Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie

Spodoptera frugiperda es un insecto migratorio que es considerado una plaga importante en cultivos de maíz, sorgo, arroz, algodón y pastos en Norte y Sur América. Esta especie está compuesta por dos biotipos, “arroz y maíz” que son idénticos morfológicamente pero que difieren en características gené...

Full description

Autores:
Salinas Hernández, Haidy
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2010
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/69966
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/69966
http://bdigital.unal.edu.co/2096/
Palabra clave:
59 Animales / Animals
Spodoptera frugiperda
Haplotipos
Polimorfismo genético
Control de plagas
Análisis de varianza
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_46c63d9c6c2c8eb13ae630eaa9844eb9
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/69966
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie
title Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie
spellingShingle Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie
59 Animales / Animals
Spodoptera frugiperda
Haplotipos
Polimorfismo genético
Control de plagas
Análisis de varianza
title_short Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie
title_full Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie
title_fullStr Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie
title_full_unstemmed Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie
title_sort Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie
dc.creator.fl_str_mv Salinas Hernández, Haidy
dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv Saldamando Benjumea, Clara Inés (Thesis advisor)
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Salinas Hernández, Haidy
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv 59 Animales / Animals
topic 59 Animales / Animals
Spodoptera frugiperda
Haplotipos
Polimorfismo genético
Control de plagas
Análisis de varianza
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Spodoptera frugiperda
Haplotipos
Polimorfismo genético
Control de plagas
Análisis de varianza
description Spodoptera frugiperda es un insecto migratorio que es considerado una plaga importante en cultivos de maíz, sorgo, arroz, algodón y pastos en Norte y Sur América. Esta especie está compuesta por dos biotipos, “arroz y maíz” que son idénticos morfológicamente pero que difieren en características genéticas, fisiológicas y de asilamiento reproductivo. En estos dos biotipos se han secuenciado los genes del citocromo oxidasa I, II e ITS1 en diferentes poblaciones de Estados Unidos y Brasil. Sin embargo, este tipo de estudios no se ha llevado a cabo en Colombia. A partir de la secuenciación de un fragmento del gen mitocondrial COI en 40 individuos para el Tolima y 102 individuos para Colombia, se encontró: 18 haplotipos en Tolima y 43 dentro de Colombia. Se determinó que existe una mayor frecuencia del haplotipo 1 en los cultivos evaluados tanto para Tolima como para Colombia, indicando que éste es probablemente el haplotipo blanco dentro de los programas de monitoreo de esta plaga. Los resultados del AMOVA mostraron que los haplotipos de S. frugiperda no producen poblaciones genéticamente estructuradas para los cultivos analizados dentro del departamento de Tolima (FST = 0.000001, P 0.005). Contrario a esto, si se encontró estructuración genética para los departamentos colombianos y las poblaciones norteamericanas (FST = 0.76812, P 0.001). El árbol de N-J para Tolima tuvo una tendencia a asociar híbridos y biotipos según el origen materno del gen COI. El árbol para Colombia no generó agrupaciones ni por asociación a planta hospedera ni por áreas geográficas. Las redes de expansión mínima corroboraron la alta frecuencia del haplotipo 1, encontrada con otro tipo de análisis. Los resultados de este estudio sugieren que este método de secuenciación es útil para establecerlo en el sistema de monitoreo de esta especie. / Abstract Spodoptera frugiperda is a migratory insect that is considered a major pest in corn, sorghum, rice, cotton and pasture in North and South America. This species comprises two biotypes "corn rice" that are morphologically identical but differ in genetic characteristics, physiological and reproductive isolation. These two biotypes have sequenced the genes of cytochrome oxidase I, II and ITS1 in different populations of the United States and Brazil. However, such studies have not been carried out in Colombia. From the sequencing of a fragment of mitochondrial COI gene in 40 individuals for the Tolima and 102 individuals in Colombia, was found: 18 and 43 haplotypes in Tolima in Colombia. It was determined that there is a higher frequency of haplotype 1 in all crops both to Colombia Tolima, indicating that this is probably the haplotype white in monitoring programs for this pest. The results of AMOVA showed that the haplotypes of S. frugiperda populations that are genetically not structured to produce the crops surveyed in the department of Tolima (FST = 0.000001, P 0,005). Contrary to this, if genetic structure was found to the Colombian departments and American populations (FST = 0.76812, P 0.001). The NJ tree for Tolima had a tendency to associate hybrid biotypes according to the maternal origin of the COI gene. The tree for Colombia did not produce groupings or by association with host plant or geographical areas. The minimum spanning networks confirmed the high frequency of haplotype 1, found with other types of analysis. The results of this study suggest that this method of sequencing is useful to set the monitoring system of this species.
publishDate 2010
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2010
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2019-07-03T13:05:12Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2019-07-03T13:05:12Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Maestría
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TM
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/69966
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/2096/
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/69966
http://bdigital.unal.edu.co/2096/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Sede Medellín Facultad de Ciencias Escuela de Biociencias
Escuela de Biociencias
dc.relation.references.spa.fl_str_mv Salinas Hernández, Haidy (2010) Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.
dc.rights.spa.fl_str_mv Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/69966/1/52822467.2010.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/69966/2/52822467.2010.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv f14c954514e34282d123e5d28a90b0b1
25b3f563ee5c21f05c60449f178ce4ab
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1814089681122361344
spelling Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Saldamando Benjumea, Clara Inés (Thesis advisor)3c053c0c-bb83-46b8-99e2-6ccf2dcbc7e0-1Salinas Hernández, Haidyf8190fe7-f380-43f7-ae86-6da05a604c133002019-07-03T13:05:12Z2019-07-03T13:05:12Z2010https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/69966http://bdigital.unal.edu.co/2096/Spodoptera frugiperda es un insecto migratorio que es considerado una plaga importante en cultivos de maíz, sorgo, arroz, algodón y pastos en Norte y Sur América. Esta especie está compuesta por dos biotipos, “arroz y maíz” que son idénticos morfológicamente pero que difieren en características genéticas, fisiológicas y de asilamiento reproductivo. En estos dos biotipos se han secuenciado los genes del citocromo oxidasa I, II e ITS1 en diferentes poblaciones de Estados Unidos y Brasil. Sin embargo, este tipo de estudios no se ha llevado a cabo en Colombia. A partir de la secuenciación de un fragmento del gen mitocondrial COI en 40 individuos para el Tolima y 102 individuos para Colombia, se encontró: 18 haplotipos en Tolima y 43 dentro de Colombia. Se determinó que existe una mayor frecuencia del haplotipo 1 en los cultivos evaluados tanto para Tolima como para Colombia, indicando que éste es probablemente el haplotipo blanco dentro de los programas de monitoreo de esta plaga. Los resultados del AMOVA mostraron que los haplotipos de S. frugiperda no producen poblaciones genéticamente estructuradas para los cultivos analizados dentro del departamento de Tolima (FST = 0.000001, P 0.005). Contrario a esto, si se encontró estructuración genética para los departamentos colombianos y las poblaciones norteamericanas (FST = 0.76812, P 0.001). El árbol de N-J para Tolima tuvo una tendencia a asociar híbridos y biotipos según el origen materno del gen COI. El árbol para Colombia no generó agrupaciones ni por asociación a planta hospedera ni por áreas geográficas. Las redes de expansión mínima corroboraron la alta frecuencia del haplotipo 1, encontrada con otro tipo de análisis. Los resultados de este estudio sugieren que este método de secuenciación es útil para establecerlo en el sistema de monitoreo de esta especie. / Abstract Spodoptera frugiperda is a migratory insect that is considered a major pest in corn, sorghum, rice, cotton and pasture in North and South America. This species comprises two biotypes "corn rice" that are morphologically identical but differ in genetic characteristics, physiological and reproductive isolation. These two biotypes have sequenced the genes of cytochrome oxidase I, II and ITS1 in different populations of the United States and Brazil. However, such studies have not been carried out in Colombia. From the sequencing of a fragment of mitochondrial COI gene in 40 individuals for the Tolima and 102 individuals in Colombia, was found: 18 and 43 haplotypes in Tolima in Colombia. It was determined that there is a higher frequency of haplotype 1 in all crops both to Colombia Tolima, indicating that this is probably the haplotype white in monitoring programs for this pest. The results of AMOVA showed that the haplotypes of S. frugiperda populations that are genetically not structured to produce the crops surveyed in the department of Tolima (FST = 0.000001, P 0,005). Contrary to this, if genetic structure was found to the Colombian departments and American populations (FST = 0.76812, P 0.001). The NJ tree for Tolima had a tendency to associate hybrid biotypes according to the maternal origin of the COI gene. The tree for Colombia did not produce groupings or by association with host plant or geographical areas. The minimum spanning networks confirmed the high frequency of haplotype 1, found with other types of analysis. The results of this study suggest that this method of sequencing is useful to set the monitoring system of this species.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Medellín Facultad de Ciencias Escuela de BiocienciasEscuela de BiocienciasSalinas Hernández, Haidy (2010) Identificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especie. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.59 Animales / AnimalsSpodoptera frugiperdaHaplotiposPolimorfismo genéticoControl de plagasAnálisis de varianzaIdentificación de haplotipos de Spodoptera frugiperda en algunas poblaciones de Colombia para el estudio del comportamiento migratorio de la especieTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINAL52822467.2010.pdfapplication/pdf903863https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/69966/1/52822467.2010.pdff14c954514e34282d123e5d28a90b0b1MD51THUMBNAIL52822467.2010.pdf.jpg52822467.2010.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg3734https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/69966/2/52822467.2010.pdf.jpg25b3f563ee5c21f05c60449f178ce4abMD52unal/69966oai:repositorio.unal.edu.co:unal/699662023-06-11 23:03:14.654Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co