Clasificación no lineal para datos de conteo: aplicación a datos de expresión de secuenciación de RNA

Uno de los principales objetivos en el estudio de datos genómicos es la clasificación de genes basados en su coexpresión. Aqu´ı se propone un kernel (medida de similitud) basado en la distancia Poisson y otra basada en información mútua para clasificar genes usando el método no lineal máquina de sop...

Full description

Autores:
Rodríguez Castro, Diana Carolina
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2017
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/62187
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/62187
http://bdigital.unal.edu.co/61130/
Palabra clave:
31 Colecciones de estadística general / Statistics
51 Matemáticas / Mathematics
Discriminante Lineal Poisson
Distancia Poisson
Kernel
Máquina de soporte vectorial
RNAseq
Datos genómicos
Poisson discriminant
Poisson distance
Kernel
Support vector machine
Mutual information
RNAseq
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Description
Summary:Uno de los principales objetivos en el estudio de datos genómicos es la clasificación de genes basados en su coexpresión. Aqu´ı se propone un kernel (medida de similitud) basado en la distancia Poisson y otra basada en información mútua para clasificar genes usando el método no lineal máquina de soporte vectorial en datos de conteo RNAseq, sus resultados se comparan con el método lineal discriminante Poisson.