Análisis comparativo de las redes metabólicas de metatranscriptomas edáficos de la rizósfera de Solanum phureja en tres diferentes estados fenológicos

Una de las metas principales de la biología es descubrir los principios fundamentales que determinan la estructura y función de las células y los microorganismos. En este sentido, los proyectos de secuenciación a gran escala no solo han proveído la información de genomas completos de un gran número de organismos, sino, que han permitido el desarrollo de bases de datos que integran rutas metabólicas asociadas a su información genética, las cuales proveen la conectividad especifica de mapas metabólicos, así como otro tipo de redes celulares. En el presente trabajo empleó la teoría de grafos para analizar la reconstrucción de redes metabólicas de tres metatranscriptomas obtenidos de muestras de suelo rizosférico de Solanum phureja, bajo condiciones de manejo orgánico en tres diferentes estados fenológicos (emergencia, aporque y floración). A las redes reconstruidas se les realizó un análisis topológico para describir sus características estructurales, encontrándose un omportamiento de escala libre. En cuanto a la composición taxonómica, se encontró diferenciación entre los estados fenológicos a nivel de género especialmente en emergencia y, siendo menos o en algunos casos tendiente a desaparecer entre aporque y floración. A nivel funcional el metabolismo de Carbohidratos, Aminoácidos, Lípidos y Biosíntesis de Vitaminas fueron los que presentaron el mayor porcentaje de funciones enzimáticas asociadas, no obstante, los patrones observados a nivel funcional fueron muy globales y homogéneos entre los tres metatranscriptomas.

• Autores: Bocanegra Silva, Jose Leonardo
• Fecha de publicación: 2015
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/54584
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/54584; http://bdigital.unal.edu.co/49629/
• Palabra clave: 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology; 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture; 66 Ingeniería química y Tecnologías relacionadas/ Chemical engineering; Metatranscriptómica; Redes metabólicas; Teoría de grafos; Metatranscriptomics; Metabolic networks; Graph theory
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional