Diversidad de hongos y bacterias presentes en suelos de bosques tropicales de la Cordillera Occidental-Valle del Cauca en respuesta a un gradiente altitudinal
Ilstraciones, tablas
- Autores:
-
Reyes Ardila, Wendy Lorena
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2023
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/84089
- Palabra clave:
- 570 - Biología::576 - Genética y evolución
Metagenómica
Metagenomics
Biodiversity
Bosques tropicales
Tropical forests
Taxonomía bacteriana
Bacterial taxonomy
Taxonomía de hongos
Bosques tropicales
Tropical forests
Fungal taxonomy
Gradiente altitudinal
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Bacteria
Hongo
Potencial funcional
Taxonomía
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Valle del Cauca
- Rights
- openAccess
- License
- Reconocimiento 4.0 Internacional
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Diversity of fungi and bacteria present in tropical forest soils of the western range - Valle del Cauca in response to an altitudinal gradient. |
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Reconocimiento 4.0 Internacionalhttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2López Álvarez, Diana Carolina1ab298e9492bfd0c4b69bb243416b257Reyes Ardila, Wendy Lorena24437edfd6dccc676e357da0b8094c98Diversidad BiológicaReyes-Ardila, Wendy Lorena [https://orcid.org/0000-0003-2946-0273]Reyes-Ardila, Wendy Lorena [https://scienti.minciencias.gov.co/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000073088]Reyes-Ardila, Wendy Lorena https://www.researchgate.net/profile/Wendy-Reyes-Ardila[Reyes-Ardila, Wendy Lorena [https://scholar.google.com/citations?hl=es&user=DMoZhMwAAAAJ]2023-06-28T15:43:28Z2023-06-28T15:43:28Z2023-06https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/84089Universidad Nacional de ColombiaRepositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiahttps://repositorio.unal.edu.co/Ilstraciones, tablasSe realizó una caracterización taxonómica bacteriana (16S) y fúngica (ITS) utilizando metabarcoding sobre un gradiente altitudinal en la cordillera occidental del Valle del Cauca, Colombia, que incluyó ecosistemas de Bosques Andino, Seco Tropical y Páramo en las localidades de Laguna de Sonso (LS) (900 msnm), Yotoco (Yt) (1800 msnm), Bosque del Duende (BD) (2400 msnm) y páramo del Duende (PDU) (3200 msnm). Los análisis fisicoquímicos mostraron suelos con materia orgánica alta (>10%), sin problemas de compactación, pHs extremadamente ácidos (4,4) para zonas con mayor altitud, ligera y fuertemente ácidos en zonas bajas (5,5-6,1). Se identificaron 59 familias de plantas en las zonas de muestreo, siendo las más abundantes Araceae, Lauraceae y Fabaceae. Las asignaciones taxonómicas bacterianas fueron dominadas por los phyla Acidobacteriota (33,1%) y Proteobacteria (23,9%), para hongos dominaron Ascomycota (38,6%,) y Basidiomycota (11,3%). En general los análisis diversidad alfa mostraron alta diversidad, riqueza y baja dominancia, demostrando que las comunidades son altamente diversas, mientras la diversidad beta reflejó las diferencias de la composición en las localidades y la heterogeneidad de estas. Las predicciones funcionales reflejaron que la abundancia absoluta más alta para bacterias presentó actividad quimioheterotrofa y se relaciona con diferentes componentes del ciclo del nitrógeno mientras en hongos se clasifica por gremios ecológicos, donde los relacionados con actividad patogénica tanto en animales como en plantas, endofitismo, saprofitismo y epifitos fueron más representativos. Los resultados encontrados demuestran una variabilidad genética ecológica de los microorganismos entre las zonas de muestreo, además, respondieron a los cambios fisicoquímicos y de vegetación propios del gradiente altitudinal. (Texto tomado de la fuente)A bacterial (16S) and fungal (ITS) taxonomic characterization was carried out using metabarcoding over an altitudinal gradient in the western mountain range of Valle del Cauca, Colombia, which included ecosystems of Andean, Tropical Dry and Paramo Forests in the localities of Laguna de Sonso (LS) (900 masl), Yotoco (Yt) (1800 masl), Bosque del Duende (BD) (2400 masl) and paramo of Duende (PDU) (3200 masl). The physicochemical analyses showed soils with high organic matter (>10%), no compaction problems, extremely acidic pHs (4.4) for higher altitude zones, and slightly and strongly acidic in lower zones (5.5-6.1). Fifty-nine plant families were identified in the sampling areas, the most abundant being Araceae, Lauraceae, and Fabaceae. Bacterial taxonomic assignments were dominated by the phyla Acidobacteriota (33.1%) and Proteobacteria (23.9%), for fungi Ascomycota (38.6%) and Basidiomycota (11.3%). In general, alpha diversity analyses showed high diversity, richness, and low dominance, demonstrating that the communities are highly diverse. In contrast, beta diversity reflected the differences in the composition of the localities and their heterogeneity. Functional predictions reflected that the highest absolute abundance for bacteria presented chemoheterotrophic activity and was related to different components of the nitrogen cycle. At the same time, fungi were classified by ecological guilds, where those related to pathogenic activity in animals and plants, endophytes, saprophytes, and epiphytes were more representative. The results show an ecological genetic variability of the microorganisms among the sampling zones, in addition, they responded to the physicochemical and vegetation changes characteristic of the altitudinal gradient.MaestríaMagíster en Ciencias BiológicasEn 3 de las 4 localidades evaluadas, se establecieron 3 parcelas de 100 m2 respectivamente, de cada una se tomaron 3 cilindros (submuestras) obteniendo 27 muestras, en el PDU, donde por ser una zona agreste se pudo establecer 2 parcelas con 5 submuestras donde finalmente se recolectaron 10 muestras, en total se recolectaron 37 muestras Las muestras de suelo fueron tomadas de una fracción entre 0 a 25 cm de profundidad del suelo, homogenizadas y almacenadas en tubos Falcon de 25 ml que posteriormente se preservaron a temperatura de -80°C para para preservar la integridad y estabilidad del ADN hasta la realización de extracción del mismo. Así mismo, dentro de las zonas se realizó una caracterización de la abundancia de la flora presente en cada una de las parcelas.Ecología microbianaCiencias Agropecuarias.Sede Palmiraxiii, 95 páginas + anexosapplication/pdfspaUniversidad Nacional de ColombiaPalmira - Ciencias Agropecuarias - Maestría en Ciencias BiológicasFacultad de Ciencias AgropecuariasPalmira, Valle del Cauca, ColombiaUniversidad Nacional de Colombia - Sede Palmira570 - Biología::576 - Genética y evoluciónMetagenómicaMetagenomicsBiodiversityBosques tropicalesTropical forestsTaxonomía bacterianaBacterial taxonomyTaxonomía de hongosBosques tropicalesTropical forestsFungal taxonomyGradiente altitudinalSueloBacteriaHongoPotencial funcionalTaxonomíaAltitudinal gradientSoilBacteriaFungiFunctionalPotentialTaxonomyValle del CaucaDiversidad de hongos y bacterias presentes en suelos de bosques tropicales de la Cordillera Occidental-Valle del Cauca en respuesta a un gradiente altitudinalDiversity of fungi and bacteria present in tropical forest soils of the western range - Valle del Cauca in response to an altitudinal gradient.Trabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMValle del Cauca, ColombiaAbera, W., Assen, M., & Budds, J. 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