Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe
Título en ingles: Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in Ganoderma australeTítulo en español: Hallazgo de una nueva secuencia codificadora para una proteína inmunomoduladora de origen fúngico en Ganoderma australeSHORT TITLE: A novel hypothetical immunomodulatory prote...
- Autores:
-
González Muñoz, Andrea
Botero Orozco, Kelly Johana
López Gartner, German Ariel
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/52406
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/52406
http://bdigital.unal.edu.co/46743/
http://bdigital.unal.edu.co/46743/3/
- Palabra clave:
- Biología Molecular
Bioinformática
Ganoderma
fungal immunomodulatory protein
immunomodulation
transcriptome
therapeutic
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id |
UNACIONAL2_5306b9bc19f38e6d6440eb74d32dce97 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/52406 |
network_acronym_str |
UNACIONAL2 |
network_name_str |
Universidad Nacional de Colombia |
repository_id_str |
|
dc.title.spa.fl_str_mv |
Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe |
title |
Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe |
spellingShingle |
Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe Biología Molecular Bioinformática Ganoderma fungal immunomodulatory protein immunomodulation transcriptome therapeutic |
title_short |
Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe |
title_full |
Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe |
title_fullStr |
Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe |
title_full_unstemmed |
Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe |
title_sort |
Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe |
dc.creator.fl_str_mv |
González Muñoz, Andrea Botero Orozco, Kelly Johana López Gartner, German Ariel |
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
González Muñoz, Andrea Botero Orozco, Kelly Johana López Gartner, German Ariel |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Biología Molecular Bioinformática Ganoderma fungal immunomodulatory protein immunomodulation transcriptome therapeutic |
topic |
Biología Molecular Bioinformática Ganoderma fungal immunomodulatory protein immunomodulation transcriptome therapeutic |
description |
Título en ingles: Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in Ganoderma australeTítulo en español: Hallazgo de una nueva secuencia codificadora para una proteína inmunomoduladora de origen fúngico en Ganoderma australeSHORT TITLE: A novel hypothetical immunomodulatory protein in Ganoderma australeAbstract: Among the most common human diseases with immune system compromise are autoimmune diseases, cancer, and the acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). Many of these diseases still have no treatment or their therapies have undesirable side effects. This has aroused a great interest in the search for new natural products with therapeutic potential and scientifically proven effects, showing minimal side effects. Formal clinical and pharmacological investigation in various medicinal fungi of the genus Ganoderma (Ganodermataceae) has shown immunomodulatory effects and tumor growth inhibition in mammals, attributable to the presence of immunomodulatory proteins and other secondary metabolites. To date, six fungal immunomodulatory proteins (FIPs) have been reported in Ganoderma. This paper seeks to advance in the discovery of immunomodulatory proteins present in Ganoderma australe, through mycelium transcriptome 454 Roche® pyrosequencing (RNA-seq) and bioinformatics analyses. The results suggest the presence of gene sequences related to an immunomodulatory protein which has been reported only once in other fungal species Taiwanofungus camphoratus. The candidate gene sequences found in G. australe exhibit high identity values in their amino acid composition and predicted protein secondary structure with the protein reported for Tai. camphoratus. According to present knowledge about the action mechanisms of these proteins, it is possible to suggest that this is a promising molecule for the treatment and prevention of diseases associated with certain immune deficiencies, cancer, and other diseases with compromised immune systems. Future studies are proposed in order to determine its immunomodulatory potential using in vitro and in vivo assays. Keywords: Ganoderma, fungal immunomodulatory protein, immunomodulation, transcriptome, therapeuticResumen: Enfermedades comunes como las autoinmunes, el cáncer y el síndrome de inmunodeficiencia adquirida aún no tienen tratamiento o sus terapias tienen efectos secundarios indeseables. Ello ha suscitado el interés en la investigación de bioproductos con potencial terapéutico, que no impliquen efectos secundarios. Investigaciones farmacológicas y clínicas en algunos