Comparación de los proteomas de la semilla de dos genotipos de Coffea Arabica L. Con diferencias en el nivel de oviposición de la broca del café Hypothenemus hampei (Ferrari) (Coleoptera: Curculionidae: Scolytinae).

Hypothenemus hampei es en la actualidad la plaga más importante del cultivo de café, pues reduce la producción y afecta la calidad del grano. En C. arabica, específicamente en algunas introducciones etíopes se ha encontrado una menor oviposición de la broca hasta un 35% menos que Caturra. En el presente trabajo se evaluó la expresión diferencial de proteínas en semillas de Caturra variedad susceptible al ataque de la broca y en semillas de la introducción etíope CCC534, utilizando electroforesis bidimensional (2-D), secuenciación por espectrometría de masas y análisis bioinformatico para interpretar secuencias peptídicas estableciendo la función putativa de cada proteína secuenciada. Inicialmente se optimizó la metodología de extracción y limpieza de proteínas de semillas de café para la elaboración de los mapas proteómicos. Para la separación de las proteínas por punto isoléctrico se utilizaron dos tamaños de geles de isoelectroenfoque (IPG) de 7 y 24 cm; una vez enfocadas las proteínas se realizó la segunda dimensión en diferentes cámaras de electroforesis de acuerdo al tamaño IPG. Se realizó electroforesis diferencial en gel bidimensional, los geles se digitalizaron, procediendo a detectar, comparar y cortar un total de 35 manchas proteicas que estuvieron diferencialmente o sobre-acumuladas en semillas de CCC534, para ser secuenciadas por espectrometría de masas. De las 30 proteínas diferenciales y sobre-acumuladas identificadas, siete presentaron homología con proteínas de oxidoreductasa, cuatro con proteasa, tres con proteínas de defensa, seis fueron transferasas, tres participan en la Unión de ATP, dos fueron de unión de ARN, una proteína de almacenamiento, una actividad lipoxigenasa, una de transporte de electrones, dos de unión de GTP y una implicada en la unión de iones de Magnesio. La información obtenida en este trabajo es el inicio de una serie de investigaciones diseñadas para descifrar el factor de resistencia de las introducciones con menor oviposición de la broca, que ayudarían en un futuro a descubrir mecanismos de control con esta plaga. aqui termina el resumen en español.

• Autores: Bustamante Giraldo, Liliana Jimena
• Fecha de publicación: 2013
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/21718
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/21718; http://bdigital.unal.edu.co/12690/
• Palabra clave: 63 Agricultura y tecnologías relacionadas / Agriculture; Proteoma; Electroforesis diferencial en gel; Espectrometría de masas; Broca del café; Caturra; CCC534; Proteome; Differential electrophoresis in gel; Mass spectrometry; Broca (Hypothenemus hampei) Caturra; CCC534
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