Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia

Las Cyanobacterias marinas son una fuente prolífica de compuestos bioactivos con amplios usos en biotecnología. En esta investigación, se realizó un estudio preliminar del potencial biotecnológico que presentan cepas aisladas de Cyanobacterias provenientes del parque Nacional Natural Islas del...

Full description

Autores:
Peña Murcia, Jefferson Ernesto
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2019
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/76639
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76639
http://bdigital.unal.edu.co/73246/
Palabra clave:
Cianoprocariotas
16S rRNA
Análisis filogenético
Potencial biotecnológico
PKS
NRPS
Ensayos antimicrobianos
Cyanoprokaryotes
Phylogenetic analysis
Biotechnological potential
Antimicrobial assays
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_383c73e5012ca6c513300bac2a477a0a
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/76639
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
dc.title.spa.fl_str_mv Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia
title Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia
spellingShingle Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia
Cianoprocariotas
16S rRNA
Análisis filogenético
Potencial biotecnológico
PKS
NRPS
Ensayos antimicrobianos
Cyanoprokaryotes
Phylogenetic analysis
Biotechnological potential
Antimicrobial assays
title_short Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia
title_full Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia
title_fullStr Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia
title_full_unstemmed Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia
title_sort Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia
dc.creator.fl_str_mv Peña Murcia, Jefferson Ernesto
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Peña Murcia, Jefferson Ernesto
dc.contributor.spa.fl_str_mv Montenegro Ruiz, Luis Carlos
García Pinzón, Luis Fernando
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv Cianoprocariotas
16S rRNA
Análisis filogenético
Potencial biotecnológico
PKS
NRPS
Ensayos antimicrobianos
Cyanoprokaryotes
Phylogenetic analysis
Biotechnological potential
Antimicrobial assays
topic Cianoprocariotas
16S rRNA
Análisis filogenético
Potencial biotecnológico
PKS
NRPS
Ensayos antimicrobianos
Cyanoprokaryotes
Phylogenetic analysis
Biotechnological potential
Antimicrobial assays
description Las Cyanobacterias marinas son una fuente prolífica de compuestos bioactivos con amplios usos en biotecnología. En esta investigación, se realizó un estudio preliminar del potencial biotecnológico que presentan cepas aisladas de Cyanobacterias provenientes del parque Nacional Natural Islas del Rosario. Se obtuvieron un total de 11 aislamientos que fueron clasificadas numeradas desde LAUN 090 a LAUN 100 y se encuentran depositadas en el reservorio del laboratorio de cultivo de algas de la Universidad Nacional. De las 11 cepas, 8 fueron caracterizadas morfológicamente como Leptolyngbya, las otras tres fueron caracterizadas como Dermocarpa, Pleurocapsa y Stanieria. Los análisis moleculares se realizaron con un fragmento del gen ribosomal rARN 16S (16S). En una búsqueda de BLAST en GenBank, las cepas caracterizadas como Leptolyngbya presentaron una similitud del 100% con Phormidium, a excepción de la cepa LAUN093, mientras que las otras cepas presentan una similitud con Dermocarpa, Pleurocapsa y Stanieria del 97, 98 y 100%, respectivamente. Se realizó un análisis filogenético con máxima parsimonia, máxima verosimilitud e inferencia bayesiana; usando secuencias homologas del gen 16S de la base de datos del GenBank. Los tres métodos reconstruyeron topologías similares para grandes clados, agrupando las Cyanoabcterias por los principales órdenes; Synechococcales, Pleurocapsales, Oscillatoriales y Nostocales. Sin embargo, en los nodos menores se presentan algunas diferencias, formando grupos polifiléticos para algunos géneros. Los análisis filogenéticos y las divergencias presentadas aquí sugieren que las cepas LAUN (094, 095, 098 y 099), LAUN091, LAUN093, LAUN097 y LAUN100 son probablemente especies nuevas. Finalmente se evaluó la presencia de genes encargados de producir los metabolitos secundaros del tipo NRPS y PKS; y se llevaron a cabo ensayos antimicrobianos y antifúngicos. Los resultados mostraron que los genes se encuentran en la mayoría de las cepas aisladas, mientras que los ensayos antimicrobianos dieron negativo en todos los casos.
publishDate 2019
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2019
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2020-03-30T06:23:56Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2020-03-30T06:23:56Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Maestría
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TM
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76639
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/73246/
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76639
http://bdigital.unal.edu.co/73246/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá
Sede Bogotá
dc.relation.haspart.spa.fl_str_mv 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
dc.relation.references.spa.fl_str_mv Peña Murcia, Jefferson Ernesto (2019) Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.
dc.rights.spa.fl_str_mv Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76639/1/1116791990_Pen%cc%83aMurcia_JeffersonErnesto_Maestri%cc%81a.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76639/2/1116791990_Pen%cc%83aMurcia_JeffersonErnesto_Maestri%cc%81a.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv c81616c8af251f1f281e76e68b7835bd
460bb6a6dbe77c52e17b709425412911
