Optimización del protocolo de extracción de adn con muestras de Vaccinium Floribundum del Páramo de Santurbán

Vaccinium floribundum Kunth (1819), comúnmente conocido como agraz, mortiño, o blueberry andino, es considerada una especie promisoria por sus características organolépticas, propiedades nutricionales y alto contenido de antioxidantes presentes en el fruto. Las condiciones óptimas para su crecimient...

Full description

Autores:
Mojica Candela, Daniela Johanna
Rondón González, Fernando
Quintero, Lorena
Garzón Gutiérrez, Luz Nayibe
Tipo de recurso:
http://purl.org/coar/resource_type/c_f744
Fecha de publicación:
2018
Institución:
Universidad Autónoma de Bucaramanga - UNAB
Repositorio:
Repositorio UNAB
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:repository.unab.edu.co:20.500.12749/21900
Acceso en línea:
http://hdl.handle.net/20.500.12749/21900
Palabra clave:
Natural sciences
Agraz
Organoleptic characteristics
Investigation
CTAB
Nutritional properties
Genetic diversity
DNA extraction protocol
Ciencias naturales
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Características organolépticas
Investigación
CTAB
Propiedades nutricionales
Diversidad genética
Protocolo de extracción de ADN
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description Vaccinium floribundum Kunth (1819), comúnmente conocido como agraz, mortiño, o blueberry andino, es considerada una especie promisoria por sus características organolépticas, propiedades nutricionales y alto contenido de antioxidantes presentes en el fruto. Las condiciones óptimas para su crecimiento y desarrollo se encuentran en lasregiones depáramo y subpáramo. En Colombia, su cultivo comercial se limita a Antioquia y Boyacá, aunque en algunos departamentos como Santander, se realiza la cosecha y comercialización de este fruto a partir de poblaciones naturales y muchas de ellas se encuentran localizadas a lo largo del flanco occidental de la cordillera oriental caracterizada por la presencia de zonas de páramo y subpáramo, generalmente amenazadas por diferentes actividades antrópicas. De manera general, en el país no se han realizado estudios que permitan establecer la diversidad genética molecular de las poblaciones naturales, siendo esta información importante para definir la estructura poblacional y crear planes de uso, manejo y conservación adecuados. Razón por la cual, el presente proyecto tuvo como objetivo determinar la distribución de esta especie en ocho localidades del páramo jurisdicción de Santurbán y realizar la optimización del protocolo de extracción de ADN para la especie V. floribundum. Este conocimiento será base parafuturos proyectos que permitan determinar la diversidad y estructura de las poblaciones naturales a partir de marcadores moleculares, información necesaria para generar los planes de manejo, uso y conservación de esta especie.
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Las condiciones óptimas para su crecimiento y desarrollo se encuentran en lasregiones depáramo y subpáramo. En Colombia, su cultivo comercial se limita a Antioquia y Boyacá, aunque en algunos departamentos como Santander, se realiza la cosecha y comercialización de este fruto a partir de poblaciones naturales y muchas de ellas se encuentran localizadas a lo largo del flanco occidental de la cordillera oriental caracterizada por la presencia de zonas de páramo y subpáramo, generalmente amenazadas por diferentes actividades antrópicas. De manera general, en el país no se han realizado estudios que permitan establecer la diversidad genética molecular de las poblaciones naturales, siendo esta información importante para definir la estructura poblacional y crear planes de uso, manejo y conservación adecuados. Razón por la cual, el presente proyecto tuvo como objetivo determinar la distribución de esta especie en ocho localidades del páramo jurisdicción de Santurbán y realizar la optimización del protocolo de extracción de ADN para la especie V. floribundum. Este conocimiento será base parafuturos proyectos que permitan determinar la diversidad y estructura de las poblaciones naturales a partir de marcadores moleculares, información necesaria para generar los planes de manejo, uso y conservación de esta especie.Universidad Industrial de SantanderVaccinium floribundum Kunth (1819), known as agraz, mortiño, or blueberry andino, is considered a promising species due to its organoleptic characteristics, nutritional properties and high content of antioxidants present in the fruit. The optimal conditions for its growth and development are found in the páramo and subpáramo regions. In Colombia, its commercial crop is limited to Antioquia and Boyacá, although in some departments such as Santander, the harvest and commercialization of this fruit is made from natural populations and many of them are located along the western flank of the eastern mountain range characterized by the presence of páramo and subpáramo zones, frequently threatened by anthropic activities. In general, studies have not been carried out in the country to establish the molecular genetic diversity of natural populations, and this is important to stablish the population structure and to create plans of adequate use, management and conservation. Thus, the principal goal of this study was to determine the distribution of this species in eight localities at the “Páramo Jurisdicción de Santurbán” and to standarize a protocol of DNA extraction for V. floribundum. This knowledge is a basis for future projects that allow to determine the diversity and structure of natural populations with the use of molecular markers, information necessary to generate management, use and conservation plans of this species.Modalidad Presencialapplication/pdfspaGeneración Creativa : Encuentro de Semilleros de Investigación UNABhttp://hdl.handle.net/20.500.12749/14242[1] Acuña Posada, R., E. Arbeláez-Cortés, N.E. Ardila, H. Arenas-Castro, S. Caballero, J. Chiriví-Salomón, A. Clavijo-G, A.J. Crawford, L.F. Dueñas, M. Elías-Gutiérrez, D. Escobar, M.D. Escobar L, M.A. Gonzalez, P. Jiménez[2] J. Pansu, A. Paz, P.C. Pulgarín-R, L. Quintero, L.I. QuanYoung, S. Restrepo, M. Ruiz-García, J.A. Sánchez, S. Uribe, N. Vargas Estupiñán, M. Vargas-Ramírez, y A.M. Vasco-Palacios. 2017. Recolección de tejidos biológicos para análisis genéticos (M Gonzalez y H Arenas, Eds.). Primera ed. Editorial Alexander von Humboldt, Bogotá, D. C., Colombia.[3] Arruda, S.R., D.G. Pereira, M.M. Silva-Castro, M.G. Brito, y A.M. Waldschmidt. 2017. An optimized protocol for DNA extraction in plants with a high content of secondary metabolites, based on leaves of Mimosa tenuiflora (Willd.) Poir. (Leguminosae). Genet. Mol. Res. 16(3): 1-9.[4] Boches, P.S., N. V. Bassil, y L.J. Rowland. 2005. Microsatellite markers for Vaccinium from EST and genomic libraries. Mol. Ecol. Notes 5(3): 657-660[5] Burden, D. 2012. Guide to the Disruption of Biological Samples. Random Prim. 25(12): 1-25.[6] Dellaporta, S.L.., J. Wood, y J.B. Hicks. 1983. A plant DNA minipreparation: version II. Plant Mol. Biol. Report. 1 Number 4: 19-20.[7] Doyle, J., y J. Doyle. 1991. DNA Isolation from Small Amount of Plant Tissue. Phytochem. Bull. 57: 13-15.[8] Fang, G., S. Hammar, y R. Rebecca. 1992. A quick and inexpensive method for removing polyssaccharides from plant genomic DNA. Biotechniques 13(1): 52-56.[9] Henry, R.J. 2014. Plant DNA extraction. Plant genotyping DNA fingerprinting plants (May): 239-249Available at http://www.cabi.org/cabebooks/ebook/20083014997.[10] Jardin botánico de Bogotá, J.C.M. complementación y validación, del protocolo de propagación in vitro de Vaccinium floribundum Kunth. Available at http://repositorio.jbb.gov.co/bitstream/001/408/1/Informe final 181-07.pdf[11] Muñoz, V. 2004. Determinación de Métodos para Producción de Mortiño (Vaccinium floribundum Kunth), con Fines de Propagación y Producción Comercial. 1(1).[12] Rangel - Ch., J.O. 2015. La biodiversidad de Colombia: significado y distribución regional. Rev. la Acad. Colomb. Ciencias Exactas, Físicas y Nat. 39(51): 176Available at http://www.raccefyn.co/index.php/raccefyn/article/view/1 36.[13] Reyes-Escogido, L., M. Balam-Chi, I. Rodríguez-Buenfil, J. Valdés, L. Kameyama, y F. Martínez-Pérez. 2010. 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Recuperado de: http://hdl.handle.net/20.500.12749/21900Optimización del protocolo de extracción de adn con muestras de Vaccinium Floribundum del Páramo de SanturbánOptimization of the DNA extraction protocol with samples of Vaccinium Floribundum from the Páramo de SanturbánConferenceinfo:eu-repo/semantics/conferenceProceedingsMemoria de eventoshttp://purl.org/coar/resource_type/c_f744info:eu-repo/semantics/acceptedVersionhttp://purl.org/redcol/resource_type/EC_ACUniversidad Autónoma de Bucaramanga UNABFacultad IngenieríaSistema de Investigación SIUNABNatural sciencesAgrazOrganoleptic characteristicsInvestigationCTABNutritional propertiesGenetic diversityDNA extraction protocolCiencias naturalesAgrazCaracterísticas organolépticasInvestigaciónCTABPropiedades nutricionalesDiversidad genéticaProtocolo de extracción de ADNTHUMBNAIL2018_Articulo_Rondon_Gonzalez_Fernando.pdf.jpg2018_Articulo_Rondon_Gonzalez_Fernando.pdf.jpgIM Thumbnailimage/jpeg9970https://repository.unab.edu.co/bitstream/20.500.12749/21900/3/2018_Articulo_Rondon_Gonzalez_Fernando.pdf.jpgf545ed4b5bfd5e903a8c54afb04410baMD53open accessORIGINAL2018_Articulo_Rondon_Gonzalez_Fernando.pdf2018_Articulo_Rondon_Gonzalez_Fernando.pdfArtículoapplication/pdf157118https://repository.unab.edu.co/bitstream/20.500.12749/21900/1/2018_Articulo_Rondon_Gonzalez_Fernando.pdfd63a2408faff15a9a1eaf1221cf1567fMD51open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-8829https://repository.unab.edu.co/bitstream/20.500.12749/21900/2/license.txt3755c0cfdb77e29f2b9125d7a45dd316MD52open access20.500.12749/21900oai:repository.unab.edu.co:20.500.12749/219002023-09-14 22:00:22.643open accessRepositorio Institucional | Universidad Autónoma de Bucaramanga - UNABrepositorio@unab.edu.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