hongos medicinales del género Ganoderma (Ganodermataceae) han comprobado efectos inmunomoduladores e inhibidores de crecimiento tumoral en mamíferos, atribuibles a la presencia de proteínas fúngicas inmunomoduladoras (FIPs) y otros metabolitos secundarios. Este trabajo busca avanzar en el descubrimiento de proteínas inmunomoduladoras presentes en Ganoderma australe, mediante la secuenciación del transcriptoma de micelio por tecnología de pirosecuenciación 454 Roche® (RNA-seq) y análisis bioinformáticos. Los resultados sugieren la presencia de secuencias génicas relacionadas con una proteína inmunomoduladora que se ha reportado en la especie de hongos Taiwanofungus camphoratus. Las secuencias génicas candidatas halladas en G. australe exhiben una altos valores de similitud en sus predicciones de composición aminoacídica y estructura secundaria proteica con la proteína reportada para Tai. camphoratus. Los mecanismos de acción de este tipo de proteínas inmunomoduladoras sugieren que se trata de una molécula con potencial promisorio para el tratamiento y prevención de enfermedades con compromiso del sistema inmunológico y el cáncer. Se proponen nuevos estudios que permitan determinar el potencial inmunomodulador de la proteína hipotética hallada mediante estudios in vivo e in vitro.Palabras clave: Ganoderma, proteína fúngica inmunomoduladora, inmunomodulación, transcriptoma, terapéuticaRecibido: Febrero 18 de 2014 Aprobado: octubre 10 de 2014 |
publishDate |
2014 |
dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2014-12-01 |
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2019-06-29T14:16:19Z |
dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2019-06-29T14:16:19Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Artículo de revista |
dc.type.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1 |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/ART |
format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/52406 |
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv |
http://bdigital.unal.edu.co/46743/ http://bdigital.unal.edu.co/46743/3/ |
url |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/52406 http://bdigital.unal.edu.co/46743/ http://bdigital.unal.edu.co/46743/3/ |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.spa.fl_str_mv |
http://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/38747 |
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de Biotecnología Revista Colombiana de Biotecnología |
dc.relation.ispartofseries.none.fl_str_mv |
Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 16, núm. 2 (2014); 90-95 1909-8758 0123-3475 |
dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
González Muñoz, Andrea and Botero Orozco, Kelly Johana and López Gartner, German Ariel (2014) Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 16, núm. 2 (2014); 90-95 1909-8758 0123-3475 . |
dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia |
dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.license.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/msword |
dc.publisher.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia |
institution |
Universidad Nacional de Colombia |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/52406/1/38747-233297-1-PB.pdf https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/52406/2/38747-233296-1-PB.docx https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/52406/3/38747-233297-1-PB.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
6aae20a38992e31e73e8a177334a852e 4832f542777d7cbe8a8b4efbfe253ff0 694bb564fa6b96c6d46af60e360bc9f6 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio_nal@unal.edu.co |
_version_ |
1814089253738512384 |
spelling |
Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2González Muñoz, Andrea9c14c148-5d35-4462-8fe9-b07b15104e6d300Botero Orozco, Kelly Johana2ed397ab-145c-436e-a2e1-a04a7da1ea12300López Gartner, German Ariel09ad9db5-49fe-4982-80f0-8e93c08683983002019-06-29T14:16:19Z2019-06-29T14:16:19Z2014-12-01https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/52406http://bdigital.unal.edu.co/46743/http://bdigital.unal.edu.co/46743/3/Título en ingles: Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in Ganoderma australeTítulo en español: Hallazgo de una nueva secuencia codificadora para una proteína inmunomoduladora de origen fúngico en Ganoderma australeSHORT TITLE: A novel hypothetical immunomodulatory protein in Ganoderma australeAbstract: Among the most common human diseases with immune system compromise are autoimmune diseases, cancer, and the acquired immunodeficiency syndrome (AIDS). Many of these diseases still have no treatment or their therapies have undesirable side effects. This has aroused a great interest in the search for new natural products with therapeutic potential and scientifically proven effects, showing minimal side effects. Formal clinical and pharmacological investigation in various medicinal fungi of the genus Ganoderma (Ganodermataceae) has shown immunomodulatory effects and tumor growth inhibition in mammals, attributable to the presence of immunomodulatory proteins and other secondary metabolites. To date, six fungal immunomodulatory proteins (FIPs) have been reported in Ganoderma. This paper seeks to advance in the discovery of immunomodulatory proteins present in Ganoderma australe, through mycelium transcriptome 454 Roche® pyrosequencing (RNA-seq) and bioinformatics analyses. The results suggest the presence of gene sequences related to an immunomodulatory protein which has been reported only once in other fungal species Taiwanofungus camphoratus. The candidate gene sequences found in G. australe exhibit high identity values in their amino acid composition and predicted protein secondary structure with the protein reported for Tai. camphoratus. According to present knowledge about the action mechanisms of these proteins, it is possible to suggest that this is a promising molecule for the treatment and prevention of diseases associated with certain immune deficiencies, cancer, and other diseases with compromised immune systems. Future studies are proposed in order to determine its immunomodulatory potential using in vitro and in vivo assays. Keywords: Ganoderma, fungal immunomodulatory protein, immunomodulation, transcriptome, therapeuticResumen: Enfermedades comunes como las autoinmunes, el cáncer y el síndrome de inmunodeficiencia adquirida aún no tienen tratamiento o sus terapias tienen efectos secundarios indeseables. Ello ha suscitado el interés en la investigación de bioproductos con potencial terapéutico, que no impliquen efectos secundarios. Investigaciones farmacológicas y clínicas en algunos hongos medicinales del género Ganoderma (Ganodermataceae) han comprobado efectos inmunomoduladores e inhibidores de crecimiento tumoral en mamíferos, atribuibles a la presencia de proteínas fúngicas inmunomoduladoras (FIPs) y otros metabolitos secundarios. Este trabajo busca avanzar en el descubrimiento de proteínas inmunomoduladoras presentes en Ganoderma australe, mediante la secuenciación del transcriptoma de micelio por tecnología de pirosecuenciación 454 Roche® (RNA-seq) y análisis bioinformáticos. Los resultados sugieren la presencia de secuencias génicas relacionadas con una proteína inmunomoduladora que se ha reportado en la especie de hongos Taiwanofungus camphoratus. Las secuencias génicas candidatas halladas en G. australe exhiben una altos valores de similitud en sus predicciones de composición aminoacídica y estructura secundaria proteica con la proteína reportada para Tai. camphoratus. Los mecanismos de acción de este tipo de proteínas inmunomoduladoras sugieren que se trata de una molécula con potencial promisorio para el tratamiento y prevención de enfermedades con compromiso del sistema inmunológico y el cáncer. Se proponen nuevos estudios que permitan determinar el potencial inmunomodulador de la proteína hipotética hallada mediante estudios in vivo e in vitro.Palabras clave: Ganoderma, proteína fúngica inmunomoduladora, inmunomodulación, transcriptoma, terapéuticaRecibido: Febrero 18 de 2014 Aprobado: octubre 10 de 2014application/mswordspaUniversidad Nacional de Colombiahttp://revistas.unal.edu.co/index.php/biotecnologia/article/view/38747Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de BiotecnologíaRevista Colombiana de BiotecnologíaRevista Colombiana de Biotecnología; Vol. 16, núm. 2 (2014); 90-95 1909-8758 0123-3475González Muñoz, Andrea and Botero Orozco, Kelly Johana and López Gartner, German Ariel (2014) Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australe. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 16, núm. 2 (2014); 90-95 1909-8758 0123-3475 .Finding of a novel fungal immunomodulatory protein coding sequence in ganoderma australeArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTBiología MolecularBioinformáticaGanodermafungal immunomodulatory proteinimmunomodulationtranscriptometherapeuticORIGINAL38747-233297-1-PB.pdfapplication/pdf1033922https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/52406/1/38747-233297-1-PB.pdf6aae20a38992e31e73e8a177334a852eMD5138747-233296-1-PB.docxapplication/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document2029397https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/52406/2/38747-233296-1-PB.docx4832f542777d7cbe8a8b4efbfe253ff0MD52THUMBNAIL38747-233297-1-PB.pdf.jpg38747-233297-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg8263https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/52406/3/38747-233297-1-PB.pdf.jpg694bb564fa6b96c6d46af60e360bc9f6MD53unal/52406oai:repositorio.unal.edu.co:unal/524062023-02-25 23:04:24.597Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |