Clasificación no lineal para datos de conteo: aplicación a datos de expresión de secuenciación de RNA
Uno de los principales objetivos en el estudio de datos genómicos es la clasificación de genes basados en su coexpresión. Aqu´ı se propone un kernel (medida de similitud) basado en la distancia Poisson y otra basada en información mútua para clasificar genes usando el método no lineal máquina de sop...
- Autores:
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Rodríguez Castro, Diana Carolina
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2017
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/62187
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/62187
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- Palabra clave:
- 31 Colecciones de estadística general / Statistics
51 Matemáticas / Mathematics
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Distancia Poisson
Kernel
Máquina de soporte vectorial
RNAseq
Datos genómicos
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Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2López Kleine, LilianaRodríguez Castro, Diana Carolina757ad03f-eebc-478f-a2c3-64b20b834d973002019-07-02T20:53:15Z2019-07-02T20:53:15Z2017-12-09https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/62187http://bdigital.unal.edu.co/61130/Uno de los principales objetivos en el estudio de datos genómicos es la clasificación de genes basados en su coexpresión. Aqu´ı se propone un kernel (medida de similitud) basado en la distancia Poisson y otra basada en información mútua para clasificar genes usando el método no lineal máquina de soporte vectorial en datos de conteo RNAseq, sus resultados se comparan con el método lineal discriminante Poisson.Abstract. One of the main objectives in the study of genomic data is the classification of genes based on their coexpression. Here we propose a kernel (measure of similarity) based on Poisson distance and another based on mutual information to classify genes using the non-linear method vector support machine in RNAseq count data, their results are compared with the Poisson discriminant linear methodMaestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de EstadísticaDepartamento de EstadísticaRodríguez Castro, Diana Carolina (2017) Clasificación no lineal para datos de conteo: aplicación a datos de expresión de secuenciación de RNA. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.31 Colecciones de estadística general / Statistics51 Matemáticas / MathematicsDiscriminante Lineal PoissonDistancia PoissonKernelMáquina de soporte vectorialRNAseqDatos genómicosPoisson discriminantPoisson distanceKernelSupport vector machineMutual informationRNAseqClasificación no lineal para datos de conteo: aplicación a datos de expresión de secuenciación de RNATrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINALDianaRodriguezCastro_2017.pdf.pdfapplication/pdf3412930https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/62187/1/DianaRodriguezCastro_2017.pdf.pdfdfcdf147566c9081f1512bb132255041MD51THUMBNAILDianaRodriguezCastro_2017.pdf.pdf.jpgDianaRodriguezCastro_2017.pdf.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4493https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/62187/2/DianaRodriguezCastro_2017.pdf.pdf.jpg7ea2e70357bba3c8023f11d0cbd5faa4MD52unal/62187oai:repositorio.unal.edu.co:unal/621872023-04-15 23:06:34.082Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |
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