Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN

En este trabajo se modela un segmento de ADN por medio de un proceso de reducción o decimación como una cadena lineal teniendo en cuenta los efectos de hidratación, tamaño y desorden correlacionado y no correlacionado sobre los sitos de la cadena finita. El sistema se describe por medio de un hamilt...

Full description

Autores:
Plazas Riaño, Carlos Andrés
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2011
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/8578
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/8578
http://bdigital.unal.edu.co/5246/
Palabra clave:
53 Física / Physics
ADN
Transporte electrónico
Sistemas mesoscópicos
Estados localizados
Formalismo de Landauer
DNA / Electronic transport
Mesoscopic systems
Localized state
, Landauer formalism
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id UNACIONAL2_2c2cbad6b83f31223c41916705789a7b
oai_identifier_str oai:repositorio.unal.edu.co:unal/8578
network_acronym_str UNACIONAL2
network_name_str Universidad Nacional de Colombia
repository_id_str
spelling Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Rey González, Rafael RamónPlazas Riaño, Carlos Andréscd8857ed-afa5-46a5-b308-2fe910fcc1c13002019-06-24T17:33:06Z2019-06-24T17:33:06Z2011https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/8578http://bdigital.unal.edu.co/5246/En este trabajo se modela un segmento de ADN por medio de un proceso de reducción o decimación como una cadena lineal teniendo en cuenta los efectos de hidratación, tamaño y desorden correlacionado y no correlacionado sobre los sitos de la cadena finita. El sistema se describe por medio de un hamiltoniano dentro del modelo de amarre fuerte usando la aproximación de electrón independiente, con interacción a primeros vecinos y un orbital por sitio. Los efectos de hidratación se incluyen como variaciones aleatorias de las autoenergías. A partir del concepto de la matriz de transferencia se determina la probabilidad de trasmisión y usando el formalismo de Landauer se calcula la corriente en función del voltaje aplicado a través de las diferentes cadenas de ADN. Finalmente se hace una comparación cualitativa entre los resultados teóricos y experimentales. Encontramos un comportamiento aislante para cadenas largas o con un alto grado de desorden no correlacionado mientras para cadenas cortas o de bajo desorden el comportamiento es equivalente al de un material óohmico. / Abstract. in this work we modeled a DNA segment through a reduction or decimation process as a linear chain taking into account the effects of hydration, size and correlated and uncor related disorder on the finite chain sites. The system is described by a Hamiltonian in the tight binding model using the independent electron approximation, with nearestneighbor interaction and orbital per site. The effects of hydration are included as random variations of the self-energies. Based on the concept of the transfer matrix determines the transmission probability and using the Landauer formalism to calculate the current versus voltage applied across the di®erent DNA chains. Finally, there is a qualitative comparison between theoretical and experimental results. We find insulating behavior for long chains or high uncorrelated disordered cases while short or low disordered chains are ohmic-like materials.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de FísicaDepartamento de FísicaPlazas Riaño, Carlos Andrés (2011) Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.53 Física / PhysicsADNTransporte electrónicoSistemas mesoscópicosEstados localizadosFormalismo de LandauerDNA / Electronic transportMesoscopic systemsLocalized state, Landauer formalismTransporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADNTrabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINALcarlosandresplazasriano.2011.pdfapplication/pdf1980631https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/8578/1/carlosandresplazasriano.2011.pdf7084d17e4c783a413550d8bd5ab0904bMD51THUMBNAILcarlosandresplazasriano.2011.pdf.jpgcarlosandresplazasriano.2011.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4224https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/8578/2/carlosandresplazasriano.2011.pdf.jpgbf533ddf9e92849e079e220af31814f7MD52unal/8578oai:repositorio.unal.edu.co:unal/85782023-09-02 23:04:13.522Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co
dc.title.spa.fl_str_mv Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN
title Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN
spellingShingle Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN
53 Física / Physics
ADN
Transporte electrónico
Sistemas mesoscópicos
Estados localizados
Formalismo de Landauer
DNA / Electronic transport
Mesoscopic systems
Localized state
, Landauer formalism
title_short Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN
title_full Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN
title_fullStr Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN
title_full_unstemmed Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN
title_sort Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN
dc.creator.fl_str_mv Plazas Riaño, Carlos Andrés
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv Plazas Riaño, Carlos Andrés
dc.contributor.spa.fl_str_mv Rey González, Rafael Ramón
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv 53 Física / Physics
topic 53 Física / Physics
ADN
Transporte electrónico
Sistemas mesoscópicos
Estados localizados
Formalismo de Landauer
DNA / Electronic transport
Mesoscopic systems
Localized state
, Landauer formalism
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv ADN
Transporte electrónico
Sistemas mesoscópicos
Estados localizados
Formalismo de Landauer
DNA / Electronic transport
Mesoscopic systems
Localized state
, Landauer formalism
description En este trabajo se modela un segmento de ADN por medio de un proceso de reducción o decimación como una cadena lineal teniendo en cuenta los efectos de hidratación, tamaño y desorden correlacionado y no correlacionado sobre los sitos de la cadena finita. El sistema se describe por medio de un hamiltoniano dentro del modelo de amarre fuerte usando la aproximación de electrón independiente, con interacción a primeros vecinos y un orbital por sitio. Los efectos de hidratación se incluyen como variaciones aleatorias de las autoenergías. A partir del concepto de la matriz de transferencia se determina la probabilidad de trasmisión y usando el formalismo de Landauer se calcula la corriente en función del voltaje aplicado a través de las diferentes cadenas de ADN. Finalmente se hace una comparación cualitativa entre los resultados teóricos y experimentales. Encontramos un comportamiento aislante para cadenas largas o con un alto grado de desorden no correlacionado mientras para cadenas cortas o de bajo desorden el comportamiento es equivalente al de un material óohmico. / Abstract. in this work we modeled a DNA segment through a reduction or decimation process as a linear chain taking into account the effects of hydration, size and correlated and uncor related disorder on the finite chain sites. The system is described by a Hamiltonian in the tight binding model using the independent electron approximation, with nearestneighbor interaction and orbital per site. The effects of hydration are included as random variations of the self-energies. Based on the concept of the transfer matrix determines the transmission probability and using the Landauer formalism to calculate the current versus voltage applied across the di®erent DNA chains. Finally, there is a qualitative comparison between theoretical and experimental results. We find insulating behavior for long chains or high uncorrelated disordered cases while short or low disordered chains are ohmic-like materials.
publishDate 2011
dc.date.issued.spa.fl_str_mv 2011
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv 2019-06-24T17:33:06Z
dc.date.available.spa.fl_str_mv 2019-06-24T17:33:06Z
dc.type.spa.fl_str_mv Trabajo de grado - Maestría
dc.type.driver.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
dc.type.version.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dc.type.content.spa.fl_str_mv Text
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv http://purl.org/redcol/resource_type/TM
status_str acceptedVersion
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/8578
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv http://bdigital.unal.edu.co/5246/
url https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/8578
http://bdigital.unal.edu.co/5246/
dc.language.iso.spa.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Departamento de Física
Departamento de Física
dc.relation.references.spa.fl_str_mv Plazas Riaño, Carlos Andrés (2011) Transporte electrónico a través de alambres moleculares: una aplicación al ADN. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia.
dc.rights.spa.fl_str_mv Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.spa.fl_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv application/pdf
institution Universidad Nacional de Colombia
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/8578/1/carlosandresplazasriano.2011.pdf
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/8578/2/carlosandresplazasriano.2011.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 7084d17e4c783a413550d8bd5ab0904b
bf533ddf9e92849e079e220af31814f7
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia
repository.mail.fl_str_mv repositorio_nal@unal.edu.co
_version_ 1812169017849282560