Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer
A pesar que las simulaciones basadas en la aproximación de Born-Oppenheimer (ABO) resultan adecuadas para describir un amplio número de sistemas moleculares, cada vez es más evidente que dichas simulaciones deben incorporar efectos cuánticos diferentes a los electrónicos. Esto se hace patente si se...
- Autores:
-
González Mónico, Sergio Arquimedes
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2010
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/6912
- Palabra clave:
- 54 Química y ciencias afines / Chemistry
Puentes de hidrógeno
Efectos de isótopo
Metodología no Born-Oppenheimer
Orbitales moleculares nucleares y electrónicos
Hydrogen bonds
Isotope effects
Non Born-Oppenheimer methodology
Nuclear and electronic molecular orbitals
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id |
UNACIONAL2_3e7b83606619e026521c6919abc82107 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/6912 |
network_acronym_str |
UNACIONAL2 |
network_name_str |
Universidad Nacional de Colombia |
repository_id_str |
|
dc.title.spa.fl_str_mv |
Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer |
dc.title.translated.Spa.fl_str_mv |
Theoretical study of the isotope effects on hydrogen bonds and its application to water aggregates using a non Born-Oppenheimer methodology |
title |
Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer |
spellingShingle |
Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer 54 Química y ciencias afines / Chemistry Puentes de hidrógeno Efectos de isótopo Metodología no Born-Oppenheimer Orbitales moleculares nucleares y electrónicos Hydrogen bonds Isotope effects Non Born-Oppenheimer methodology Nuclear and electronic molecular orbitals |
title_short |
Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer |
title_full |
Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer |
title_fullStr |
Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer |
title_full_unstemmed |
Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer |
title_sort |
Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer |
dc.creator.fl_str_mv |
González Mónico, Sergio Arquimedes |
dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv |
Reyes Velasco, Andrés (Thesis advisor) |
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
González Mónico, Sergio Arquimedes |
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv |
54 Química y ciencias afines / Chemistry |
topic |
54 Química y ciencias afines / Chemistry Puentes de hidrógeno Efectos de isótopo Metodología no Born-Oppenheimer Orbitales moleculares nucleares y electrónicos Hydrogen bonds Isotope effects Non Born-Oppenheimer methodology Nuclear and electronic molecular orbitals |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Puentes de hidrógeno Efectos de isótopo Metodología no Born-Oppenheimer Orbitales moleculares nucleares y electrónicos Hydrogen bonds Isotope effects Non Born-Oppenheimer methodology Nuclear and electronic molecular orbitals |
description |
A pesar que las simulaciones basadas en la aproximación de Born-Oppenheimer (ABO) resultan adecuadas para describir un amplio número de sistemas moleculares, cada vez es más evidente que dichas simulaciones deben incorporar efectos cuánticos diferentes a los electrónicos. Esto se hace patente si se pretenden estudiar fenómenos como el cambio que experimenta densidad electrónica de las moléculas en función de su entorno (por ejemplo debido al movimiento nuclear o las sustituciones isotópicas), o la transferencia de núcleos de hidrógeno en sistemas enlazados por puentes de hidrógeno. Para corregir las falencias de métodos Born-Oppenheimer para el estudio de los fenómenos antes mencionados, se han propuesto métodos que van más allá de la ABO como el método del Orbital Molecular Nuclear y Electrónico (OMNE). En este trabajo se implementó computacionalmente el método OMNE a niveles de teoría Hartree-Fock(HF) y Moller-Plesser de segundo orden (MP2). El programa desarrollado fue aplicado al estudio de efectos de isótopo en dímeros de agua, lográndose reproducir exitosamente los resultados y tendencias experimentales. Los resultados de este trabajo serán claves en investigaciones posteriores sobre efectos de isótopo en agregados de agua de mayor tamaño, al igual que en estudios de la dinámica molecular del agua y de especies solvatadas. / Abstract. Despite that the simulations based on the Born-Oppenheimer approximation are appropriate to describe a large number of molecular systems, is evident that those simulations should consider quantum effects different to quantum electronic effects. That is important if we wish to study phenomena as the change on the electronic density of the molecules, in function of its surrounding (i.e. due to nuclear movement or due to isotope substitution), or the hydrogen nuclei transfer between systems bonded by hydrogen bonds. To correct the failures of the Born-Oppenheimer methodologies to study the phenomena before referred, have been proposed methodologies beyond of the Born-Oppenheimer approximation, as the Nuclear and Electronic Molecular Orbital Method (NEMO). We have coded the NEMO method at Hartree-Fock (HF) and second order Moller-Plesser (MP2) levels of theory. The developed code was applied to study isotope effects on water dimers. We have reproduced results and experimental trends. The results of this work will be key to investigate isotope effects on larger water aggregates and to study the molecular dynamics of the water and solvated species. |
publishDate |
2010 |
dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2010-05 |
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2019-06-24T16:26:48Z |
dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2019-06-24T16:26:48Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Maestría |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/TM |
status_str |
acceptedVersion |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/6912 |
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv |
http://bdigital.unal.edu.co/3165/ |
url |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/6912 http://bdigital.unal.edu.co/3165/ |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de Química Departamento de Química |
dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
González Mónico, Sergio Arquimedes (2010) Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer / Theoretical study of the isotope effects on hydrogen bonds and its application to water aggregates using a non Born-Oppenheimer methodology. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia. |
dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia |
dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.license.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
institution |
Universidad Nacional de Colombia |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/6912/1/197450.2010.pdf https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/6912/2/197450.2010.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
b5432fb107fdfeb10f9b62d22410c8aa 0d3ebe93ee64a98d859470a1a531bb58 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio_nal@unal.edu.co |
_version_ |
1814089957438914560 |
spelling |
Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Reyes Velasco, Andrés (Thesis advisor)4381b697-1464-4e6c-830f-1693eb9f0bbbGonzález Mónico, Sergio Arquimedesbe9712ae-61e9-44ee-b0ae-e328e4ad0baf3002019-06-24T16:26:48Z2019-06-24T16:26:48Z2010-05https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/6912http://bdigital.unal.edu.co/3165/A pesar que las simulaciones basadas en la aproximación de Born-Oppenheimer (ABO) resultan adecuadas para describir un amplio número de sistemas moleculares, cada vez es más evidente que dichas simulaciones deben incorporar efectos cuánticos diferentes a los electrónicos. Esto se hace patente si se pretenden estudiar fenómenos como el cambio que experimenta densidad electrónica de las moléculas en función de su entorno (por ejemplo debido al movimiento nuclear o las sustituciones isotópicas), o la transferencia de núcleos de hidrógeno en sistemas enlazados por puentes de hidrógeno. Para corregir las falencias de métodos Born-Oppenheimer para el estudio de los fenómenos antes mencionados, se han propuesto métodos que van más allá de la ABO como el método del Orbital Molecular Nuclear y Electrónico (OMNE). En este trabajo se implementó computacionalmente el método OMNE a niveles de teoría Hartree-Fock(HF) y Moller-Plesser de segundo orden (MP2). El programa desarrollado fue aplicado al estudio de efectos de isótopo en dímeros de agua, lográndose reproducir exitosamente los resultados y tendencias experimentales. Los resultados de este trabajo serán claves en investigaciones posteriores sobre efectos de isótopo en agregados de agua de mayor tamaño, al igual que en estudios de la dinámica molecular del agua y de especies solvatadas. / Abstract. Despite that the simulations based on the Born-Oppenheimer approximation are appropriate to describe a large number of molecular systems, is evident that those simulations should consider quantum effects different to quantum electronic effects. That is important if we wish to study phenomena as the change on the electronic density of the molecules, in function of its surrounding (i.e. due to nuclear movement or due to isotope substitution), or the hydrogen nuclei transfer between systems bonded by hydrogen bonds. To correct the failures of the Born-Oppenheimer methodologies to study the phenomena before referred, have been proposed methodologies beyond of the Born-Oppenheimer approximation, as the Nuclear and Electronic Molecular Orbital Method (NEMO). We have coded the NEMO method at Hartree-Fock (HF) and second order Moller-Plesser (MP2) levels of theory. The developed code was applied to study isotope effects on water dimers. We have reproduced results and experimental trends. The results of this work will be key to investigate isotope effects on larger water aggregates and to study the molecular dynamics of the water and solvated species.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de QuímicaDepartamento de QuímicaGonzález Mónico, Sergio Arquimedes (2010) Estudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-Oppenheimer / Theoretical study of the isotope effects on hydrogen bonds and its application to water aggregates using a non Born-Oppenheimer methodology. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.54 Química y ciencias afines / ChemistryPuentes de hidrógenoEfectos de isótopoMetodología no Born-OppenheimerOrbitales moleculares nucleares y electrónicosHydrogen bondsIsotope effectsNon Born-Oppenheimer methodologyNuclear and electronic molecular orbitalsEstudio teórico de los efectos de isótopo en puentes de hidrógeno y su aplicación a agregados de agua mediante metodología no Born-OppenheimerTheoretical study of the isotope effects on hydrogen bonds and its application to water aggregates using a non Born-Oppenheimer methodologyTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINAL197450.2010.pdfapplication/pdf1899545https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/6912/1/197450.2010.pdfb5432fb107fdfeb10f9b62d22410c8aaMD51THUMBNAIL197450.2010.pdf.jpg197450.2010.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4779https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/6912/2/197450.2010.pdf.jpg0d3ebe93ee64a98d859470a1a531bb58MD52unal/6912oai:repositorio.unal.edu.co:unal/69122022-11-04 12:58:35.94Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |