Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach

En esta tesis se realizó un estudio experimental y computacional de la acetilación de (R,S)-propranolol catalizada por lipasa B de Candida antarctica (CalB) en tolueno. Experimentalmente se encontró que CalB exhibe una enantioselectividad moderada (E = 61-63) y una quimioselectividad exclusiva que f...

Full description

Autores:
Escorcia Cabrera, Andrés Mauricio
Tipo de recurso:
http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
Fecha de publicación:
2015
Institución:
Universidad Industrial de Santander
Repositorio:
Repositorio UIS
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/31823
Acceso en línea:
https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/31823
https://noesis.uis.edu.co
Palabra clave:
Lipasa B De Candida Antarctica
Acilación
Enantioselectividad
Quimioselectividad
Dinámica Molecular
Mecánica Cuántica/Mecánica Molecular
Candida Antarctica Lipase B
Acylation
Enantioselectivity
Chemoselectivity
Molecular Dynamics
Quantum Mechanics/Molecular Mechanics
Rights
License
Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
id UISANTADR2_cb9e8996a256bae0a85b7efc8e2327d8
oai_identifier_str oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/31823
network_acronym_str UISANTADR2
network_name_str Repositorio UIS
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
dc.title.english.none.fl_str_mv Enantioselective and chemoselective acylation of (r,s)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
title Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
spellingShingle Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
Lipasa B De Candida Antarctica
Acilación
Enantioselectividad
Quimioselectividad
Dinámica Molecular
Mecánica Cuántica/Mecánica Molecular
Candida Antarctica Lipase B
Acylation
Enantioselectivity
Chemoselectivity
Molecular Dynamics
Quantum Mechanics/Molecular Mechanics
title_short Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
title_full Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
title_fullStr Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
title_full_unstemmed Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
title_sort Enantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approach
dc.creator.fl_str_mv Escorcia Cabrera, Andrés Mauricio
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Oliver Doerr, Markus Hans
Daza Espinosa, Martha Cecilia
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Escorcia Cabrera, Andrés Mauricio
dc.subject.none.fl_str_mv Lipasa B De Candida Antarctica
Acilación
Enantioselectividad
Quimioselectividad
Dinámica Molecular
Mecánica Cuántica/Mecánica Molecular
topic Lipasa B De Candida Antarctica
Acilación
Enantioselectividad
Quimioselectividad
Dinámica Molecular
Mecánica Cuántica/Mecánica Molecular
Candida Antarctica Lipase B
Acylation
Enantioselectivity
Chemoselectivity
Molecular Dynamics
Quantum Mechanics/Molecular Mechanics
dc.subject.keyword.none.fl_str_mv Candida Antarctica Lipase B
Acylation
Enantioselectivity
Chemoselectivity
Molecular Dynamics
Quantum Mechanics/Molecular Mechanics
description En esta tesis se realizó un estudio experimental y computacional de la acetilación de (R,S)-propranolol catalizada por lipasa B de Candida antarctica (CalB) en tolueno. Experimentalmente se encontró que CalB exhibe una enantioselectividad moderada (E = 61-63) y una quimioselectividad exclusiva que favorece la formación más rápida del R-O-acetil-propranolol, el cual se obtuvo con una pureza enantiomérica del 95-96 % a un grado de conversión del 21-33 %. Esta reacción involucra dos pasos. El primero (acilación) conduce a la formación de una acil-enzima reactiva. La quimio- y enantioselectividad se origina en el segundo (desacilación), cuando la acil-enzima transfiere el grupo acilo al propranolol. Ambos pasos ocurren vía la formación de un complejo enzima-sustrato no covalente inicial (complejo de Michaelis; CMC) y un intermediario tetraédrico (IT). La parte computacional de esta tesis se enfocó en la reacción de desacilación. Se modelaron los CMCs e ITs utilizando simulaciones combinadas de acoplamiento y dinámica molecular (DM). Adicionalmente, se calcularon los perfiles de reacción para la transformación de R- y S-propranolol utilizando un enfoque de mecánica cuántica/mecánica molecular (MC/MM). Únicamente se identificaron CMCs reactivos en los que el grupo hidroxilo del R- y S-propranolol se encuentra disponible para ser acilado por CalB. Se encontró además que la barrera de energía para la transformación de R-propranolol es 4.5 kcal/mol más baja que la del S-propranolol. También se identificaron las interacciones enzima-sustrato que son responsables de la enantioselectividad. Por otro lado, en contraste con lo que se sugiere comúnmente para las reacciones catalizadas por lipasas, se encontró que el IT no es una buena representación de los estados de transición. En general, los resultados computacionales proveen una explicación para la quimio- y enantioselectividad, así como elementos guía para mejorar la síntesis enantioselectiva del propranolol mediante un rediseño racional de CalB o de las condiciones de reacción.
publishDate 2015
dc.date.available.none.fl_str_mv 2015
2024-03-03T21:55:15Z
dc.date.created.none.fl_str_mv 2015
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2015
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2024-03-03T21:55:15Z
dc.type.local.none.fl_str_mv Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctorado
dc.type.hasversion.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_db06
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
format http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/31823
dc.identifier.instname.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co
url https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/31823
https://noesis.uis.edu.co
identifier_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.none.fl_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.rights.creativecommons.none.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty.none.fl_str_mv Facultad de Ciencias
dc.publisher.program.none.fl_str_mv Doctorado en Química
dc.publisher.school.none.fl_str_mv Escuela de Química
publisher.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
institution Universidad Industrial de Santander
bitstream.url.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/c5b45634-16ab-4d4c-8ed2-c1ef6cf4f21a/download
https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/0eca28f5-ffef-4d4d-88c1-1fa8503620ae/download
https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/5c0ae503-cdaa-498d-ac67-a9738d850ca9/download
bitstream.checksum.fl_str_mv a0580dcaef69b71666568afdf7df5159
522d93fcbc150efab303a8bbdfa4f205
f7dbf26223d1f27c78f2342a1470f075
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv DSpace at UIS
repository.mail.fl_str_mv noesis@uis.edu.co
_version_ 1808402385379262464
spelling Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Oliver Doerr, Markus HansDaza Espinosa, Martha CeciliaEscorcia Cabrera, Andrés Mauricio2024-03-03T21:55:15Z20152024-03-03T21:55:15Z20152015https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/31823Universidad Industrial de SantanderUniversidad Industrial de Santanderhttps://noesis.uis.edu.coEn esta tesis se realizó un estudio experimental y computacional de la acetilación de (R,S)-propranolol catalizada por lipasa B de Candida antarctica (CalB) en tolueno. Experimentalmente se encontró que CalB exhibe una enantioselectividad moderada (E = 61-63) y una quimioselectividad exclusiva que favorece la formación más rápida del R-O-acetil-propranolol, el cual se obtuvo con una pureza enantiomérica del 95-96 % a un grado de conversión del 21-33 %. Esta reacción involucra dos pasos. El primero (acilación) conduce a la formación de una acil-enzima reactiva. La quimio- y enantioselectividad se origina en el segundo (desacilación), cuando la acil-enzima transfiere el grupo acilo al propranolol. Ambos pasos ocurren vía la formación de un complejo enzima-sustrato no covalente inicial (complejo de Michaelis; CMC) y un intermediario tetraédrico (IT). La parte computacional de esta tesis se enfocó en la reacción de desacilación. Se modelaron los CMCs e ITs utilizando simulaciones combinadas de acoplamiento y dinámica molecular (DM). Adicionalmente, se calcularon los perfiles de reacción para la transformación de R- y S-propranolol utilizando un enfoque de mecánica cuántica/mecánica molecular (MC/MM). Únicamente se identificaron CMCs reactivos en los que el grupo hidroxilo del R- y S-propranolol se encuentra disponible para ser acilado por CalB. Se encontró además que la barrera de energía para la transformación de R-propranolol es 4.5 kcal/mol más baja que la del S-propranolol. También se identificaron las interacciones enzima-sustrato que son responsables de la enantioselectividad. Por otro lado, en contraste con lo que se sugiere comúnmente para las reacciones catalizadas por lipasas, se encontró que el IT no es una buena representación de los estados de transición. En general, los resultados computacionales proveen una explicación para la quimio- y enantioselectividad, así como elementos guía para mejorar la síntesis enantioselectiva del propranolol mediante un rediseño racional de CalB o de las condiciones de reacción.DoctoradoDoctor en QuímicaIn this thesis the kinetic resolution of (R,S)-propranolol via acetylation reaction catalyzed by Candida antarctica lipase B (CalB) in toluene was studied through an experimental and computational approach. It was experimentally found that CalB displays moderate enantioselectivity (E = 61-63) and exclusive chemoselectivity favoring the faster formation of R-O-acetyl-propranolol, which was obtained with an enantiomeric purity of 95- 96 % at a conversion degree of 21-33 %. This reaction involves two steps. The first step leads to the formation of a reactive acyl-enzyme (acylation). The chemo- and enantioselectivity originates from the second step (deacylation), when the acyl-enzyme transfers the acyl group to the racemic substrate. Both steps proceed via an initial noncovalent enzyme substrate complex (Michaelis complex; MCC) and a tetrahedral intermediate (TI). The computational part of this thesis was focused on the deacylation reaction. A combined docking and molecular dynamics (MD) protocol was used to model the MCCs and TIs. In addition, the reaction profiles for the transformation of R- and S-propranolol were computed by using a Quantum Mechanics/Molecular Mechanics (QM/MM) approach. Only reactive MCCs were identified for R- and S-propranolol, in which their hydroxyl group is available to be acetylated by CalB. Moreover, the energy barrier for the transformation of Rpropranolol into O-acetyl-propranolol was estimated to be 4.5 kcal/mol lower than that of S-propranolol. In addition, enzyme-substrate interactions responsible for the enantioselectivity of the reaction were identified. On the other hand, in contrast to what is commonly suggested for lipase-catalyzed reactions, the TI was not found to be a good representation of the transition states. Generally speaking, the computational results obtained here provide an explanation for the chemo- and enantioselectivity of the reaction, as well as guide elements for improving the enantioselective synthesis of S-propranolol through a rational redesign of CalB or the reaction conditions.application/pdfspaUniversidad Industrial de SantanderFacultad de CienciasDoctorado en QuímicaEscuela de QuímicaLipasa B De Candida AntarcticaAcilaciónEnantioselectividadQuimioselectividadDinámica MolecularMecánica Cuántica/Mecánica MolecularCandida Antarctica Lipase BAcylationEnantioselectivityChemoselectivityMolecular DynamicsQuantum Mechanics/Molecular MechanicsEnantioselective and chemoselective acylation of (rs)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approachEnantioselective and chemoselective acylation of (r,s)-propranolol catalyzed by candida antarctica lipase b: a theoretical and experimental approachTesis/Trabajo de grado - Monografía - Doctoradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_db06http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceORIGINALCarta de autorización.pdfapplication/pdf199405https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/c5b45634-16ab-4d4c-8ed2-c1ef6cf4f21a/downloada0580dcaef69b71666568afdf7df5159MD51Documento.pdfapplication/pdf22927268https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/0eca28f5-ffef-4d4d-88c1-1fa8503620ae/download522d93fcbc150efab303a8bbdfa4f205MD52Nota de proyecto.pdfapplication/pdf136703https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/5c0ae503-cdaa-498d-ac67-a9738d850ca9/downloadf7dbf26223d1f27c78f2342a1470f075MD5320.500.14071/31823oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/318232024-03-03 16:55:15.703http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/open.accesshttps://noesis.uis.edu.coDSpace at UISnoesis@uis.edu.co