Primer reporte de empleo de marcadores aflp en asteraceae en cuba
Título en ingles: First report of the employment of AFLP markers in Asteraceae in Cuba. Resumen: Rhodogeron coronopifolius Griseb., es una especie vegetal de la familia Asteraceae, que se encuentra en peligro crítico de extinción. Es endémico de la provincia Villa Clara en la región central de Cuba....
- Autores:
-
Montalvo Fernández, Grecia
Mederos Oroza, Reinaldo
Morffi Mestr, Hernán
Sánchez-Teyer, Lorenzo Felipe
Rojas Jiménez, Luis
Quiala Mendoza, Elisa
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2012
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/71991
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/71991
http://bdigital.unal.edu.co/36463/
- Palabra clave:
- Populations
Rhodogeron coronopifolius
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peligro de extinción
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conservación
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Título en ingles: First report of the employment of AFLP markers in Asteraceae in Cuba. Resumen: Rhodogeron coronopifolius Griseb., es una especie vegetal de la familia Asteraceae, que se encuentra en peligro crítico de extinción. Es endémico de la provincia Villa Clara en la región central de Cuba. Habita en el matorral xeromorfo sub espinoso sobre serpentina. Existen solo cinco poblaciones naturales dentro de un área protegida, la principal causa de amenaza es la fragmentación de su hábitat por acciones antrópicas. Debido a su situación de conservación, se hace necesario realizar estudios de la diversidad genética de las poblaciones naturales para así generar información básica y diseñar una estrategia de conservación. El objetivo de este trabajo fue analizar de manera preliminar la diversidad genética de cuatro poblaciones de esta especie utilizando marcadores AFLP (Polimorfismo de Longitud de Fragmentos Amplificados). Se emplearon dos combinaciones de iniciadores y se evaluó el porcentaje de polimorfismo así como la similitud entre los individuos. Se obtuvieron 165 loci de los cuales el 78,7 % fueron polimórficos. La población de mayor polimorfismo fue Corojito con 85,2%, de manera general el polimorfismo fue alto con valores entre 75 y 87%. La similitud entre los individuos también fue alta con un promedio de 0,74. El agrupamiento genético fue independiente a la población de procedencia, lo que sugiere que existe intercambio genético entre las poblaciones y que estas comparten más del 80 % de los alelos que fueron analizados. Los resultados obtenidos son importantes para el mantenimiento in situ de la especie y para tomar decisiones en aras de su conservación. Palabras clave: Rhodogeron coronopifolius, peligro de extinción, polimorfismo, conservación. Abstract: Rhodogeron coronopifolius Griseb., is a specie of Asteraceae family, in critical danger of extinction. It is an endemic of Villa Clara city in the central region of Cuba. Its inhabits sub thorny xeromorphic heath on serpentine soil. Only five natural populations exist included in a protected area, the main threat cause is the fragmentation of its habitat for antropics activities. Due to their conservation status, it becomes necessary to analyze the genetic diversity of the natural populations in order to generate basic information usefull to apply a conservation strategy. The main goal of this work was to evaluate in a preliminary manner the genetic diversity of four populations of this specie using AFLP markers (Amplified Fragment Length Polymorphism). Two primer combinations were used and the polymorphism percentage was evaluated as well as the similarity among the individuals. A total of 165 loci were obtained of which 78,7% were polymorphic. The population with higher polymorphism was Corojito with 85,2%. High level of polymorphism was observed among population showing values between 75 and 87%. The similarity among the individuals was also high with an average of 0,74. The genetic grouping was independent to the origin of the population. This suggesting that gene flow exists among the populations, those which share more than 80% of the alleles analyzed. This is important for the in situ maintenance of the specie and to take decisions for their conservation. Key words: Populations, Rhodogeron coronopifolius, threatened, endemic, fragmentation, polymorphism. |
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Montalvo Fernández, Grecia and Mederos Oroza, Reinaldo and Morffi Mestr, Hernán and Sánchez-Teyer, Lorenzo Felipe and Rojas Jiménez, Luis and Quiala Mendoza, Elisa (2012) Primer reporte de empleo de marcadores aflp en asteraceae en cuba. Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 14, núm. 2 (2012); 28-37 1909-8758 0123-3475 . |
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La población de mayor polimorfismo fue Corojito con 85,2%, de manera general el polimorfismo fue alto con valores entre 75 y 87%. La similitud entre los individuos también fue alta con un promedio de 0,74. El agrupamiento genético fue independiente a la población de procedencia, lo que sugiere que existe intercambio genético entre las poblaciones y que estas comparten más del 80 % de los alelos que fueron analizados. Los resultados obtenidos son importantes para el mantenimiento in situ de la especie y para tomar decisiones en aras de su conservación. Palabras clave: Rhodogeron coronopifolius, peligro de extinción, polimorfismo, conservación. Abstract: Rhodogeron coronopifolius Griseb., is a specie of Asteraceae family, in critical danger of extinction. It is an endemic of Villa Clara city in the central region of Cuba. Its inhabits sub thorny xeromorphic heath on serpentine soil. Only five natural populations exist included in a protected area, the main threat cause is the fragmentation of its habitat for antropics activities. Due to their conservation status, it becomes necessary to analyze the genetic diversity of the natural populations in order to generate basic information usefull to apply a conservation strategy. The main goal of this work was to evaluate in a preliminary manner the genetic diversity of four populations of this specie using AFLP markers (Amplified Fragment Length Polymorphism). Two primer combinations were used and the polymorphism percentage was evaluated as well as the similarity among the individuals. A total of 165 loci were obtained of which 78,7% were polymorphic. The population with higher polymorphism was Corojito with 85,2%. High level of polymorphism was observed among population showing values between 75 and 87%. The similarity among the individuals was also high with an average of 0,74. 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Revista Colombiana de Biotecnología; Vol. 14, núm. 2 (2012); 28-37 1909-8758 0123-3475 .Primer reporte de empleo de marcadores aflp en asteraceae en cubaArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTPopulationsRhodogeron coronopifoliusthreatenedendemicfragmentationpolymorphismpeligro de extinciónpolimorfismoconservaciónORIGINAL37223-161764-1-PB.pdfapplication/pdf389535https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/71991/1/37223-161764-1-PB.pdf5def979e4048b1fc3301f03afe3d6b3fMD5137223-161736-1-PB.docxapplication/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document506755https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/71991/2/37223-161736-1-PB.docx1019f67a02e4f4933b84310819705c68MD5237223-169990-2-PB.htmltext/html34668https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/71991/3/37223-169990-2-PB.html93eb5b34a78caf181aa8f6611a522215MD53THUMBNAIL37223-161764-1-PB.pdf.jpg37223-161764-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg7050https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/71991/4/37223-161764-1-PB.pdf.jpg771fd8bbb5ef32f0acb7a7fc43c44e69MD54unal/71991oai:repositorio.unal.edu.co:unal/719912024-06-13 23:09:46.486Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |