Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos
En el presente estudio se describe un flujo de trabajo que puede ser aplicado a diferentes especies vegetales, con el fin de obtener extractos apoplásticos que puedan ser usados para análisis proteómicos. Para ello, usando tallos y raíces de clavel, se evaluaron parámetros claves para la extracción...
- Autores:
-
Martinez Gonzalez, Ana Patricia
Martínez Peralta, Sixta Tulia
Ardila Barrantes, Harold Dubán
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2017
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/66266
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/66266
http://bdigital.unal.edu.co/67290/
- Palabra clave:
- 54 Química y ciencias afines / Chemistry
Apoplastic fluid
Fusarium oxysporum f. sp dianthi
plant-pathogen
electrophoresis
Fluido apoplástico
Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi
planta patógeno
electroforesis
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
| id |
UNACIONAL2_33c9ecb44a2420b71f8a79622450f530 |
|---|---|
| oai_identifier_str |
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/66266 |
| network_acronym_str |
UNACIONAL2 |
| network_name_str |
Universidad Nacional de Colombia |
| repository_id_str |
|
| dc.title.spa.fl_str_mv |
Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos |
| title |
Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos |
| spellingShingle |
Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos 54 Química y ciencias afines / Chemistry Apoplastic fluid Fusarium oxysporum f. sp dianthi plant-pathogen electrophoresis Fluido apoplástico Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi planta patógeno electroforesis |
| title_short |
Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos |
| title_full |
Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos |
| title_fullStr |
Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos |
| title_full_unstemmed |
Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos |
| title_sort |
Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos |
| dc.creator.fl_str_mv |
Martinez Gonzalez, Ana Patricia Martínez Peralta, Sixta Tulia Ardila Barrantes, Harold Dubán |
| dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Martinez Gonzalez, Ana Patricia Martínez Peralta, Sixta Tulia Ardila Barrantes, Harold Dubán |
| dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv |
54 Química y ciencias afines / Chemistry |
| topic |
54 Química y ciencias afines / Chemistry Apoplastic fluid Fusarium oxysporum f. sp dianthi plant-pathogen electrophoresis Fluido apoplástico Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi planta patógeno electroforesis |
| dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Apoplastic fluid Fusarium oxysporum f. sp dianthi plant-pathogen electrophoresis Fluido apoplástico Fusarium oxysporum f. sp. Dianthi planta patógeno electroforesis |
| description |
En el presente estudio se describe un flujo de trabajo que puede ser aplicado a diferentes especies vegetales, con el fin de obtener extractos apoplásticos que puedan ser usados para análisis proteómicos. Para ello, usando tallos y raíces de clavel, se evaluaron parámetros claves para la extracción de estas proteínas. Se determinó que para esta especie (Dianthus caryophyllus L) se debe usar la solución amortiguadora fosfato de sodio 0,1 M pH 6,5, cloruro de sodio 50 mM y 0,1% β-mercaptoetanol para la infiltración; con tres tiemposde vacío de 20 s a 70 kPa y centrifugación a 1000 x g durante 20 min a 4 ºC, seguido de precipitación y concentración de proteínas con el método (TCA-Ácido tricloroacético)/acetona. Bajo estas condiciones, se obtienen extractos que permiten análisis electroforéticos en 2D de proteínas de apoplasto, usando para el isolectroenfoque tiras con gradientes de pH 5-8 para raíz y pH 3-10 para tallo. Las condicionesdescritas permitirán profundizar sobre el papel de las proteínas apoplásticas en diversidad de fenómenos biológicos que involucrenesta especie vegetal. |
| publishDate |
2017 |
| dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2017-05-01 |
| dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2019-07-03T01:47:59Z |
| dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2019-07-03T01:47:59Z |
| dc.type.spa.fl_str_mv |
Artículo de revista |
| dc.type.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1 |
| dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/article |
| dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
| dc.type.coar.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
| dc.type.coarversion.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 |
| dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
| dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/ART |
| format |
http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 |
| status_str |
publishedVersion |
| dc.identifier.issn.spa.fl_str_mv |
ISSN: 2357-3791 |
| dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/66266 |
| dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv |
http://bdigital.unal.edu.co/67290/ |
| identifier_str_mv |
ISSN: 2357-3791 |
| url |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/66266 http://bdigital.unal.edu.co/67290/ |
| dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
| language |
spa |
| dc.relation.spa.fl_str_mv |
https://revistas.unal.edu.co/index.php/rcolquim/article/view/62958 |
| dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de Química Revista Colombiana de Química |
| dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
Martinez Gonzalez, Ana Patricia and Martínez Peralta, Sixta Tulia and Ardila Barrantes, Harold Dubán (2017) Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos. Revista Colombiana de Química, 46 (2). pp. 5-16. ISSN 2357-3791 |
| dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia |
| dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| dc.rights.license.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
| dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
| dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
| rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
| eu_rights_str_mv |
openAccess |
| dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
| dc.publisher.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Facultad de Ciencias - Departamento de Química |
| institution |
Universidad Nacional de Colombia |
| bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/66266/1/62958-333360-1-PB.pdf https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/66266/2/62958-333360-1-PB.pdf.jpg |
| bitstream.checksum.fl_str_mv |
b22da5c0bffdfbcf61ed04f820747aac 10c33a9e633e7f5ec4bb9ddec5d892bd |
| bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
| repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia |
| repository.mail.fl_str_mv |
repositorio_nal@unal.edu.co |
| _version_ |
1814089360538075136 |
| spelling |
Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Martinez Gonzalez, Ana Patriciaf96fde82-602d-4b7c-a677-b3708babf9d8300Martínez Peralta, Sixta Tulia769d9e89-fb5d-43ef-b276-95d7bb2f1fa5300Ardila Barrantes, Harold Dubánd5231479-c59a-4ebc-a149-d5ebb96a64b03002019-07-03T01:47:59Z2019-07-03T01:47:59Z2017-05-01ISSN: 2357-3791https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/66266http://bdigital.unal.edu.co/67290/En el presente estudio se describe un flujo de trabajo que puede ser aplicado a diferentes especies vegetales, con el fin de obtener extractos apoplásticos que puedan ser usados para análisis proteómicos. Para ello, usando tallos y raíces de clavel, se evaluaron parámetros claves para la extracción de estas proteínas. Se determinó que para esta especie (Dianthus caryophyllus L) se debe usar la solución amortiguadora fosfato de sodio 0,1 M pH 6,5, cloruro de sodio 50 mM y 0,1% β-mercaptoetanol para la infiltración; con tres tiemposde vacío de 20 s a 70 kPa y centrifugación a 1000 x g durante 20 min a 4 ºC, seguido de precipitación y concentración de proteínas con el método (TCA-Ácido tricloroacético)/acetona. Bajo estas condiciones, se obtienen extractos que permiten análisis electroforéticos en 2D de proteínas de apoplasto, usando para el isolectroenfoque tiras con gradientes de pH 5-8 para raíz y pH 3-10 para tallo. Las condicionesdescritas permitirán profundizar sobre el papel de las proteínas apoplásticas en diversidad de fenómenos biológicos que involucrenesta especie vegetal.In the present study a workflow, that can be applied to different plant species, to obtain a high quality apoplastic extract and for prote-omic analysis was described. For that, using carnation roots and stems, some important parameters for the extraction of these proteins were evaluated. The best conditions for the infiltration were provided by using a sodium phosphate buffer pH 6.5 0.1 M, sodium chlo-ride 50 mM and β-mercaptoethanol 0.1%, with 3 vacuum times at 70 kPa for 20 s and centrifuged at 4°C at 1,000 g for 20 min, and then a subsequent protein precipitation and concentration with the (TCA-Trichloroacetic acid)/acetone protocol. These conditions can be used to obtain a good quality extract for 2D electrophoretic analysis of apoplastic proteins. Strips with pH gradients between 5-8 and 3-10 were used to run isoelectric analysis for extracts obtained from apoplast in roots and stems respectively. The conditions de-scribed can be used to perform studies focused to apoplastic proteins and its role in biological phenomena involving this plant species.application/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Bogotá - Facultad de Ciencias - Departamento de Químicahttps://revistas.unal.edu.co/index.php/rcolquim/article/view/62958Universidad Nacional de Colombia Revistas electrónicas UN Revista Colombiana de QuímicaRevista Colombiana de QuímicaMartinez Gonzalez, Ana Patricia and Martínez Peralta, Sixta Tulia and Ardila Barrantes, Harold Dubán (2017) Condiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicos. Revista Colombiana de Química, 46 (2). pp. 5-16. ISSN 2357-379154 Química y ciencias afines / ChemistryApoplastic fluidFusarium oxysporum f. sp dianthiplant-pathogenelectrophoresisFluido apoplásticoFusarium oxysporum f. sp. Dianthiplanta patógenoelectroforesisCondiciones para el análisis electrofóretico de proteínas apoplásticas de tallos y raíces de clavel (Dianthus caryophyllus L) para estudios proteómicosArtículo de revistainfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_6501http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/ARTORIGINAL62958-333360-1-PB.pdfapplication/pdf3723452https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/66266/1/62958-333360-1-PB.pdfb22da5c0bffdfbcf61ed04f820747aacMD51THUMBNAIL62958-333360-1-PB.pdf.jpg62958-333360-1-PB.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg9336https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/66266/2/62958-333360-1-PB.pdf.jpg10c33a9e633e7f5ec4bb9ddec5d892bdMD52unal/66266oai:repositorio.unal.edu.co:unal/662662023-05-24 23:02:56.106Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |