Diversidad genética en variedades de caña de azúcar azúcar (saccharum spp.) usando marcadores moleculares

Debido a que el conocimiento de la diversidad genética existente en las variedades modernas de caña de azúcar es de vital importancia para los procesos de mejoramiento, el presente estudio examinó 33 variedades usadas por los mejoradores en CENICAÑA, y cinco clones de Saccharum officinarum mediante...

Full description

Autores:
Riascos, John J.
Victoria, Jorge I.
Angel, Fernando
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2003
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
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Acceso en línea:
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Palabra clave:
Caña de azúcar
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Sugarcane
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description Debido a que el conocimiento de la diversidad genética existente en las variedades modernas de caña de azúcar es de vital importancia para los procesos de mejoramiento, el presente estudio examinó 33 variedades usadas por los mejoradores en CENICAÑA, y cinco clones de Saccharum officinarum mediante la técnica de los microsatélites. Se evaluaron 63 iniciadores los cuales produjeron 263 fragmentos polimórficos. Los patrones electroforéticos generados mediante esta técnica fueron analizados usando los paquetes estadísticos SAS (Análisis de Correspondencia Múltiple) y NTSYS-pc (dendrograma y matriz de distancias genéticas). Los alelos generados por cada iniciador oscilaron entre 1 y 16 (media de 5). Las agrupaciones generadas mediante estos análisis lograron diferenciar las variedades cultivadas de caña de los clones de S. officinarum, y a su vez determinaron que la similitud promedio de todos los individuos fue 0.664. El análisis de diversidad genética mostró un grupo bastante diverso (Ht: 0.973) y logro identificar 38 genotipos en toda la población. Dentro de los resultados más sobresalientes se destaca la ubicación de la variedad CC 91-1880 muy cerca de las variedades Q provenientes de Australia, proponiendo a esta variedad como un buen candidato para ser analizado por los mejoradores. Los resultados de este trabajo son muy importantes, pues deja claro que a pesar de la homogeneidad genética presente en las variedades modernas de caña de azúcar, existen variantes alélicas que podrían ser utilizadas en los nuevos proyectos de mejoramiento de CENICAÑA. Palabras clave: Caña de azúcar, diversidad genética, microsatélites, marcadores moleculares, Saccharum officinarum.
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Los patrones electroforéticos generados mediante esta técnica fueron analizados usando los paquetes estadísticos SAS (Análisis de Correspondencia Múltiple) y NTSYS-pc (dendrograma y matriz de distancias genéticas). Los alelos generados por cada iniciador oscilaron entre 1 y 16 (media de 5). Las agrupaciones generadas mediante estos análisis lograron diferenciar las variedades cultivadas de caña de los clones de S. officinarum, y a su vez determinaron que la similitud promedio de todos los individuos fue 0.664. El análisis de diversidad genética mostró un grupo bastante diverso (Ht: 0.973) y logro identificar 38 genotipos en toda la población. Dentro de los resultados más sobresalientes se destaca la ubicación de la variedad CC 91-1880 muy cerca de las variedades Q provenientes de Australia, proponiendo a esta variedad como un buen candidato para ser analizado por los mejoradores. Los resultados de este trabajo son muy importantes, pues deja claro que a pesar de la homogeneidad genética presente en las variedades modernas de caña de azúcar, existen variantes alélicas que podrían ser utilizadas en los nuevos proyectos de mejoramiento de CENICAÑA. Palabras clave: Caña de azúcar, diversidad genética, microsatélites, marcadores moleculares, Saccharum officinarum.The genetic base of today's sugarcane cultivars appears to be narrow and could be the reason for current slow progress in improving sugarcane crops. Sixty-three primer pairs (producing 263 polymorphic fragments) flanking simple sequence repeats or micro-satellites were used for assessing the genetic variability of five S. officinarum clones and 33 sugarcane cultivars used in CENICAÑA breeding projects, selected for their economic and agronomic im-portance in several Central and South-American countries. NTSYS (Numerical Taxonomy and Multivariate Analy-sis System) and SAS (Statistical Analysis System) statistical software was used to analyse data. The number of alleles recorded per marker ranged from 1 to 16 (mean = 5). Cluster analysis showed a clear separation of cultivars from S. officinarum clones. The average of genetic similarity between sugarcane genotypes studied was 0.664, while genetic diversity analysis revealed a very different group (H: 0.973). An interesting results concerned CC 91-1880 distribu-tion very close to that of Q genotypes from Australia and also S. officinarum clones, suggesting that this cultivar would be a good candidate for further studies by breeders. The results obtained are useful for CENICAÑA's breed­ing program because, in spite of the genetic homogeneity present in today's sugarcane cultivars, it is clear that allelic variants are present in some of these cultivars and could be used in the new breeding projects. Key words: Sugarcane, genetic diversity, microsatellites, molecular markers, Saccharum officinarum.application/pdfspaUniversidad Nacional de Colombiahttp://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/587Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de BiotecnologíaRevista Colombiana de BiotecnologíaRevista Colombiana de Biotecnología; Vol. 5, núm. 1 (2003); 6-15 1909-8758 0123-3475Riascos, John J. and Victoria, Jorge I. and Angel, Fernando (2003) Diversidad genética en variedades de caña de azúcar azúcar (saccharum spp.) usando marcadores moleculares. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 5, núm. 1 (2003); 6-15 1909-8758 0123-3475 .Diversidad genética en variedades de caña de azúcar azúcar (saccharum spp.) usando marcadores molecularesArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTCaña de azúcardiversidad genéticamicrosatélitesmarcadores molecularesSaccharum officinarumSugarcanegenetic diversitymicrosatellitesmolecular markersSaccharum officinarumORIGINAL587-4242-1-PB.docapplication/msword568320https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/22180/1/587-4242-1-PB.doc0e781b3dd4a8589a3d27d3a835100d92MD51587-4241-1-PB.pdfapplication/pdf511657https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/22180/2/587-4241-1-PB.pdf6e32978ebfa8e1ca118a1da43f257121MD52THUMBNAIL587-4241-1-PB.pdf.jpg587-4241-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg8158https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/22180/3/587-4241-1-PB.pdf.jpgdac118dc3d817b9e3eeee9dbcc15b91bMD53unal/22180oai:repositorio.unal.edu.co:unal/221802022-10-13 23:02:37.698Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co