Segmentación de las arterias carótidas en imágenes de TC con el uso de un modelo de cilindro generalizado derecho

La luz arterial está modelada por un cilindro continuo generalizado derecho con parámetros constantes por partes. El método se basa en la identificación de los parámetros de cada pieza a partir de una serie de contornos extraídos a lo largo de un eje aproximado de la arteria. Esta curva está definid...

Full description

Autores:
Flórez Valencia, Leonardo
Azencot, Jacques
Orkisz, Maciej
Tipo de recurso:
Trabajo de grado de pregrado
Fecha de publicación:
2010
Institución:
Universidad Autónoma de Bucaramanga - UNAB
Repositorio:
Repositorio UNAB
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.unab.edu.co:20.500.12749/8947
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/20.500.12749/8947
Palabra clave:
Innovaciones tecnológicas
Ciencia de los computadores
Desarrollo de tecnología
Ingeniería de sistemas
Investigaciones
Tecnologías de la información y las comunicaciones
TIC´s
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Technology development
Systems engineering
Investigations
Information and communication technologies
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description La luz arterial está modelada por un cilindro continuo generalizado derecho con parámetros constantes por partes. El método se basa en la identificación de los parámetros de cada pieza a partir de una serie de contornos extraídos a lo largo de un eje aproximado de la arteria. Esta curva está definida por un camino mínimo entre los puntos finales de la arteria. Los contornos se extraen utilizando el Fast Marching algoritmo. La identificación de los parámetros axiales se basa en una geometría analogía con las curvas helicoidales, mientras que la identificación de los parámetros de la superficie utiliza la descomposición en serie de Fourier de los contornos. Así identificado los parámetros se utilizan como observaciones en un esquema de estimación óptimo de Kalman que gestiona la consistencia espacial de una pieza a otra. El método se evaluó en 46 conjuntos de datos de MICCAI 3D Segmentation in the Clinic Gran desafío: segmentación y estenosis de la luz de la bifurcación carotídea Calificación (http://cls2009.bigr.nl).
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Baltaxe Milwer, M. and Flórez Valencia, L. and Hernández Hoyos, M. and Magnin, I.E. and Orkisz, M. Fast marching contours for the segmentation of vessel lumen in CTA cross-sections. Conf. Proc. IEEE Eng. Med. Biol. Soc., pages 791-794, Lyon, France, 2007. IEEE.
Flórez Valencia, L. and Azencot, J. and Vincent, F. and Orkisz, M. and Magnin, I.E. Segmentation and Quantification of Blood Vessels in 3D Images using a Right Generalized Cylinder State Model. Proc. IEEE Int. Conf. Image Process., pages 2441--2444, 2006.
Flórez Valencia, L. and Vincent, F. and Orkisz, M. Fast 3D presegmentation of arteries in computed tomography angiograms. Int. Conf. Comput. Vision & Graphics, pages 87--88, Warsaw, Poland, 2004.
Hameeteman, K. and Zuluaga, M. and Joskowicz, L. and Freiman, M. and van Walsum, T. 3D Segmentation in the Clinic: Carotid Lumen Segmentation and Stenosis Grading Challenge. 2009. http://cls2009.bigr.nl.
Hernández Hoyos, M. and Orkisz, M. and Douek, P.C. and Magnin, I.E. Assessment of carotid artery stenoses in 3D contrast-enhanced magnetic resonance angiography, based on improved generation of the centerline. Mach. Graphics Vision, 14(4):349--378, 2005.
Kakadiaris, I.A. and Pednekar, A. and Santamaría-Pang, A. Threedimensional shape-motion analysis of the left anterior descending coronary artery in EBCT images. In Barillot, C. and Haynor, D.R. and Hellier, P., editors, MICCAI, pages 1025--1033, 2004. Springer.
Kalman, R.E. A New Approach to Linear Filtering and Prediction Problems. Trans ASME--J. Basic Engineering, 82(Series D):35-- 45, 1960.
Josef Kittler and John Illingworth and J. Föglein. Threshold selection based on a simple image statistic. Comput. Vision Graphics Image Process., 30(2):125-147, 1985.
Maurer,Jr., Calvin R. and Qi, Rensheng and Raghavan, Vijay. A Linear Time Algorithm for Computing Exact Euclidean Distance Transforms of Binary Images in Arbitrary Dimensions. IEEE Trans. Pattern Anal. Mach. Intell., 25(2):265--270, 2003.
Sethian, J.A. A Fast Marching Level Set Method for Monotonically Advancing Fronts. Proc. Nat. Acad. Sci., number 4, pages 1591-- 1595, 1996.
Welch, G. and Bishop, G. An Introduction to the Kalman Filter. SIGGRAPH 2001, Course 8, Chapel Hill, NC, 2001.
Wink, O. and Niessen, W.J. and Frangi, A.F. and Verdonck, B. and Viergever, M.A. 3D MRA coronary axis determination using a minimum cost path approach. Magnetic Resonance in Medicine, 47(6):1169--1175, 2002.
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Los contornos se extraen utilizando el Fast Marching algoritmo. La identificación de los parámetros axiales se basa en una geometría analogía con las curvas helicoidales, mientras que la identificación de los parámetros de la superficie utiliza la descomposición en serie de Fourier de los contornos. Así identificado los parámetros se utilizan como observaciones en un esquema de estimación óptimo de Kalman que gestiona la consistencia espacial de una pieza a otra. El método se evaluó en 46 conjuntos de datos de MICCAI 3D Segmentation in the Clinic Gran desafío: segmentación y estenosis de la luz de la bifurcación carotídea Calificación (http://cls2009.bigr.nl).The arterial lumen is modeled by a continuous right generalized cylinder with piece-wise constant parameters. The method is based on the identification of the parameters of each piece from a series of contours extracted along an approximate axis of the artery. This curve is defined by a minimal path between the artery end-points. The contours are extracted using the Fast Marching algorithm. The identification of the axial parameters is based on a geometrical analogy with helical curves, while the identification of the surface parameters uses the Fourier series decomposition of the contours. Thus identified parameters are used as observations in a Kalman optimal estimation scheme that manages the spatial consistency from each piece to another. The method was evaluated on 46 datasets from the MICCAI 3D Segmentation in the Clinic Grand Challenge: Carotid Bifurcation Lumen Segmentation and Stenosis Grading (http://cls2009.bigr.nl).application/pdfspaUniversidad Autónoma de Bucaramanga UNABhttps://revistas.unab.edu.co/index.php/rcc/article/view/1390/1334https://revistas.unab.edu.co/index.php/rcc/article/view/1390Azencot, J. and Orkisz, M. Deterministic and stochastic state model of right generalized cylinder (RGC-sm): application in computer phantoms synthesis. Graph. Models, 65(6):323--350, 2003.Baltaxe Milwer, M. and Flórez Valencia, L. and Hernández Hoyos, M. and Magnin, I.E. and Orkisz, M. Fast marching contours for the segmentation of vessel lumen in CTA cross-sections. Conf. Proc. IEEE Eng. Med. Biol. Soc., pages 791-794, Lyon, France, 2007. IEEE.Flórez Valencia, L. and Azencot, J. and Vincent, F. and Orkisz, M. and Magnin, I.E. Segmentation and Quantification of Blood Vessels in 3D Images using a Right Generalized Cylinder State Model. Proc. IEEE Int. Conf. Image Process., pages 2441--2444, 2006.Flórez Valencia, L. and Vincent, F. and Orkisz, M. Fast 3D presegmentation of arteries in computed tomography angiograms. Int. Conf. Comput. Vision & Graphics, pages 87--88, Warsaw, Poland, 2004.Hameeteman, K. and Zuluaga, M. and Joskowicz, L. and Freiman, M. and van Walsum, T. 3D Segmentation in the Clinic: Carotid Lumen Segmentation and Stenosis Grading Challenge. 2009. http://cls2009.bigr.nl.Hernández Hoyos, M. and Orkisz, M. and Douek, P.C. and Magnin, I.E. Assessment of carotid artery stenoses in 3D contrast-enhanced magnetic resonance angiography, based on improved generation of the centerline. Mach. Graphics Vision, 14(4):349--378, 2005.Kakadiaris, I.A. and Pednekar, A. and Santamaría-Pang, A. Threedimensional shape-motion analysis of the left anterior descending coronary artery in EBCT images. In Barillot, C. and Haynor, D.R. and Hellier, P., editors, MICCAI, pages 1025--1033, 2004. Springer.Kalman, R.E. A New Approach to Linear Filtering and Prediction Problems. Trans ASME--J. Basic Engineering, 82(Series D):35-- 45, 1960.Josef Kittler and John Illingworth and J. Föglein. Threshold selection based on a simple image statistic. Comput. Vision Graphics Image Process., 30(2):125-147, 1985.Maurer,Jr., Calvin R. and Qi, Rensheng and Raghavan, Vijay. A Linear Time Algorithm for Computing Exact Euclidean Distance Transforms of Binary Images in Arbitrary Dimensions. IEEE Trans. Pattern Anal. Mach. Intell., 25(2):265--270, 2003.Sethian, J.A. A Fast Marching Level Set Method for Monotonically Advancing Fronts. Proc. Nat. Acad. Sci., number 4, pages 1591-- 1595, 1996.Welch, G. and Bishop, G. An Introduction to the Kalman Filter. SIGGRAPH 2001, Course 8, Chapel Hill, NC, 2001.Wink, O. and Niessen, W.J. and Frangi, A.F. and Verdonck, B. and Viergever, M.A. 3D MRA coronary axis determination using a minimum cost path approach. Magnetic Resonance in Medicine, 47(6):1169--1175, 2002.Derechos de autor 2010 Revista Colombiana de Computaciónhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/co/Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombiahttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2Revista Colombiana de Computación; Vol. 11 Núm. 2 (2010): Revista Colombiana de Computación; 79-93Innovaciones tecnológicasCiencia de los computadoresDesarrollo de tecnologíaIngeniería de sistemasInvestigacionesTecnologías de la información y las comunicacionesTIC´sTechnological innovationsComputer scienceTechnology developmentSystems engineeringInvestigationsInformation and communication technologiesICT'sArteryParametersCiencias de la computaciónIngeniero de sistemasInvestigacionesTecnología de la información y comunicaciónInnovaciones tecnológicasDesarrollo tecnológicoArteriaParámetrosSegmentación de las arterias carótidas en imágenes de TC con el uso de un modelo de cilindro generalizado derechoCarotid arteries segmentation in CT images with use of a right generalized cylinder modelinfo:eu-repo/semantics/articleArtículohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1http://purl.org/redcol/resource_type/CJournalArticlehttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85ORIGINAL2010_Articulo_Segmentación de las arterias carótidas en imágenes de TC con el uso de un modelo de cilindro generalizado derecho.pdf2010_Articulo_Segmentación de las arterias carótidas en imágenes de TC con el uso de un modelo de cilindro generalizado derecho.pdfArtículoapplication/pdf330100https://repository.unab.edu.co/bitstream/20.500.12749/8947/1/2010_Articulo_Segmentaci%c3%b3n%20de%20las%20arterias%20car%c3%b3tidas%20en%20im%c3%a1genes%20de%20TC%20con%20el%20uso%20de%20un%20modelo%20de%20cilindro%20generalizado%20derecho.pdf3546b8934638fa9b11cfb043098e25f2MD51open accessTHUMBNAIL2010_Articulo_Segmentación de las arterias carótidas en imágenes de TC con el uso de un modelo de cilindro generalizado derecho.pdf.jpg2010_Articulo_Segmentación de las arterias carótidas en imágenes de TC con el uso de un modelo de cilindro generalizado derecho.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg5643https://repository.unab.edu.co/bitstream/20.500.12749/8947/2/2010_Articulo_Segmentaci%c3%b3n%20de%20las%20arterias%20car%c3%b3tidas%20en%20im%c3%a1genes%20de%20TC%20con%20el%20uso%20de%20un%20modelo%20de%20cilindro%20generalizado%20derecho.pdf.jpg494134e2e340e164b9aa2ed008ef36bcMD52open access20.500.12749/8947oai:repository.unab.edu.co:20.500.12749/89472022-11-18 00:37:41.899open accessRepositorio Institucional | Universidad Autónoma de Bucaramanga - UNABrepositorio@unab.edu.co