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1806886346583703552
spelling Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Montenegro Ruiz, Luis CarlosGarcía Pinzón, Luis FernandoPeña Murcia, Jefferson Ernesto26813e9d-1115-47d8-8d6e-37fe483700583002020-03-30T06:23:56Z2020-03-30T06:23:56Z2019https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/76639http://bdigital.unal.edu.co/73246/Las Cyanobacterias marinas son una fuente prolífica de compuestos bioactivos con amplios usos en biotecnología. En esta investigación, se realizó un estudio preliminar del potencial biotecnológico que presentan cepas aisladas de Cyanobacterias provenientes del parque Nacional Natural Islas del Rosario. Se obtuvieron un total de 11 aislamientos que fueron clasificadas numeradas desde LAUN 090 a LAUN 100 y se encuentran depositadas en el reservorio del laboratorio de cultivo de algas de la Universidad Nacional. De las 11 cepas, 8 fueron caracterizadas morfológicamente como Leptolyngbya, las otras tres fueron caracterizadas como Dermocarpa, Pleurocapsa y Stanieria. Los análisis moleculares se realizaron con un fragmento del gen ribosomal rARN 16S (16S). En una búsqueda de BLAST en GenBank, las cepas caracterizadas como Leptolyngbya presentaron una similitud del 100% con Phormidium, a excepción de la cepa LAUN093, mientras que las otras cepas presentan una similitud con Dermocarpa, Pleurocapsa y Stanieria del 97, 98 y 100%, respectivamente. Se realizó un análisis filogenético con máxima parsimonia, máxima verosimilitud e inferencia bayesiana; usando secuencias homologas del gen 16S de la base de datos del GenBank. Los tres métodos reconstruyeron topologías similares para grandes clados, agrupando las Cyanoabcterias por los principales órdenes; Synechococcales, Pleurocapsales, Oscillatoriales y Nostocales. Sin embargo, en los nodos menores se presentan algunas diferencias, formando grupos polifiléticos para algunos géneros. Los análisis filogenéticos y las divergencias presentadas aquí sugieren que las cepas LAUN (094, 095, 098 y 099), LAUN091, LAUN093, LAUN097 y LAUN100 son probablemente especies nuevas. Finalmente se evaluó la presencia de genes encargados de producir los metabolitos secundaros del tipo NRPS y PKS; y se llevaron a cabo ensayos antimicrobianos y antifúngicos. Los resultados mostraron que los genes se encuentran en la mayoría de las cepas aisladas, mientras que los ensayos antimicrobianos dieron negativo en todos los casos.Abstract: Marine cyanobacteria are a prolific source of bioactive compounds with extensive uses in biotechnology. In this research, a preliminary study was made for the biotechnological potential of the strains isolated from cyanobacteria from the Islas del Rosario National Natural park. A total of 11 isolates were obtained and named from LAUN 090 to LAUN 100 and were deposited in the reservoir of the algae culture laboratory of the Universidad Nacional de Colombia. Of the 11 strains, 8 strains were characterized morphologically as Leptolyngbya, the other three were characterized as Dermocarpa, Pleurocapsa and Stanieria. Molecular analyses were made with a fragment of the 16s rRNA gene. A BLAST search in genebank showed the strains characterized as Leptolyngbya with a 100% similarity with Phormidium, except for strain LAUN093, whereas the other strains presented a similarity with Dermocarpa, Pleurocapsa and Stanieria of 97, 98 and 100%, respectively. Molecular analyzes were performed with the ribosomal gene 16S rRNA (16S). A phylogenetic analysis was performed with, maximum parsimony, maximum likelihood and Bayesian inference; by using homologous sequences of the 16S rRNA gene from the GenBank database. The three methods reconstructed similar topologies and relationships for the major clades, clustering the cyanobacteria by the main orders; Synechococcales, Pleurocapsales, Oscillatoriales and Nostocales. However, in the minor nodes some differences occur, forming polyphyletic groups in some genera. The phylogenetic analyzes and the divergences presented here suggest that the LAUN strains (094, 095, 098 and 099), LAUN091, LAUN093, LAUN097 and LAUN100 are probably new species. Finally, the presence of genes responsible for producing the secondary metabolites of the NRPS and PKS type was evaluated; as well as antimicrobial and antifungal assays. The results showed that the genes are found in most of the isolated strains, while the antimicrobial assays were negative in all cases.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede BogotáSede Bogotá57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biologyPeña Murcia, Jefferson Ernesto (2019) Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, Colombia. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá.Potencial biotecnológico de Cianoprocariotas provenientes de Islas del Rosario, ColombiaTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMCianoprocariotas16S rRNAAnálisis filogenéticoPotencial biotecnológicoPKSNRPSEnsayos antimicrobianosCyanoprokaryotesPhylogenetic analysisBiotechnological potentialAntimicrobial assaysORIGINAL1116791990_PeñaMurcia_JeffersonErnesto_Maestría.pdfapplication/pdf7577616https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76639/1/1116791990_Pen%cc%83aMurcia_JeffersonErnesto_Maestri%cc%81a.pdfc81616c8af251f1f281e76e68b7835bdMD51THUMBNAIL1116791990_PeñaMurcia_JeffersonErnesto_Maestría.pdf.jpg1116791990_PeñaMurcia_JeffersonErnesto_Maestría.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4616https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/76639/2/1116791990_Pen%cc%83aMurcia_JeffersonErnesto_Maestri%cc%81a.pdf.jpg460bb6a6dbe77c52e17b709425412911MD52unal/76639oai:repositorio.unal.edu.co:unal/766392023-07-15 23:03:33.622Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co