Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015.
El diseño de una vacuna contra Plasmodium vivax se ha centrado en la selección de antígenos involucrados en el proceso de invasión del parásito que presenten bajo polimorfismo, para así evitar las respuestas inmunes alelo-específicas. La proteína de cuello de roptrias-4 (RON4) ha sido caracterizada...
- Autores:
-
Buitrago Puentes, Sindy Paola
- Tipo de recurso:
- Fecha de publicación:
- 2016
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/59280
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/59280
http://bdigital.unal.edu.co/56659/
- Palabra clave:
- 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health
Plasmodium vivax
Roptrias
Diversidad genética
Repeticiones en tándem
Pvron4
Selección natural
Restricción funcional
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
id |
UNACIONAL2_2a3ae252e4179863d1c19e66a324cc50 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/59280 |
network_acronym_str |
UNACIONAL2 |
network_name_str |
Universidad Nacional de Colombia |
repository_id_str |
|
dc.title.spa.fl_str_mv |
Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. |
title |
Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. |
spellingShingle |
Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. 57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology 61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health Plasmodium vivax Roptrias Diversidad genética Repeticiones en tándem Pvron4 Selección natural Restricción funcional |
title_short |
Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. |
title_full |
Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. |
title_fullStr |
Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. |
title_full_unstemmed |
Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. |
title_sort |
Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. |
dc.creator.fl_str_mv |
Buitrago Puentes, Sindy Paola |
dc.contributor.advisor.spa.fl_str_mv |
Manuel Alfonso, Patarroyo (Thesis advisor) |
dc.contributor.author.spa.fl_str_mv |
Buitrago Puentes, Sindy Paola |
dc.contributor.spa.fl_str_mv |
Garzón Ospina, Diego Edison |
dc.subject.ddc.spa.fl_str_mv |
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology 61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health |
topic |
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology 61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health Plasmodium vivax Roptrias Diversidad genética Repeticiones en tándem Pvron4 Selección natural Restricción funcional |
dc.subject.proposal.spa.fl_str_mv |
Plasmodium vivax Roptrias Diversidad genética Repeticiones en tándem Pvron4 Selección natural Restricción funcional |
description |
El diseño de una vacuna contra Plasmodium vivax se ha centrado en la selección de antígenos involucrados en el proceso de invasión del parásito que presenten bajo polimorfismo, para así evitar las respuestas inmunes alelo-específicas. La proteína de cuello de roptrias-4 (RON4) ha sido caracterizada como un miembro indispensable del tight junction, un complejo proteico esencial en la invasión a los hepatocitos y/o eritrocitos. Sin embargo, poco se conoce acerca de su variabilidad genética. En este estudio, se analizó la diversidad genética y haplotípica del locus pvron4 a partir de 73 secuencias de ADN obtenidas de aislados clínicos colombianos, colectados entre los años 2007 y 2015. El efecto de la selección natural, así como las relaciones evolutivas entre especies emparentadas, fueron caracterizados mediante enfoques de genética de poblaciones y evolución molecular, con el fin de explicar el patrón de variación observado en el locus. Los resultados mostraron que, aunque pvron4 posee una baja diversidad genética a nivel de secuencia, un número variable de repeticiones en tándem hacia la región N-terminal genera un alto polimorfismo en tamaño. La región central y C-terminal de la proteína, son altamente conservadas intra- e interespecies, como consecuencia de la selección purificante. Por lo tanto, estas regiones parecen tener una restricción funcional o estructural, lo que las convierte en regiones prometedoras a incluir en el diseño de una vacuna altamente eficiente, basada en subunidades. |
publishDate |
2016 |
dc.date.issued.spa.fl_str_mv |
2016 |
dc.date.accessioned.spa.fl_str_mv |
2019-07-02T15:44:28Z |
dc.date.available.spa.fl_str_mv |
2019-07-02T15:44:28Z |
dc.type.spa.fl_str_mv |
Trabajo de grado - Maestría |
dc.type.driver.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
dc.type.version.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion |
dc.type.content.spa.fl_str_mv |
Text |
dc.type.redcol.spa.fl_str_mv |
http://purl.org/redcol/resource_type/TM |
status_str |
acceptedVersion |
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/59280 |
dc.identifier.eprints.spa.fl_str_mv |
http://bdigital.unal.edu.co/56659/ |
url |
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/59280 http://bdigital.unal.edu.co/56659/ |
dc.language.iso.spa.fl_str_mv |
spa |
language |
spa |
dc.relation.ispartof.spa.fl_str_mv |
Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Posgrado Interfacultades en Microbiología Posgrado Interfacultades en Microbiología |
dc.relation.references.spa.fl_str_mv |
Buitrago Puentes, Sindy Paola (2016) Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia-Sede Bogotá. |
dc.rights.spa.fl_str_mv |
Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia |
dc.rights.coar.fl_str_mv |
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
dc.rights.license.spa.fl_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional |
dc.rights.uri.spa.fl_str_mv |
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ |
dc.rights.accessrights.spa.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional Derechos reservados - Universidad Nacional de Colombia http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/ http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.mimetype.spa.fl_str_mv |
application/pdf |
institution |
Universidad Nacional de Colombia |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/59280/1/SindyP.BuitragoPuentes.2016.pdf https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/59280/2/SindyP.BuitragoPuentes.2016.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
6a1a0329b41415478b75f459983e532c 07705c28fbd5d70b75c8f81614854905 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombia |
repository.mail.fl_str_mv |
repositorio_nal@unal.edu.co |
_version_ |
1814089740203327488 |
spelling |
Atribución-NoComercial 4.0 InternacionalDerechos reservados - Universidad Nacional de Colombiahttp://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/info:eu-repo/semantics/openAccesshttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Garzón Ospina, Diego EdisonManuel Alfonso, Patarroyo (Thesis advisor)8d08dd5e-989e-41d2-b365-b6757ca7e3cf-1Buitrago Puentes, Sindy Paolaf47457df-cac9-4e25-96b2-4f637bf1db653002019-07-02T15:44:28Z2019-07-02T15:44:28Z2016https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/59280http://bdigital.unal.edu.co/56659/El diseño de una vacuna contra Plasmodium vivax se ha centrado en la selección de antígenos involucrados en el proceso de invasión del parásito que presenten bajo polimorfismo, para así evitar las respuestas inmunes alelo-específicas. La proteína de cuello de roptrias-4 (RON4) ha sido caracterizada como un miembro indispensable del tight junction, un complejo proteico esencial en la invasión a los hepatocitos y/o eritrocitos. Sin embargo, poco se conoce acerca de su variabilidad genética. En este estudio, se analizó la diversidad genética y haplotípica del locus pvron4 a partir de 73 secuencias de ADN obtenidas de aislados clínicos colombianos, colectados entre los años 2007 y 2015. El efecto de la selección natural, así como las relaciones evolutivas entre especies emparentadas, fueron caracterizados mediante enfoques de genética de poblaciones y evolución molecular, con el fin de explicar el patrón de variación observado en el locus. Los resultados mostraron que, aunque pvron4 posee una baja diversidad genética a nivel de secuencia, un número variable de repeticiones en tándem hacia la región N-terminal genera un alto polimorfismo en tamaño. La región central y C-terminal de la proteína, son altamente conservadas intra- e interespecies, como consecuencia de la selección purificante. Por lo tanto, estas regiones parecen tener una restricción funcional o estructural, lo que las convierte en regiones prometedoras a incluir en el diseño de una vacuna altamente eficiente, basada en subunidades.Abstract. Designing a vaccine against Plasmodium vivax has been focused on selecting antigens involved in parasite mechanisms to invade red blood cells; such antigens must have domains with low polymorphism to avoid inducing allele-specific immune responses. The rhoptry neck protein 4 (RON4) has been characterized as a vital member of the tight junction, a protein complex which is essential for invasion of hepatocytes and/or erythrocytes; however, little is known about this locus’ genetic diversity. In this study, the genetic and haplotype diversity of the pvron4 locus were analyzed from 73 DNA sequences obtained from Colombian P. vivax clinical isolates collected between 2007 and 2015. The effect of natural selection and the evolutionary relationships between closely related species were characterized by population genetics and molecular evolutionary approaches, to explain the pattern of genetic variation observed in the locus. The results showed that, although pvron4 had a low genetic diversity at sequence level, a variable amount of tandem repeats at the N-terminal region led to an extensive size polymorphism. On the other hand, the central and C-terminal regions are highly conserved at intra- and inter-species level, as a consequence of a purifying selection effect. Thus, these regions seem to be under functional or structural constraint, representing promising candidates when designing a highly efficient subunit-based vaccine against P. vivax.Maestríaapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ciencias Posgrado Interfacultades en MicrobiologíaPosgrado Interfacultades en MicrobiologíaBuitrago Puentes, Sindy Paola (2016) Análisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015. Maestría thesis, Universidad Nacional de Colombia-Sede Bogotá.57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and healthPlasmodium vivaxRoptriasDiversidad genéticaRepeticiones en tándemPvron4Selección naturalRestricción funcionalAnálisis de la variabilidad genética y las fuerzas evolutivas que actúan sobre la proteína del cuello de roptrias 4 de Plasmodium vivax (PvRON4), a partir de aislados Colombianos obtenidos entre 2007-2015.Trabajo de grado - Maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionTexthttp://purl.org/redcol/resource_type/TMORIGINALSindyP.BuitragoPuentes.2016.pdfapplication/pdf2614397https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/59280/1/SindyP.BuitragoPuentes.2016.pdf6a1a0329b41415478b75f459983e532cMD51THUMBNAILSindyP.BuitragoPuentes.2016.pdf.jpgSindyP.BuitragoPuentes.2016.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg5337https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/59280/2/SindyP.BuitragoPuentes.2016.pdf.jpg07705c28fbd5d70b75c8f81614854905MD52unal/59280oai:repositorio.unal.edu.co:unal/592802023-04-01 23:04:57.154Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co |