Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt
Cistothorus apolinari el cucarachero de pantano es una especie endémica de la familia Troglodytidae que tiene alrededor de 33 especies en Colombia. La especie se encuentra amenazada en la categoría EN. En la actualidad se sugiere la existencia de subespecies distintas: la que habita en el páramo (Ci...
- Autores:
-
Patiño Hernández, Mauricio
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/51276
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/51276
http://bdigital.unal.edu.co/45350/
- Palabra clave:
- 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Cistothorus apolinari
Citocromo B
Región Control
Intrón 4 Fibrinógeno
Cytocrome B
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
| id |
UNACIONAL2_3a3d137732168946dc35523808d265b3 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/51276 |
| network_acronym_str |
UNACIONAL2 |
| network_name_str |
Universidad Nacional de Colombia |
| repository_id_str |
|
| dc.title.spa.fl_str_mv |
Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt |
| title |
Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt |
| spellingShingle |
Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology Cistothorus apolinari Citocromo B Región Control Intrón 4 Fibrinógeno Cytocrome B |
| title_short |
Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt |
| title_full |
Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt |
| title_fullStr |
Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt |
| title_full_unstemmed |
Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt |
| title_sort |
Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt |
| dc.creator.fl_str_mv |
Patiño Hernández, Mauricio |
| dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Patiño Hernández, Mauricio |
| dc.contributor.spa.fl_str_mv |
García, Luis Fernando |
| dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv |
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology |
| topic |
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology Cistothorus apolinari Citocromo B Región Control Intrón 4 Fibrinógeno Cytocrome B |
| dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Cistothorus apolinari Citocromo B Región Control Intrón 4 Fibrinógeno Cytocrome B |
| description |
Cistothorus apolinari el cucarachero de pantano es una especie endémica de la familia Troglodytidae que tiene alrededor de 33 especies en Colombia. La especie se encuentra amenazada en la categoría EN. En la actualidad se sugiere la existencia de subespecies distintas: la que habita en el páramo (Cistothorus apolinari hernandezi) y la de los humedales (Cistothorus apolinari apolinari). Secuencias de dos fragmentos de genes mitocondriales, el Citocromo B (CYB), la región control (D-LOOP) y un fragmento del intrón del gen nuclear 4 Fibrinógeno (FIB) se utilizaron para evaluar la variabilidad genética entre las dos presuntas subespecies, y evidenciar mediante reconstrucción filogenética la existencia de una o dos unidades taxonómicas distintas. Muy bajos niveles de variabilidad fueron encontrados para comparaciones intraespecíficas e interespecíficas sugiriendo que las poblaciones han estado bajo posibles cuellos de botella que han disminuido su variabilidad. Todos los análisis de reconstrucción filogenética mediante parsimonia y modelos probabilísticos de máxima verosimilitud e inferencia bayesiana sugieren que el cucarachero de pantano y el de los humedales hacen parte de una única especie. Estimativos de tiempos de divergencia asumiendo tanto un reloj molecular estricto como relajado, indican que el cucarachero de pantano y su grupo hermano (Cistothorus platensis) tuvieron un ancestro común hace aproximadamente 5,85 MA. |
| publishDate |
2014 |
| dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2014 |
| dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2019-06-29T11:40:28Z |
| dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2019-06-29T11:40:28Z |
| dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Maestría |
| dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
| dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion |
| dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
| dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/TM |
| status_str |
acceptedVersion |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/51276 |
| dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv |
http://bdigital.unal.edu.co/45350/ |
| url |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/51276 http://bdigital.unal.edu.co/45350/ |
| dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de Biología Departamento de Biología |
| dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
Patiño Hernández, Mauricio (2014) Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá. |
| dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia |
| dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| dc.rights.license.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
| dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
| dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
| institution |
Universidad Nacional de Colombia |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/51276/1/79791127.2014.pdf https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/51276/2/79791127.2014.pdf.jpg |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
ac277ed87198e349744b6dac792df0f3 3fea06d36e05f68620f1006f368cc6d3 |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio_nal@unal.edu.co |
| _version_ |
1814089960957935616 |
| spelling |
Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2García, Luis FernandoPatiño Hernández, Mauricio302864cd-1263-4ad2-a025-a5e2d7bb03723002019-06-29T11:40:28Z2019-06-29T11:40:28Z2014https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/51276http://bdigital.unal.edu.co/45350/Cistothorus apolinari el cucarachero de pantano es una especie endémica de la familia Troglodytidae que tiene alrededor de 33 especies en Colombia. La especie se encuentra amenazada en la categoría EN. En la actualidad se sugiere la existencia de subespecies distintas: la que habita en el páramo (Cistothorus apolinari hernandezi) y la de los humedales (Cistothorus apolinari apolinari). Secuencias de dos fragmentos de genes mitocondriales, el Citocromo B (CYB), la región control (D-LOOP) y un fragmento del intrón del gen nuclear 4 Fibrinógeno (FIB) se utilizaron para evaluar la variabilidad genética entre las dos presuntas subespecies, y evidenciar mediante reconstrucción filogenética la existencia de una o dos unidades taxonómicas distintas. Muy bajos niveles de variabilidad fueron encontrados para comparaciones intraespecíficas e interespecíficas sugiriendo que las poblaciones han estado bajo posibles cuellos de botella que han disminuido su variabilidad. Todos los análisis de reconstrucción filogenética mediante parsimonia y modelos probabilísticos de máxima verosimilitud e inferencia bayesiana sugieren que el cucarachero de pantano y el de los humedales hacen parte de una única especie. Estimativos de tiempos de divergencia asumiendo tanto un reloj molecular estricto como relajado, indican que el cucarachero de pantano y su grupo hermano (Cistothorus platensis) tuvieron un ancestro común hace aproximadamente 5,85 MA.Abstract. Cistothorus apolinari the apolinar's wren is an endemic species from the Family Troglodytidae with around 33 species in Colombia. The species is under endangered category. Currently, it is suggested that there are two different subespecies: Cistothorus apolinari hernandezi which inhabits the paramo, and Cistothorus apolinari apolinari which inhabits the wetlands. Sequences from fragments of two mitochondrial genes, Cytochrome B (CYB), the control region (D-LOOP) and the intron of 4-fibrinogen nuclear gen (FIB) were used to evaluate the genetic variability between the two presumptive subspecies, and to evidence through phylogenetic reconstruction the existance of either one or two different taxonomic units. Very low levels of variability were observed for both intrasubspecific and intersubspecific comparsons, suggesting that populations could have been through bottlenecks which decrease variability. All phylogenetic reconstruction analyses through maximun parsimony, maximum likelihood and bayesian inference suggest that the paramo wren and the wetland wren are part of a single species, and are not different subspecies. Estimates of divergente times assuming a strict and a relaxed molecular clock, indicate that the apolinar´s wren and Cistothorus platensis, its sister group, had a common ancestror about 5,85 MA.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de BiologíaDepartamento de BiologíaPatiño Hernández, Mauricio (2014) Variabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmt. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biologyCistothorus apolinariCitocromo BRegión ControlIntrón 4 FibrinógenoCytocrome BVariabilidad genética en dos subespecies de cucarachero Cistothorus Apolinari Apolinari y Cistothorus Apolinari Hernandezi (aves: Troglodytidae) mediante ADNmtTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINAL79791127.2014.pdfapplication/pdf1413810https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/51276/1/79791127.2014.pdfac277ed87198e349744b6dac792df0f3MD51THUMBNAIL79791127.2014.pdf.jpg79791127.2014.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4322https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/51276/2/79791127.2014.pdf.jpg3fea06d36e05f68620f1006f368cc6d3MD52unal/51276oai:repositorio.unal.edu.co:unal/512762023-02-19 23:05:07.96Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |