Construcción de redes de regulación génica usando datos de secuenciación de ARN
La utilización de datos de secuenciación de ARN se ha convertido en un reto en cuanto a la construcción de métodos estadísticos que permitan analizar, entre otras cosas, la interacción de los genes dentro de las células. Esta interacción puede ser vista mediante una red, pues permite observar la for...
- Autores:
-
González Prieto, Cristian Andrés
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2018
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/68651
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/68651
http://bdigital.unal.edu.co/69726/
- Palabra clave:
- 5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
51 Matemáticas / Mathematics
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Redes de Regulación Génica
RNA-Seq
Umbral de similitud
Graphical models
Gene Regulation Network
Similarity threshold
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
| Summary: | La utilización de datos de secuenciación de ARN se ha convertido en un reto en cuanto a la construcción de métodos estadísticos que permitan analizar, entre otras cosas, la interacción de los genes dentro de las células. Esta interacción puede ser vista mediante una red, pues permite observar la forma en cómo los genes se comunican entre sí, proceso conocido como regulación. Se propone una metodología para la construcción de redes de regulación génica de dos maneras distintas: la primera enfocada a la construcción de la red utilizando las características topológicas de la misma. La segunda, haciendo uso de un modelo gráfico que incluya la distribución nodo-condicional de los datos de RNA-Seq; de esta manera abordar el problema desde la visión distribucional y no paramétrica. |
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