Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region

Characterization of the genetic diversity of Rhinoclemmys nasuta population inhabits Isla Palma (Malaga Bay, Valle del Cauca)was carried out using three microsatellite systems (Cm72, Cm58 and Cm3). In this locality, individuals of  R. nasutaare widely distributed in the inland streams and creeks sys...

Full description

Autores:
Castillo Cutiva, Leslie Anais
Barreto, Guillermo
Giraldo, Alan
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2014
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/49021
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/49021
http://bdigital.unal.edu.co/42478/
http://bdigital.unal.edu.co/42478/2/
Palabra clave:
turtles
large-nosed wood turtle
conservation
Colombia
Neotropical turtles
Chocó.
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_4984b194f596a29f2351f6c64a0d2baa
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/49021
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region
title Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region
spellingShingle Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region
turtles
large-nosed wood turtle
conservation
Colombia
Neotropical turtles
Chocó.
title_short Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region
title_full Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region
title_fullStr Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region
title_full_unstemmed Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region
title_sort Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region
dc.creator.fl_str_mv Castillo Cutiva, Leslie Anais
Barreto, Guillermo
Giraldo, Alan
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Castillo Cutiva, Leslie Anais
Barreto, Guillermo
Giraldo, Alan
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv turtles
large-nosed wood turtle
conservation
Colombia
Neotropical turtles
Chocó.
topic turtles
large-nosed wood turtle
conservation
Colombia
Neotropical turtles
Chocó.
description Characterization of the genetic diversity of Rhinoclemmys nasuta population inhabits Isla Palma (Malaga Bay, Valle del Cauca)was carried out using three microsatellite systems (Cm72, Cm58 and Cm3). In this locality, individuals of  R. nasutaare widely distributed in the inland streams and creeks system. 100 to 200 ìL of peripheral blood was taken off from 10 turtles in five streams of theisland, preserving samples in in a 0.5 M EDTA. DNA was extracted using Salting-out and Chelex 100 solutiontechniques. PCR amplified products were visualized and measured in polyacrylamide gels (19:1) to 8 % silver nitrate. Successful amplification products were obtained for all systems analyzed, two of which (Cm72 and Cm3) were found to be monomorphic, while the system Cm58had a high PIC (0.698) allowing to estimate the genetic diversity of this population. The observed heterozygosity was low (Ho = 0.26 ) and inbreeding indices FIS and FIT were high (0.67857 and 0.67881 ), indicating an excess of homozygotes in each of the rivers and for the all population. The molecular analysis of variance suggested that there is no difference in genetic structure of the population (FST= 0.00075,p= 0.95112 ). Therefore, the results suggest that the genetic diversity of R. nasutapopulation in Isla Palma was low and exhibited a highly inbred index.DIVERSIDAD GENÉTICA EN UNA POBLACION DE Rhinoclemmys nasuta (TESTUDINES:GEOEMYDIDAE) ASOCIADA A UN AMBIENTE INSULAR DEL CHOCÓ BIOGEOGRÁFICOSe realizó la caracterización de la diversidad genética de la población de Rhinoclemmys nasuta, que habita en la localidad insular de Isla Palma, Bahía Málaga (Valle del Cauca, Colombia), utilizando tres sistemas de microsatélites (Cm72, Cm58 y Cm3). En esta localidad, R. nasuta se encuentra ampliamente distribuida en los sistemas de riachuelos y quebradas presentes. Se tomaron entre 100 a 200 µL de sangre periférica de 10 tortugas en cinco riachuelos, preservando las muestras en una solución 0,5 M de EDTA y el ADN fue extraído mediante las técnicas de Salting-out y Chelex 100. Los productos amplificados por PCR fueron visualizados y medidos en geles de poliacrilamida (19:1) al 8% con nitrato de plata. Se obtuvieron productos amplificados exitosos para todos los sistemas analizados, dos de los cuales (Cm72 y Cm3) resultaron ser monomórficos, mientras que el sistema Cm58 presentó un PIC alto (0,698) permitiendo estimar la diversidad genética de esta población. La heterocigosidad observada fue baja (Ho = 0,26) y los índices de endogamia FIS y FITfueron altos (0,67857 y 0,67881), indicando un exceso de homocigotos en cada uno de los ríos y para la población total. El Análisis Molecular de Varianza sugirió que no existe estructura genética diferencialen esta población (FST = 0.00075; p = 0.95112). En conclusión los resultados sugieren que la diversidad genética de la población de R. nasuta en Isla Palma es baja, siendo una población altamente endogámica.
