Visual attention models and arse representations for morphometrical image analysis

Abstract. Medical diagnosis, treatment, follow-up and research activities are nowadays strongly supported on different types of diagnostic images, whose main goal is to provide an useful exchange of medical knowledge. This multi-modal information needs to be processed in order to extract information...

Full description

Autores:
Rueda Olarte, Andrea del Pilar
Tipo de recurso:
Doctoral thesis
Fecha de publicación:
2013
Institución:
Universidad Nacional de Colombia
Repositorio:
Universidad Nacional de Colombia
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repositorio.unal.edu.co:unal/21177
Acceso en línea:
https://repositorio.unal.edu.co/handle/unal/21177
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Palabra clave:
46 Lenguas española y portuguesa / Specific languages
61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health
62 Ingeniería y operaciones afines / Engineering
Computational neuroanantomy
Sparse representations
Visual attention models
Machine learning techniques
Alzheimer's disease
Semantic-based representations
Visual pattern analysis
Neuroanatomía computacional
Representaciones escasas
Modelos de atención visual
Técnicas de aprendizaje de máquina
Enfermedad de Alzheimer
Representaciones basadas en semántica
Análisis de patrones visuales
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description Abstract. Medical diagnosis, treatment, follow-up and research activities are nowadays strongly supported on different types of diagnostic images, whose main goal is to provide an useful exchange of medical knowledge. This multi-modal information needs to be processed in order to extract information exploitable within the context of a particular medical task. In despite of the relevance of these complementary sources of medical knowledge, medical images are rarely further processed in actual clinical practice, so the specialists take decisions only based in the raw data. A new trend in the development of medical image processing and analysis tools follows the idea of biologically-inspired methods, which resemble the performance of the human vision system. Visual attention models and sparse representations are examples of this tendency. Based on this, the aim of this thesis was the development of a set of computational methods for automatic morph metrical analysis, combining the relevant region extraction power of visual attention models with the incorporation of a priori information capabilities of sparse representations. The combination of these biologically inspired tools with common machine learning techniques allowed the identification of visual patterns relevant for pathology discrimination, improving the accuracy and interpretability of morph metric measures and comparisons. After extensive validations with different image data sets, the computational methods proposed in this thesis seems to be promising tools for the definition of anatomical biomarkers, based on visual pattern analysis, and suitable for patient's diagnosis, prognosis and follow-up.
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In despite of the relevance of these complementary sources of medical knowledge, medical images are rarely further processed in actual clinical practice, so the specialists take decisions only based in the raw data. A new trend in the development of medical image processing and analysis tools follows the idea of biologically-inspired methods, which resemble the performance of the human vision system. Visual attention models and sparse representations are examples of this tendency. Based on this, the aim of this thesis was the development of a set of computational methods for automatic morph metrical analysis, combining the relevant region extraction power of visual attention models with the incorporation of a priori information capabilities of sparse representations. The combination of these biologically inspired tools with common machine learning techniques allowed the identification of visual patterns relevant for pathology discrimination, improving the accuracy and interpretability of morph metric measures and comparisons. After extensive validations with different image data sets, the computational methods proposed in this thesis seems to be promising tools for the definition of anatomical biomarkers, based on visual pattern analysis, and suitable for patient's diagnosis, prognosis and follow-up.Las actividades de diagnóstico, tratamiento, seguimiento e investigación en medicina están actualmente soportadas en diferentes clases de imágenes diagnósticas, cuyo objetivo principal es el de proveer un intercambio efectivo de conocimiento médico. Esta información multimodal necesita ser procesada con el objetivo de extraer información aprovechable en el contexto de una tarea médica particular. A pesar de la relevancia de estas fuentes complementarias de información clínica, las imágenes médicas son raramente procesadas en la práctica clínica actual, de forma que los especialistas sólo toman decisiones basados en los datos crudos. Una nueva tendencia en el desarrollo de herramientas de análisis y procesamiento de imágenes médicas persigue la idea de métodos biológicamente inspirados, que se asemejan al sistema de visión humana. Son ejemplos de esta tendencia los modelos de atención visual y las representaciones escasas (sparse representations). Con base en esto, el objetivo de esta tesis fue el desarrollo de un conjunto de métodos computacionales para soportar automáticamente los análisis morfo métricos, combinando el poder de extracción de regiones relevantes de los modelos de atención visual junto con la capacidad de incorporación de información a priori de las representaciones escasas. La combinación de estos métodos biológicamente inspirados con técnicas de aprendizaje de maquina facilito la identificación de patrones visuales relevantes para discriminar patologías cerebrales, mejorando la precisión e interpretabilidad de las medidas y comparaciones morfo métricas. Después de extensivas validaciones con diferentes conjuntos de imágenes, los métodos computacionales propuestos en esta tesis se perfilan como herramientas prometedoras para la definición de biomarcadores anatómicos, basados en el análisis visual de patrones, y convenientes para el diagnóstico, pronóstico y seguimiento del paciente.Doctoradoapplication/pdfspaUniversidad Nacional de Colombia Sede Bogotá Facultad de Ingeniería Departamento de Ingeniería de Sistemas e IndustrialDepartamento de Ingeniería de Sistemas e IndustrialRueda Olarte, Andrea del Pilar (2013) Visual attention models and arse representations for morphometrical image analysis. Doctorado thesis, Universidad Nacional de Colombia.46 Lenguas española y portuguesa / Specific languages61 Ciencias médicas; Medicina / Medicine and health62 Ingeniería y operaciones afines / EngineeringComputational neuroanantomySparse representationsVisual attention modelsMachine learning techniquesAlzheimer's diseaseSemantic-based representationsVisual pattern analysisNeuroanatomía computacionalRepresentaciones escasasModelos de atención visualTécnicas de aprendizaje de máquinaEnfermedad de AlzheimerRepresentaciones basadas en semánticaAnálisis de patrones visualesVisual attention models and arse representations for morphometrical image analysisTrabajo de grado - Doctoradoinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06Texthttp://purl.org/redcol/resource_type/TDORIGINAL299813.2013.pdfapplication/pdf12850293https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/21177/1/299813.2013.pdf1428f2cb1d0fa5a5b256dca887d9b3acMD51THUMBNAIL299813.2013.pdf.jpg299813.2013.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg4336https://repositorio.unal.edu.co/bitstream/unal/21177/2/299813.2013.pdf.jpg0b9db207f284fe17c83992cef563ba83MD52unal/21177oai:repositorio.unal.edu.co:unal/211772023-09-30 23:05:48.826Repositorio Institucional Universidad Nacional de Colombiarepositorio_nal@unal.edu.co