Identificacion de marcadores genéticos del agente causal del marchitamiento del clavel fusarium oxysporum f.sp. dianthi mediante amplificacion arbitraria de fragmentos polimórficos de adn

La técnica de Amplificación Arbitraria de Fragmentos Polimórficos de ADN (RAPD) fue utilizada para identificar marcadores genéticos útiles para el desarrollo de un método diagnóstico para Fusarium oxysporum f.sp. dianthi, el agente etiológico de la enfermedad del marchitamiento del clavel. Con el fi...

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Autores:
Arbeláez, Germán
Hernández, J.
Junca, H.
Posada, M.
Portillo, P. Del
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
1998
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/40872
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/40872
http://bdigital.unal.edu.co/30969/
Palabra clave:
RAPD
Fusarium oxysporum
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description La técnica de Amplificación Arbitraria de Fragmentos Polimórficos de ADN (RAPD) fue utilizada para identificar marcadores genéticos útiles para el desarrollo de un método diagnóstico para Fusarium oxysporum f.sp. dianthi, el agente etiológico de la enfermedad del marchitamiento del clavel. Con el fin de identificar fragmentos genéticos característicos de este patógeno, un total de 18 aislados diferentes, provenientes de diferentes lugares del mundo y 17 cepas de F. oxysporum de otras formas especiales fueron amplificadas utilizando 15 iniciadores diferentes. Aunque ninguno de los iniciadores empleados en este estudio amplificó una banda común a todas las formas especiales dianthi, el iniciador OPA 17 mostró un patrón de RAPD que permitió la identificación de cuatro grupos polimórficos dentro de este grupo taxonómico. Este mismo iniciador, permitió la discriminación entre aislados de Fusarium oxysporum f.sp. dianthi y cepas de F. oxysporum de otras formas especiales. No se observó una correlación directa entre el patrón de RAPD y las razas reportadas para F. oxysporum f.sp. dianthi, previamente determinadas mediante ensayos biológicos por otros grupos de investigadores. Los análisis de hibridación molecular con fragmentos escogidos de estos patrones de RAPD, permitieron el reconocimiento selectivo de los cuatro grupos descritos. Los fragmentos genómicos identificados, son candidatos para el desarrollo de un  sistema diagnóstico por PCR para este patógeno del clavel.
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Con el fin de identificar fragmentos genéticos característicos de este patógeno, un total de 18 aislados diferentes, provenientes de diferentes lugares del mundo y 17 cepas de F. oxysporum de otras formas especiales fueron amplificadas utilizando 15 iniciadores diferentes. Aunque ninguno de los iniciadores empleados en este estudio amplificó una banda común a todas las formas especiales dianthi, el iniciador OPA 17 mostró un patrón de RAPD que permitió la identificación de cuatro grupos polimórficos dentro de este grupo taxonómico. Este mismo iniciador, permitió la discriminación entre aislados de Fusarium oxysporum f.sp. dianthi y cepas de F. oxysporum de otras formas especiales. No se observó una correlación directa entre el patrón de RAPD y las razas reportadas para F. oxysporum f.sp. dianthi, previamente determinadas mediante ensayos biológicos por otros grupos de investigadores. Los análisis de hibridación molecular con fragmentos escogidos de estos patrones de RAPD, permitieron el reconocimiento selectivo de los cuatro grupos descritos. Los fragmentos genómicos identificados, son candidatos para el desarrollo de un  sistema diagnóstico por PCR para este patógeno del clavel.The Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) technique was used to analyse genetic markers useful in developing a method to diagnosis Fusarium oxysporum f.sp. dianthi infections. To identify characteristic genetic fragments of this pathogen, 18 strains were isolated from locations around the world and 17 special forms of F. oxysporum (non-.dianthi F. oxysporum) were amplified using 15 different primers. None of these primers allowed the identification of a single amplification band common to the Fusarium oxysporum f.sp. dianthi samples. However, the OPA 17 primer generated an RAPD pattern that allowed the identification of four amplification groups within this taxonomic group. The same marker permitted to distinguish between the Fusarium oxysporum f.sp. dianthi and the special forms of F. oxysporum. No direct correlation was observed between the RAPD pattern and the race of the samples established in previous works. Molecular hybridization analysis, using the OPA 17 amplified fragments as probes, showed the feasibility of identifying molecular markers that can be used in developing a PCR method for diagnosis of Fusarium oxysporum f.sp. dianthi infections.application/pdfspaUniversidad Nacional de Colombiahttp://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/30031Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de BiotecnologíaRevista Colombiana de BiotecnologíaRevista Colombiana de Biotecnología; Vol. 1, núm. 2 (1998); 51-57 1909-8758 0123-3475Arbeláez, Germán and Hernández, J. and Junca, H. and Posada, M. and Portillo, P. Del (1998) Identificacion de marcadores genéticos del agente causal del marchitamiento del clavel fusarium oxysporum f.sp. dianthi mediante amplificacion arbitraria de fragmentos polimórficos de adn. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 1, núm. 2 (1998); 51-57 1909-8758 0123-3475 .Identificacion de marcadores genéticos del agente causal del marchitamiento del clavel fusarium oxysporum f.sp. dianthi mediante amplificacion arbitraria de fragmentos polimórficos de adnArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTRAPDFusarium oxysporumpolymorphismcarnationRAPDFusarium oxysporumpolimorfismosclavelORIGINAL30031-108091-1-PB.pdfapplication/pdf359047https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/40872/1/30031-108091-1-PB.pdf385644c2ea2dcbb856da3da834152244MD51THUMBNAIL30031-108091-1-PB.pdf.jpg30031-108091-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg10478https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/40872/2/30031-108091-1-PB.pdf.jpg2c6adcbda9c62f223fce789c2be6ba8bMD52unal/40872oai:repositorio.unal.edu.co:unal/408722024-01-27 23:06:22.359Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co

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