Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis

La teoría endosimbiotica admite que los plastidios se originaron a partir de una bacteria fotosintética tragada por una célula eucariótica primitiva. En consecuencia, el genoma del cloroplasto permanece como una reminiscencia de este evento ancestral, aunque reducido en tamaño y número de genes. La...

Full description

Autores:
Jaimes Becerra, Adrián José
Tipo de recurso:
http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
Fecha de publicación:
2009
Institución:
Universidad Industrial de Santander
Repositorio:
Repositorio UIS
Idioma:
spa
OAI Identifier:
oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/22601
Acceso en línea:
https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/22601
https://noesis.uis.edu.co
Palabra clave:
Tic110
HCA
Repetición HEAT
Translocon del cloroplasto
Transporte de membrana.
Tic110; HCA; HEAT-repeat; chloroplast translocon; membrane transport.
Rights
License
Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
id UISANTADR2_be6a567215e091a5f871ff59e94967a2
oai_identifier_str oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/22601
network_acronym_str UISANTADR2
network_name_str Repositorio UIS
repository_id_str
dc.title.none.fl_str_mv Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
dc.title.english.none.fl_str_mv Tic110, involved in chloroplast protein translocation, contains highly divergent HEAT-like repeated motifs, as revealed by Hydrophobic Cluster Analysis.
title Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
spellingShingle Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
Tic110
HCA
Repetición HEAT
Translocon del cloroplasto
Transporte de membrana.
Tic110; HCA; HEAT-repeat; chloroplast translocon; membrane transport.
title_short Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
title_full Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
title_fullStr Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
title_full_unstemmed Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
title_sort Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysis
dc.creator.fl_str_mv Jaimes Becerra, Adrián José
dc.contributor.advisor.none.fl_str_mv Hernandez Torres, Jorge
Chomilier, Jacques
dc.contributor.author.none.fl_str_mv Jaimes Becerra, Adrián José
dc.subject.none.fl_str_mv Tic110
HCA
Repetición HEAT
Translocon del cloroplasto
Transporte de membrana.
topic Tic110
HCA
Repetición HEAT
Translocon del cloroplasto
Transporte de membrana.
Tic110; HCA; HEAT-repeat; chloroplast translocon; membrane transport.
dc.subject.keyword.none.fl_str_mv Tic110; HCA; HEAT-repeat; chloroplast translocon; membrane transport.
description La teoría endosimbiotica admite que los plastidios se originaron a partir de una bacteria fotosintética tragada por una célula eucariótica primitiva. En consecuencia, el genoma del cloroplasto permanece como una reminiscencia de este evento ancestral, aunque reducido en tamaño y número de genes. La mayoría de los genes en el plastidio fueron transferidos al genoma nuclear de la célula huésped y desde entonces, estos son codificados en el núcleo. Así, las proteínas del cloroplasto son sintetizadas en citósol con extensiones N-terminales llamadas péptidos transito y la maquinaria de importe fue requerida que apareciera en la evolución para transferir estas proteínas al estroma. Hasta ahora, dos complejos de proteínas han sido encontrado que median el proceso de importe: los translocones de la envoltura de la membrana Toc (externa) y Tic (interna). El origen evolutivo de muchas de las proteínas de los complejos Toc y tic han sido establecidos, pero esto no es aún el caso para la subunidad Tic110. Tic110 enlaza péptidos señal y sirve como un andamio molecular para el reclutamiento de componentes estromales. En este estudio después de un análisis de agregados hidrofóbicos (HCA) y reconocimiento de pliegue de las proteínas, nosotros concluimos que Tic110 esta compuesto de un seria de motifs repetidos relacionados a las repeticiones HEAT. La explicación para la presencia de tales repeticiones en Tic110 y su función más probable en el proceso de importe del cloroplasto es discutida.
publishDate 2009
dc.date.available.none.fl_str_mv 2009
2024-03-03T17:35:12Z
dc.date.created.none.fl_str_mv 2009
dc.date.issued.none.fl_str_mv 2009
dc.date.accessioned.none.fl_str_mv 2024-03-03T17:35:12Z
dc.type.local.none.fl_str_mv Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado
dc.type.hasversion.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coar.none.fl_str_mv http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
format http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.identifier.uri.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/22601
dc.identifier.instname.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl.none.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co
url https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/22601
https://noesis.uis.edu.co
identifier_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.language.iso.none.fl_str_mv spa
language spa
dc.rights.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
dc.rights.coar.fl_str_mv http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license.none.fl_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri.none.fl_str_mv http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
dc.rights.creativecommons.none.fl_str_mv Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0
Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.format.mimetype.none.fl_str_mv application/pdf
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty.none.fl_str_mv Facultad de Ciencias
dc.publisher.program.none.fl_str_mv Biología
dc.publisher.school.none.fl_str_mv Escuela de Biología
publisher.none.fl_str_mv Universidad Industrial de Santander
institution Universidad Industrial de Santander
bitstream.url.fl_str_mv https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/c3420991-40c3-4f31-b1b2-76e79f777a26/download
https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/277bad20-1fd8-477d-b68b-deb2c4b3d29e/download
https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/99ea79be-a072-4249-9253-7ff4875d44a6/download
bitstream.checksum.fl_str_mv f71bcbad96b1ce7c131430f230ade69b
8ad9a8a163879e50b3a7796c8dec5251
8f4c832662b173b06cf446bab8cddd57
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv DSpace at UIS
repository.mail.fl_str_mv noesis@uis.edu.co
_version_ 1814095243043143680
spelling Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)http://purl.org/coar/access_right/c_abf2Hernandez Torres, JorgeChomilier, JacquesJaimes Becerra, Adrián José2024-03-03T17:35:12Z20092024-03-03T17:35:12Z20092009https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/22601Universidad Industrial de SantanderUniversidad Industrial de Santanderhttps://noesis.uis.edu.coLa teoría endosimbiotica admite que los plastidios se originaron a partir de una bacteria fotosintética tragada por una célula eucariótica primitiva. En consecuencia, el genoma del cloroplasto permanece como una reminiscencia de este evento ancestral, aunque reducido en tamaño y número de genes. La mayoría de los genes en el plastidio fueron transferidos al genoma nuclear de la célula huésped y desde entonces, estos son codificados en el núcleo. Así, las proteínas del cloroplasto son sintetizadas en citósol con extensiones N-terminales llamadas péptidos transito y la maquinaria de importe fue requerida que apareciera en la evolución para transferir estas proteínas al estroma. Hasta ahora, dos complejos de proteínas han sido encontrado que median el proceso de importe: los translocones de la envoltura de la membrana Toc (externa) y Tic (interna). El origen evolutivo de muchas de las proteínas de los complejos Toc y tic han sido establecidos, pero esto no es aún el caso para la subunidad Tic110. Tic110 enlaza péptidos señal y sirve como un andamio molecular para el reclutamiento de componentes estromales. En este estudio después de un análisis de agregados hidrofóbicos (HCA) y reconocimiento de pliegue de las proteínas, nosotros concluimos que Tic110 esta compuesto de un seria de motifs repetidos relacionados a las repeticiones HEAT. La explicación para la presencia de tales repeticiones en Tic110 y su función más probable en el proceso de importe del cloroplasto es discutida.PregradoBiólogoThe endosymbiotic theory admits that plastids originated from a photosynthetic bacterium engulfed by a primitive eukaryotic cell. In consequence, the chloroplast genome remains as reminiscences of this ancestral event, although reduced in size and number of genes. Most part of the plastid genes were transferred to the host cell nuclear genome and since then, they are nuclear-encoded. Thus, chloroplast proteins are synthesized in the cytosol as precursors with Nterminal extensions called transit peptides and import machinery was required to appear in evolution to transfer those proteins to the stroma. Until the present time, two protein complexes have been found to mediate the import process: the Toc (outer) and Tic (inner) envelope membrane translocons. The evolutionary origin of many of Tic and Toc proteins have been established, but this is not yet the case for the Tic110 subunit. Tic110 binds signal peptides and serves as a scaffold for the recruitment of stromal components. In this study, after a keen analysis of hydrophobic clusters (HCA) and protein fold recognition, we concluded that Tic110 is composed of a series of repeated motifs related to HEATrepeats. The explanation for the presence of such repeats in Tic110 and its probable function in the chloroplast import process is discussed.application/pdfspaUniversidad Industrial de SantanderFacultad de CienciasBiologíaEscuela de BiologíaTic110HCARepetición HEATTranslocon del cloroplastoTransporte de membrana.Tic110; HCA; HEAT-repeat; chloroplast translocon; membrane transport.Tic110, involved in chloroplast protein translocation contains highly divergent heat like repeated motifs, as revealed by hydrophobic cluster analysisTic110, involved in chloroplast protein translocation, contains highly divergent HEAT-like repeated motifs, as revealed by Hydrophobic Cluster Analysis.Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregradohttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fhttp://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcceORIGINALCarta de autorización.pdfapplication/pdf46508https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/c3420991-40c3-4f31-b1b2-76e79f777a26/downloadf71bcbad96b1ce7c131430f230ade69bMD51Documento.pdfapplication/pdf695126https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/277bad20-1fd8-477d-b68b-deb2c4b3d29e/download8ad9a8a163879e50b3a7796c8dec5251MD52Nota de proyecto.pdfapplication/pdf388090https://noesis.uis.edu.co/bitstreams/99ea79be-a072-4249-9253-7ff4875d44a6/download8f4c832662b173b06cf446bab8cddd57MD5320.500.14071/22601oai:noesis.uis.edu.co:20.500.14071/226012024-03-03 12:35:12.468http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/open.accesshttps://noesis.uis.edu.coDSpace at UISnoesis@uis.edu.co