Subsecuencia Común más Larga en Múltiples Secuencias mediante Medidas de la Información

El problema de la Subsecuencia Común más Larga de Múltiples Secuencias (SCLM), ha sido ampliamente estudiado en Ciencias de la Computación desde hace más de 40 años, motivado principalmente por sus diversas aplicaciones en Bioinformática. Este problema consiste en calcular una subsecuencia de longit...

Full description

Autores:
Sáenz Lesmes, Ross Mary
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2018
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/69250
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/69250
http://bdigital.unal.edu.co/70866/
Palabra clave:
0 Generalidades / Computer science, information and general works
51 Matemáticas / Mathematics
6 Tecnología (ciencias aplicadas) / Technology
Algoritmo heurístico
Alineamiento
Subsecuencia
Entropía
Algorithm heuristic
Sequence
Longest common subsequence
MLCS
Entropy
Alignment
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Description
Summary:El problema de la Subsecuencia Común más Larga de Múltiples Secuencias (SCLM), ha sido ampliamente estudiado en Ciencias de la Computación desde hace más de 40 años, motivado principalmente por sus diversas aplicaciones en Bioinformática. Este problema consiste en calcular una subsecuencia de longitud máxima, común a un conjunto de secuencias dado. En este trabajo se propone un algoritmo heurístico capaz de aproximar una o varias soluciones al problema SCLM utilizando la entropía de Shannon como una medida de la información para determinar los alineamientos que generen las mejores aproximaciones a la solución del problema.