.fl_str_mv |
Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp |
title |
Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp |
spellingShingle |
Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp NAD quinasa Leishmania NAD kinase |
title_short |
Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp |
title_full |
Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp |
title_fullStr |
Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp |
title_full_unstemmed |
Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp |
title_sort |
Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp |
dc.creator.fl_str_mv |
Garzón Fajardo, Gustavo Adolfo |
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Garzón Fajardo, Gustavo Adolfo |
dc.contributor.spa.fl_str_mv |
Ramírez Hernández, Maria Helena |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
NAD quinasa Leishmania NAD kinase |
topic |
NAD quinasa Leishmania NAD kinase |
description |
El NADP (H) es una molécula de gran importancia en el metabolismo de todos los seres vivos, caracterizada por la capacidad de donar y aceptar iones hidruro. Dada esta característica, el NADP(H) es usado como cofactor enzimático en múltiples reacciones de oxidoreducción del metabolismo anabólico. Adicionalmente, en la actualidad se ha reconocido su función como molécula de señalización y control del estrés oxidativo. Dicha molécula se obtiene mediante la fosforilación del NAD(H), proceso catalizado por una enzima denominada NAD quinasa (EC. 2.7.1.23), que favorece la transferencia de un grupo fosfato al 2-hidroxi del anillo de ribosa de la molécula de NAD(H). Las NADKs son una familia de proteínas conservada en todos los seres vivos, siendo identificadas por primera vez en S. cereviceae. En la actualidad, se han identificado homólogos de esta proteína tanto en eucariotas como en procariotas, exceptuando el parásito intracelular Chlamidya trachomatis. Sin embargo a pesar de la importancia de las NADK en el funcionamiento celular, su estudio sido poco abordado en parásitos del genero Leishmania, los agentes causales de la enfermedad conocida como Leishmaniasis. En este trabajo se presenta un primer acercamiento al estudio de las NADK en Leishmania spp mediante herramientas computacionales y la caracterización molecular de este, para ello se realizó la clonación, expresión en E. coli, purificación de la proteína recombinante, evaluación de la actividad NAD quinasa de la recombinante obtenida y la producción de anticuerpos para la inmunodetección e inmunolocalización en el parásito. Esto permitió la identificación de candidatos a NADK en 6 especies de Leishmania, de estos, se seleccionó el candidato LbNADK, el cual presento, características estructurales distintivas de este grupo de proteínas, como los motivos GGDG, NE/D, un dominio rico en glicinas en el extremo C-terminal y la presencia de una región variable en la región N-terminal del candidato LbNADK así como diferencias estructurales significativas con sus homologas humanas. La aproximación experimental permitió mediante el uso de proteínas recombinantes la identificación de la primera NADK presente en un parasito intracelular, así como el desarrollo y evaluación de una herramienta inmunológica que permitió el estudio in-vivo de la LbNADK. El estudio in-vivo permitió inmunodetectar en extractos proteicos la proteína LbNADK, la cual presento un tamaño de 135kDa y mediante ensayos de inmunofluorescencia se localizó en el citoplasma del parásito, convirtiéndose no solo en la primera NADK identificada en parásitos intracelulares, sino también la de mayor tamaño y permitiendo ahondar en el estudio del metabolismo energético de Leishmania |
publishDate |
2019 |
dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2019 |
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2020-03-30T06:21:11Z |
dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2020-03-30T06:21:11Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Maestría |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/TM |
status_str |
acceptedVersion |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76501 |
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv |
http://bdigital.unal.edu.co/72954/ |
url |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76501 http://bdigital.unal.edu.co/72954/ |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de Química Departamento de Química |
dc.relation.haspart.spa.fl_str_mv |
54 Química y ciencias afines / Chemistry 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology |
dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
Garzón Fajardo, Gustavo Adolfo (2019) Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá. |
dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia |
dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.license.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
institution |
Universidad Nacional de Colombia |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76501/1/Tesis%20de%20maestria%20Gustavo%20G.pdf https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76501/2/Tesis%20de%20maestria%20Gustavo%20G.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
c86034618ca9a1efebae5ecefb24a232 70e856157c80b3ff4d3aeb642150be40 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio_nal@unal.edu.co |
_version_ |
1814089296565501952 |
spelling |
Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Ramírez Hernández, Maria HelenaGarzón Fajardo, Gustavo Adolfo882ebc68-87e1-4c66-98b9-bca3f53b32733002020-03-30T06:21:11Z2020-03-30T06:21:11Z2019https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76501http://bdigital.unal.edu.co/72954/El NADP (H) es una molécula de gran importancia en el metabolismo de todos los seres vivos, caracterizada por la capacidad de donar y aceptar iones hidruro. Dada esta característica, el NADP(H) es usado como cofactor enzimático en múltiples reacciones de oxidoreducción del metabolismo anabólico. Adicionalmente, en la actualidad se ha reconocido su función como molécula de señalización y control del estrés oxidativo. Dicha molécula se obtiene mediante la fosforilación del NAD(H), proceso catalizado por una enzima denominada NAD quinasa (EC. 2.7.1.23), que favorece la transferencia de un grupo fosfato al 2-hidroxi del anillo de ribosa de la molécula de NAD(H). Las NADKs son una familia de proteínas conservada en todos los seres vivos, siendo identificadas por primera vez en S. cereviceae. En la actualidad, se han identificado homólogos de esta proteína tanto en eucariotas como en procariotas, exceptuando el parásito intracelular Chlamidya trachomatis. Sin embargo a pesar de la importancia de las NADK en el funcionamiento celular, su estudio sido poco abordado en parásitos del genero Leishmania, los agentes causales de la enfermedad conocida como Leishmaniasis. En este trabajo se presenta un primer acercamiento al estudio de las NADK en Leishmania spp mediante herramientas computacionales y la caracterización molecular de este, para ello se realizó la clonación, expresión en E. coli, purificación de la proteína recombinante, evaluación de la actividad NAD quinasa de la recombinante obtenida y la producción de anticuerpos para la inmunodetección e inmunolocalización en el parásito. Esto permitió la identificación de candidatos a NADK en 6 especies de Leishmania, de estos, se seleccionó el candidato LbNADK, el cual presento, características estructurales distintivas de este grupo de proteínas, como los motivos GGDG, NE/D, un dominio rico en glicinas en el extremo C-terminal y la presencia de una región variable en la región N-terminal del candidato LbNADK así como diferencias estructurales significativas con sus homologas humanas. La aproximación experimental permitió mediante el uso de proteínas recombinantes la identificación de la primera NADK presente en un parasito intracelular, así como el desarrollo y evaluación de una herramienta inmunológica que permitió el estudio in-vivo de la LbNADK. El estudio in-vivo permitió inmunodetectar en extractos proteicos la proteína LbNADK, la cual presento un tamaño de 135kDa y mediante ensayos de inmunofluorescencia se localizó en el citoplasma del parásito, convirtiéndose no solo en la primera NADK identificada en parásitos intracelulares, sino también la de mayor tamaño y permitiendo ahondar en el estudio del metabolismo energético de LeishmaniaAbstract: NADP (H) is a molecule of great importance in the metabolism of all living beings, characterized by the ability to donate and accept hydride ions. Given this characteristic, NADP (H) is used as an enzymatic cofactor of multiple reactions of anabolic metabolism oxidoreduction. Additionally, its function as a signaling and oxidative stress control molecule has been recognized today. This molecule is obtained by phosphorylation of NAD (H), a process catalyzed by an enzyme called NAD kinase (EC. 2.7.1.23), which favors the transfer of a phosphate group to 2-hydroxy from the ribose ring of the NAD molecule (H). NADKs are a family of proteins conserved in all living beings, being first identified in S. cereviceae. At present, homologs of this protein have been identified in both eukaryotes and prokaryotes, except for the intracellular parasite Chlamidya trachomatis. However, despite the importance of NADK in cellular functioning, their study has been poorly addressed in parasites of the genus Leishmania, the causative agents of the disease known as Leishmaniasis. This paper presents a first approach to the study of NADK in Leishmania spp by means of computational tools and the molecular characterization of this, for this, cloning, expression in E. coli, recombinant protein purification, evaluation of NAD activity was performed The recombinant kinase obtained and the production of antibodies for immunodetection and immunolocation in the parasite. This allowed the identification of NADK candidates in 6 Leishmania species, of these, the candidate LbNADK was selected, which presented distinctive structural characteristics of this group of proteins, such as the GGDG, NE / D motifs, a glycine-rich domain at the C-terminal end and the presence of a variable region in the N-terminal region of the LbNADK candidate as well as significant structural differences with their human counterparts. The experimental approach allowed through the use of recombinant proteins the identification of the first NADK present in an intracellular parasite, as well as the development and evaluation of an immunological tool that allowed the in-vivo study of LbNADK. The in-vivo study allowed to immunodetect in protein extracts the LbNADK protein, which presented a size of 135kDa and by immunofluorescence assays it was located in the cytoplasm of the parasite, becoming not only the first NADK identified in intracellular parasites, but also that of larger and allowing to delve into the study of energy metabolism of LeishmaniaMaestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de QuímicaDepartamento de Química54 Química y ciencias afines / Chemistry57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biologyGarzón Fajardo, Gustavo Adolfo (2019) Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania spp. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.Estudio de un candidato a NAD quinasa en Lesihmania sppTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMNAD quinasaLeishmaniaNAD kinaseORIGINALTesis de maestria Gustavo G.pdfapplication/pdf3541016https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76501/1/Tesis%20de%20maestria%20Gustavo%20G.pdfc86034618ca9a1efebae5ecefb24a232MD51THUMBNAILTesis de maestria Gustavo G.pdf.jpgTesis de maestria Gustavo G.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3546https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76501/2/Tesis%20de%20maestria%20Gustavo%20G.pdf.jpg70e856157c80b3ff4d3aeb642150be40MD52unal/76501oai:repositorio.unal.edu.co:unal/765012023-07-14 23:03:38.277Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |