Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs

This  paper  presents  the  development  and  implementation  of  the  system  that  serves  as  a  tool  for  the  study  and exploration...

Full description

Autores:
Tipo de recurso:
Fecha de publicación:
2009
Institución:
Universidad Industrial de Santander
Repositorio:
Repositorio UIS
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/8084
Acceso en línea:
https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistauisingenierias/article/view/239
https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/8084
Palabra clave:
Bioinformatics
resistance
DNA
amino acid
nucleotiden
protease
reverse transcriptase
Bioinformática
resistencia
ADN
aminoácido
nucleótido
proteasa
transcriptasa inversa
Rights
openAccess
License
Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
id UISANTADR2_e00f7ec42091ad00b2b57d0ac1bcfd33
oai_identifier_str oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/8084
network_acronym_str UISANTADR2
network_name_str Repositorio UIS
repository_id_str
spelling Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2info:eu-repo/semantics/openAccessAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)2009-07-152022-03-14T20:29:20Z2022-03-14T20:29:20Zhttps://revistas.uis.edu.co/index.php/revistauisingenierias/article/view/239https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/8084This  paper  presents  the  development  and  implementation  of  the  system  that  serves  as  a  tool  for  the  study  and exploration  of Human  Immunodefciency Virus  (HIV)  from  computational  analysis  of  these mutations,  taking genetic information itself. The analysis is performed using the information contained in the HIV genetic sequence and comparing it to reference sequences. Descriptions of the algorithms for alignment, mutation identifcation and resistance analysis applied to the genetic sequence of the virus are presented.Este artículo presenta el desarrollo e  implementación de un  sistema que  sirva como herramienta para el estudio y exploración del VIH a partir del análisis computacional de sus mutaciones,  teniendo en cuenta  la  información genética del mismo. El análisis se realiza empleando  la  información contenida en  la secuencia genética del VIH y  comparándola  con  secuencias  de  referencia.    Se  presenta  una  descripción  de  algoritmos  para  alineamiento, identifcación de mutaciones y análisis de resistencia aplicados a la secuencia genética del virus.application/pdfspaUniversidad Industrial de Santanderhttps://revistas.uis.edu.co/index.php/revistauisingenierias/article/view/239/833REVISTA UIS ENGENHARIAS; v. 8 n. 1 (2009): Revista UIS IngenieríasRevista UIS Ingenierías; Vol. 8 Núm. 1 (2009): Revista UIS IngenieríasRevista UIS Ingenierías; Vol. 8 No. 1 (2009): Revista UIS Ingenierías2145-84561657-4583BioinformaticsresistanceDNAamino acidnucleotidenproteasereverse transcriptaseBioinformáticaresistenciaADNaminoácidonucleótidoproteasatranscriptasa inversaComputational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugsHerramienta computacional para el análisis de mutaciones del VIH asociadas a susceptibilidad o resistencia a drogasinfo:eu-repo/semantics/articlehttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1Acero Barraza, Sandra MilenaCervantes Acosta, Guillermo JoséZurek Varela, Eduardo Enrique20.500.14071/8084oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/80842022-03-16 12:40:12.134metadata.onlyhttps://noesis.uis.edu.coDSpace at UISnoesis@uis.edu.co
dc.title.en-US.fl_str_mv Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
dc.title.es-ES.fl_str_mv Herramienta computacional para el análisis de mutaciones del VIH asociadas a susceptibilidad o resistencia a drogas
title Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
spellingShingle Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
Bioinformatics
resistance
DNA
amino acid
nucleotiden
protease
reverse transcriptase
Bioinformática
resistencia
ADN
aminoácido
nucleótido
proteasa
transcriptasa inversa
title_short Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
title_full Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
title_fullStr Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
title_full_unstemmed Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
title_sort Computational tool for the analysis of HIV mutations associated with susceptibility or resistance to drugs
dc.subject.en-US.fl_str_mv Bioinformatics
resistance
DNA
amino acid
nucleotiden
protease
reverse transcriptase
topic Bioinformatics
resistance
DNA
amino acid
nucleotiden
protease
reverse transcriptase
Bioinformática
resistencia
ADN
aminoácido
nucleótido
proteasa
transcriptasa inversa
dc.subject.es-ES.fl_str_mv Bioinformática
resistencia
ADN
aminoácido
nucleótido
proteasa
transcriptasa inversa
description This  paper  presents  the  development  and  implementation  of  the  system  that  serves  as  a  tool  for  the  study  and exploration  of Human  Immunodefciency Virus  (HIV)  from  computational  analysis  of  these mutations,  taking genetic information itself. The analysis is performed using the information contained in the HIV genetic sequence and comparing it to reference sequences. Descriptions of the algorithms for alignment, mutation identifcation and resistance analysis applied to the genetic sequence of the virus are presented.
publishDate 2009
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2022-03-14T20:29:20Z
dc.date.available.none.fl_str_mv 2022-03-14T20:29:20Z
dc.date.none.fl_str_mv 2009-07-15
dc.type.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
dc.type.coarversion.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_2df8fbb1
dc.identifier.none.fl_str_mv https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistauisingenierias/article/view/239
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/8084
url https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistauisingenierias/article/view/239
https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/8084
dc.language.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.relation.none.fl_str_mv https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistauisingenierias/article/view/239/833
dc.rights.license.none.fl_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.accessrights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.creativecommons.none.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.es-ES.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.source.pt-BR.fl_str_mv REVISTA UIS ENGENHARIAS; v. 8 n. 1 (2009): Revista UIS Ingenierías
dc.source.es-ES.fl_str_mv Revista UIS Ingenierías; Vol. 8 Núm. 1 (2009): Revista UIS Ingenierías
dc.source.en-US.fl_str_mv Revista UIS Ingenierías; Vol. 8 No. 1 (2009): Revista UIS Ingenierías
dc.source.none.fl_str_mv 2145-8456
1657-4583
institution Universidad Industrial de Santander
repository.name.fl_str_mv DSpace at UIS
repository.mail.fl_str_mv noesis@uis.edu.co
_version_ 1814095225862225920

Publicaciones similares