Analizando datos RNA-Seq en procariotas: una revisión para no expertos

La secuenciación de transcritos con RNA-Seq es hoy en día una de las técnicas más populares en los estudios transcriptómicos. Relativamente reciente, esta técnica ha permitido la ecuenciación de transcritos de RNA en una escala y profundidad no alcanzada por otras técnicas anteriores. Sin embargo, e...

Full description

Autores:
Rodríguez Cubillos, Andrés Eduardo
Perlaza-Jiménez, Laura
Bernal Giraldo, Adriana Jimena
Tipo de recurso:
Article of journal
Fecha de publicación:
2014
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/73850
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/73850
http://bdigital.unal.edu.co/38327/
Palabra clave:
5 Ciencias naturales y matemáticas / Science
57 Ciencias de la vida; Biología / Life sciences; biology
Ciencias biológicas
Biología celular
Biología molecular
Bioinformática
analysis
experimental design
prokaryotes
RNA-Seq
análisis bioinformático
diseño experimental
procariotas
RNA-Seq.
Rights
openAccess
License
Atribución-NoComercial 4.0 Internacional
Description
Summary:La secuenciación de transcritos con RNA-Seq es hoy en día una de las técnicas más populares en los estudios transcriptómicos. Relativamente reciente, esta técnica ha permitido la ecuenciación de transcritos de RNA en una escala y profundidad no alcanzada por otras técnicas anteriores. Sin embargo, el alcance de las conclusiones que se pueden sacar depende estrictamente de un proceso adecuado, desde el diseño experimental hasta el análisis bioinformático de los datos. Dadas las diferencias en el proceso transcripcional de las células eucariotas y procariotas, el análisis de RNA-Seq deberá tener ciertas consideraciones dependiendo del tipo de organismo estudiado. En esta revisión se exponen los principales factores a tener en cuenta para lograr un análisis de RNA-Seq consistente, replicable y concluyente, enfocándose específicamente en organismos procariotas.