Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas

En 330 muestras de ADN de ocho razas bovinas criollas (BON, CQT, CAS, CCC, ChS, HV, RS y SM, dos razas sintéticas colombianas LUC y VEL y dos controles B y H) se evaluó la presencia del VLB (detección de provirus - PCR anidada), los polimorfismos del gen BoLA-DRB3.2* (PCR semianidada - RFLP) y la as...

Full description

Autores:
Hernández Herrera, Darwin Yovanny
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2010
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/70004
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/70004
http://bdigital.unal.edu.co/2137/
Palabra clave:
5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Marcadores genéticos
Genetic markers
Etiología
Aetiology
Polimorfismo genético
Genetic polymorphism
Electroforesis
Electrophoresis
Alelos
Alleles
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_49c3cb7307e26bdb6cfca42f1ea6ccb2
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/70004
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas
title Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas
spellingShingle Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas
5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Marcadores genéticos
Genetic markers
Etiología
Aetiology
Polimorfismo genético
Genetic polymorphism
Electroforesis
Electrophoresis
Alelos
Alleles
title_short Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas
title_full Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas
title_fullStr Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas
title_full_unstemmed Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas
title_sort Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas
dc.creator.fl_str_mv Hernández Herrera, Darwin Yovanny
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Hernández Herrera, Darwin Yovanny
dc.contributor.spa.fl_str_mv Alvarez Franco, Luz Angela
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv 5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
topic 5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture
Marcadores genéticos
Genetic markers
Etiología
Aetiology
Polimorfismo genético
Genetic polymorphism
Electroforesis
Electrophoresis
Alelos
Alleles
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Marcadores genéticos
Genetic markers
Etiología
Aetiology
Polimorfismo genético
Genetic polymorphism
Electroforesis
Electrophoresis
Alelos
Alleles
description En 330 muestras de ADN de ocho razas bovinas criollas (BON, CQT, CAS, CCC, ChS, HV, RS y SM, dos razas sintéticas colombianas LUC y VEL y dos controles B y H) se evaluó la presencia del VLB (detección de provirus - PCR anidada), los polimorfismos del gen BoLA-DRB3.2* (PCR semianidada - RFLP) y la asociación entre ambos (OR). Se encontró menor porcentaje de presencia del VLB en las razas criollas (31,3%) y colombianas que en las controles (38,2%) siendo mayor en los ganados de la región Andina que en los Llanos y Norte de Colombia, mayor presencia en las hembras que en los machos, mayor en los ganados de leche que en los de carne, se determinó que la presencia del virus depende de la raza. Se determinaron 41 alelos BoLA-DRB3.2* los más frecuentes fueron *28, *37, *24, *23, *20, *27, *8, *16, *39 (0.17, 0.11, 0.10, 0.09, 0.09, 0.07, 0.07 y 0.06 respectivamente), alta diversidad genética (He = 0.878), una diferenciación genética altamente significativa (Fst= 0.044) al igual que el coeficiente de endogamia (Fis = 0.249) similares a otros ganados criollos de Suramérica. Se estimaron asociaciones entre la ausencia (resistentes) del VLB y los alelos *21, *24 y *37 y entre la presencia (susceptibles) del VLB y los alelos *6 y *42 en los ganados criollos; en los ganados controles se encontró asociación positiva con el alelo *13 y negativa con los alelos *23 y *28. El 10% de los individuos fue genotipificado como RR el 2.5% como SS y el 57% fue de genotipo neutral (NN). Los resultados indican que el ganado criollo colombiano posee genes de resistencia a enfermedades.
publishDate 2010
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2010-05-26
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2019-07-03T13:06:15Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2019-07-03T13:06:15Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Maestría
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TM
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/70004
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/2137/
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/70004
http://bdigital.unal.edu.co/2137/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira Facultad de Ciencias Agropecuarias Maestría Ciencias Agrarias
Maestría Ciencias Agrarias
dc.relation.references.spa.fl_str_mv Hernández Herrera, Darwin Yovanny (2010) Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira.
