Analizando datos RNA-Seq en procariotas: una revisión para no expertos
La secuenciación de transcritos con RNA-Seq es hoy en día una de las técnicas más populares en los estudios transcriptómicos. Relativamente reciente, esta técnica ha permitido la ecuenciación de transcritos de RNA en una escala y profundidad no alcanzada por otras técnicas anteriores. Sin embargo, e...
- Autores:
-
Rodríguez Cubillos, Andrés Eduardo
Perlaza-Jiménez, Laura
Bernal Giraldo, Adriana Jimena
- Tipo de recurso:
- Article of journal
- Fecha de publicación:
- 2014
- Institución:
- Universidad Nacional de Colombia
- Repositorio:
- Universidad Nacional de Colombia
- Idioma:
- spa
- OAI Identifier:
- oai:repositorio.unal.edu.co:unal/73850
- Acceso en línea:
- https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/73850
http://bdigital.unal.edu.co/38327/
- Palabra clave:
- 5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Ciencias biológicas
Biología celular
Biología molecular
Bioinformática
analysis
experimental design
prokaryotes
RNA-Seq
análisis bioinformático
diseño experimental
procariotas
RNA-Seq.
- Rights
- openAccess
- License
- Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Summary: | La secuenciación de transcritos con RNA-Seq es hoy en día una de las técnicas más populares en los estudios transcriptómicos. Relativamente reciente, esta técnica ha permitido la ecuenciación de transcritos de RNA en una escala y profundidad no alcanzada por otras técnicas anteriores. Sin embargo, el alcance de las conclusiones que se pueden sacar depende estrictamente de un proceso adecuado, desde el diseño experimental hasta el análisis bioinformático de los datos. Dadas las diferencias en el proceso transcripcional de las células eucariotas y procariotas, el análisis de RNA-Seq deberá tener ciertas consideraciones dependiendo del tipo de organismo estudiado. En esta revisión se exponen los principales factores a tener en cuenta para lograr un análisis de RNA-Seq consistente, replicable y concluyente, enfocándose específicamente en organismos procariotas. |
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