publishDate 2014
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2014-07-29
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2019-06-29T08:20:12Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2019-06-29T08:20:12Z
dc.type.spa.fl_str_mv Artículo de revista
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.coar.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/ART
format http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/49021
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/42478/
http://bdigital.unal.edu.co/42478/2/
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/49021
http://bdigital.unal.edu.co/42478/
http://bdigital.unal.edu.co/42478/2/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.spa.fl_str_mv http://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/42776
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Acta Biológica Colombiana
Acta Biológica Colombiana
dc.relation.ispartofseries.none.fl_str_mv Acta Biológica Colombiana; Vol. 19, núm. 3 (2014): Tortugas de Colombia; 513-519 Acta Biológica Colombiana; Vol. 19, núm. 3 (2014): Tortugas de Colombia; 513-519 1900-1649 0120-548X
dc.relation.references.spa.fl_str_mv Castillo Cutiva, Leslie Anais and Barreto, Guillermo and Giraldo, Alan (2014) Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region. Acta Biológica Colombiana; Vol. 19, núm. 3 (2014): Tortugas de Colombia; 513-519 Acta Biológica Colombiana; Vol. 19, núm. 3 (2014): Tortugas de Colombia; 513-519 1900-1649 0120-548X .
dc.rights.spa.fl_str_mv Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/1/42776-197772-1-SP.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/2/42776-215287-1-PB.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/3/42776-213284-1-SP.jpg
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/4/42776-197772-1-SP.pdf.jpg
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/5/42776-215287-1-PB.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 0651cc7fbf78f345de8da2e6ca87d4e8
f92af696861dfbdee90cca3b00e4bc35
d105b11f85824e25658ea7f3803d6a19
8dc34f3b752119a5383e11765cb2cb28
35b2bbcc5f89153a568909d0cf5019c3
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1814089773938114560
spelling Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Castillo Cutiva, Leslie Anais0ae48d73-c947-4ff5-80e7-b90a872858b6300Barreto, Guillermo0430b30f-993c-43dc-9baa-a7829a420146300Giraldo, Alan5e731d14-0471-401a-b5c6-06fa1735f7163002019-06-29T08:20:12Z2019-06-29T08:20:12Z2014-07-29https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/49021http://bdigital.unal.edu.co/42478/http://bdigital.unal.edu.co/42478/2/Characterization of the genetic diversity of Rhinoclemmys nasuta population inhabits Isla Palma (Malaga Bay, Valle del Cauca)was carried out using three microsatellite systems (Cm72, Cm58 and Cm3). In this locality, individuals of  R. nasutaare widely distributed in the inland streams and creeks system. 100 to 200 ìL of peripheral blood was taken off from 10 turtles in five streams of theisland, preserving samples in in a 0.5 M EDTA. DNA was extracted using Salting-out and Chelex 100 solutiontechniques. PCR amplified products were visualized and measured in polyacrylamide gels (19:1) to 8 % silver nitrate. Successful amplification products were obtained for all systems analyzed, two of which (Cm72 and Cm3) were found to be monomorphic, while the system Cm58had a high PIC (0.698) allowing to estimate the genetic diversity of this population. The observed heterozygosity was low (Ho = 0.26 ) and inbreeding indices FIS and FIT were high (0.67857 and 0.67881 ), indicating an excess of homozygotes in each of the rivers and for the all population. The molecular analysis of variance suggested that there is no difference in genetic structure of the population (FST= 0.00075,p= 0.95112 ). Therefore, the results suggest that the genetic diversity of R. nasutapopulation in Isla Palma was low and exhibited a highly inbred index.DIVERSIDAD GENÉTICA EN UNA POBLACION DE Rhinoclemmys nasuta (TESTUDINES:GEOEMYDIDAE) ASOCIADA A UN AMBIENTE INSULAR DEL CHOCÓ BIOGEOGRÁFICOSe realizó la caracterización de la diversidad genética de la población de Rhinoclemmys nasuta, que habita en la localidad insular de Isla Palma, Bahía Málaga (Valle del Cauca, Colombia), utilizando tres sistemas de microsatélites (Cm72, Cm58 y Cm3). En esta localidad, R. nasuta se encuentra ampliamente distribuida en los sistemas de riachuelos y quebradas presentes. Se tomaron entre 100 a 200 µL de sangre periférica de 10 tortugas en cinco riachuelos, preservando las muestras en una solución 0,5 M de EDTA y el ADN fue extraído mediante las técnicas de Salting-out y Chelex 100. Los productos amplificados por PCR fueron visualizados y medidos en geles de poliacrilamida (19:1) al 8% con nitrato de plata. Se obtuvieron productos amplificados exitosos para todos los sistemas analizados, dos de los cuales (Cm72 y Cm3) resultaron ser monomórficos, mientras que el sistema Cm58 presentó un PIC alto (0,698) permitiendo estimar la diversidad genética de esta población. La heterocigosidad observada fue baja (Ho = 0,26) y los índices de endogamia FIS y FITfueron altos (0,67857 y 0,67881), indicando un exceso de homocigotos en cada uno de los ríos y para la población total. El Análisis Molecular de Varianza sugirió que no existe estructura genética diferencialen esta población (FST = 0.00075; p = 0.95112). En conclusión los resultados sugieren que la diversidad genética de la población de R. nasuta en Isla Palma es baja, siendo una población altamente endogámica.application/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia, Facultad de Ciencias, Departamento de Biologíahttp://revistas.unal.edu.co/index.php/actabiol/article/view/42776Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Acta Biológica ColombianaActa Biológica ColombianaActa Biológica Colombiana; Vol. 19, núm. 3 (2014): Tortugas de Colombia; 513-519 Acta Biológica Colombiana; Vol. 19, núm. 3 (2014): Tortugas de Colombia; 513-519 1900-1649 0120-548XCastillo Cutiva, Leslie Anais and Barreto, Guillermo and Giraldo, Alan (2014) Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic region. Acta Biológica Colombiana; Vol. 19, núm. 3 (2014): Tortugas de Colombia; 513-519 Acta Biológica Colombiana; Vol. 19, núm. 3 (2014): Tortugas de Colombia; 513-519 1900-1649 0120-548X .Genetic diversity in a population of rhinoclemmys nasuta (testu-dines:geoemydidae) associatted with an insular locality in the chocó biogeographic regionArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTturtleslarge-nosed wood turtleconservationColombiaNeotropical turtlesChocó.ORIGINAL42776-197772-1-SP.pdfapplication/pdf303054https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/1/42776-197772-1-SP.pdf0651cc7fbf78f345de8da2e6ca87d4e8MD5142776-215287-1-PB.pdfapplication/pdf697617https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/2/42776-215287-1-PB.pdff92af696861dfbdee90cca3b00e4bc35MD5242776-213284-1-SP.jpgimage/jpeg693487https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/3/42776-213284-1-SP.jpgd105b11f85824e25658ea7f3803d6a19MD53THUMBNAIL42776-197772-1-SP.pdf.jpg42776-197772-1-SP.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg6855https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/4/42776-197772-1-SP.pdf.jpg8dc34f3b752119a5383e11765cb2cb28MD5442776-215287-1-PB.pdf.jpg42776-215287-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9773https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/49021/5/42776-215287-1-PB.pdf.jpg35b2bbcc5f89153a568909d0cf5019c3MD55unal/49021oai:repositorio.unal.edu.co:unal/490212022-11-13 23:03:35.722Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co