dc.rights.spa.fl_str_mv Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/70004/1/7408003.2010.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/70004/2/7408003.2010.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv f1f9286526d7d37366859ffbffca184d
8f73f4d1530bebdb1a3b2a85b5b46778
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1814089726513119232
spelling Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Alvarez Franco, Luz AngelaHernández Herrera, Darwin Yovannybfc995a5-c639-43c0-96a2-3cf120e70a4c3002019-07-03T13:06:15Z2019-07-03T13:06:15Z2010-05-26https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/70004http://bdigital.unal.edu.co/2137/En 330 muestras de ADN de ocho razas bovinas criollas (BON, CQT, CAS, CCC, ChS, HV, RS y SM, dos razas sintéticas colombianas LUC y VEL y dos controles B y H) se evaluó la presencia del VLB (detección de provirus - PCR anidada), los polimorfismos del gen BoLA-DRB3.2* (PCR semianidada - RFLP) y la asociación entre ambos (OR). Se encontró menor porcentaje de presencia del VLB en las razas criollas (31,3%) y colombianas que en las controles (38,2%) siendo mayor en los ganados de la región Andina que en los Llanos y Norte de Colombia, mayor presencia en las hembras que en los machos, mayor en los ganados de leche que en los de carne, se determinó que la presencia del virus depende de la raza. Se determinaron 41 alelos BoLA-DRB3.2* los más frecuentes fueron *28, *37, *24, *23, *20, *27, *8, *16, *39 (0.17, 0.11, 0.10, 0.09, 0.09, 0.07, 0.07 y 0.06 respectivamente), alta diversidad genética (He = 0.878), una diferenciación genética altamente significativa (Fst= 0.044) al igual que el coeficiente de endogamia (Fis = 0.249) similares a otros ganados criollos de Suramérica. Se estimaron asociaciones entre la ausencia (resistentes) del VLB y los alelos *21, *24 y *37 y entre la presencia (susceptibles) del VLB y los alelos *6 y *42 en los ganados criollos; en los ganados controles se encontró asociación positiva con el alelo *13 y negativa con los alelos *23 y *28. El 10% de los individuos fue genotipificado como RR el 2.5% como SS y el 57% fue de genotipo neutral (NN). Los resultados indican que el ganado criollo colombiano posee genes de resistencia a enfermedades.//Abstract: 330 DNA samples from 8 Creole bovine breeds (BON, CQT, CAS, CCC, ChS, HV, RS and SM), 2 Colombian breeds synthetics (LUC and VEL) and 2 controls (B and H) were evaluated for the presence of VLB (provirus detection – Nested PCR), BoLA-DRB3.2* gen polymorphism (Nested PCR – RFLP) and its association each other (OR). Less percentage of VLB in Creole (31,3%) and Colombian breeds (38,2%) was found than in control breeds (38,2%), being higher in animals from Andean region than in West valleys and North region, a greater presence in females than in males, higher in milk cattle for meat. We determinate that presence of virus depends on breed cattle. 41 alleles of BoLA-DRB3.2* were detected, being *28, *37, *24, *23, *20, *27, *8, *16, *39 those with higher frequency (0.17, 0.11, 0.10, 0.09, 0.09, 0.07, 0.07 y 0.06 respectively), high genetic diversity (He = 0.878), genetic differentiation highly significant (Fst=0.044) and inbreeding coefficient (Fis = 0.249) similar to other Creole South American breeds. Relation between absence of VLB (resistant) and *21, *24, *37 alleles and presence (susceptible) and *6, *42 alleles was found in cattle Creoles in controls gained positive association was found with allele * 13 and negative with alleles * 23 and * 28. 10% of samples were genotypified as RR, 2.5% as SS and 57% as a neutral genotype. Results shown that Colombian Creole breeds have important disease resistant genes.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Palmira Facultad de Ciencias Agropecuarias Maestría Ciencias AgrariasMaestría Ciencias AgrariasHernández Herrera, Darwin Yovanny (2010) Asociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianas. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira.5 Ciencias naturales y matemáticas / Science63 Agricultura y tecnologías relacionadas / AgricultureMarcadores genéticosGenetic markersEtiologíaAetiologyPolimorfismo genéticoGenetic polymorphismElectroforesisElectrophoresisAlelosAllelesAsociación del Locus bola-DRB3.2 con el virus de la leucosis bovina en razas criollas y colombianasTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINAL7408003.2010.pdfapplication/pdf817998https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/70004/1/7408003.2010.pdff1f9286526d7d37366859ffbffca184dMD51THUMBNAIL7408003.2010.pdf.jpg7408003.2010.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3755https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/70004/2/7408003.2010.pdf.jpg8f73f4d1530bebdb1a3b2a85b5b46778MD52unal/70004oai:repositorio.unal.edu.co:unal/700042024-06-03 23:09:38.015Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co