Estandarización y evaluación de tres sistemas de rep-pcr para la tipificación de klebsiella pneumoniae

Para la tipificación de K. pneumoniae se evaluaron los resultados de tres variantes de la técnica de amplificación de secuencias repetidas (rep-PCR) comparándolos con los resultados de la tipificación con electroforesis en gel de campos pulsados (PFGE). Se analizaron dos poblaciones de K. pneumoniae: una constituida por aislamientos causantes de infección nosocomial, recolectados durante un año en un hospital de tercer nivel y otra asociada a un brote intrahospitalario en una unidad de cuidado intensivo neonatal. La tipificación por PFGE se realizó con macrofragmentos obtenidos con Xbal. La rep-PCR se realizó con tres conjuntos de iniciadores correspondientes a las secuencias, BOX, ERIC y REP. Todos los aislamientos fueron tipificables por los tres sistemas rep-PCR y fueron discriminados de manera similar a lo obtenido con PFGE (D = 0.978). El buen poder discriminatorio (D = 0.974) obtenido con los procedimientos rep-PCR estandarizados permite sugerir el empleo de REP-PCR y BOX-PCR para tipificación rápida de aislamientos de K. pneumoniae, aplicada a estudios de epidemiología molecular de la infección nosocomial.

• Autores: Mantilla, Jose Ramón; Garcia, Ibonne; Espinal, Paula Andrea; Valenzuela, Emilia Maria
• Tipo de recurso: Article of journal
• Fecha de publicación: 2004
• Institución: Universidad Nacional de Colombia
• Repositorio: Universidad Nacional de Colombia
• Idioma: spa
• OAI Identifier: oai:repositorio.unal.edu.co:unal/22907
• Acceso en línea: https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/22907; http://bdigital.unal.edu.co/13942/
• Palabra clave: Klebsiella pneumoniae; PFGE; rep-PCR; genotyping; Klebsiella pneumoniae; PFGE; rep-PCR; genotipificación.
• Rights: openAccess
• License: Atribución-NoComercial 4.0 Internacional